Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP1-66N13.3 Gene 0 38.16 0.69 0.88 2.03 12.16 0.33 1.62 1.54 2.11 0.60 3.48 0.08 3.25 0.13 0.03 2.37 2.15 0.06 0.64 0.55 0.00 0.00 0.00 2 420477 Transcript 0 2.61 0.00 0.39 0.75 0.18 0.00 0.13 0.00 0.18 0.23 0.21 0.00 0.93 0.13 0.00 0.49 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 416742 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 425021 Transcript 0 2.88 0.00 0.00 0.00 2.05 0.00 0.45 0.00 0.47 0.29 2.14 0.00 0.73 0.00 0.00 1.01 0.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 413348 Transcript 0 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 433094 Transcript 0 11.74 0.00 0.09 0.80 3.58 0.09 0.50 0.36 1.13 0.00 0.36 0.00 0.40 0.05 0.00 0.42 0.16 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 7 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E2a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 2.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER3b ExonRegion 0 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.77 0.00 0.00 0.00 0.00 2.20 1.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER4a ExonRegion 0 5.76 0.00 0.00 0.00 4.11 0.00 0.90 0.00 0.94 0.58 4.29 0.00 1.46 0.00 0.00 2.03 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER5a ExonRegion 0 11.17 0.00 0.00 0.00 3.97 1.51 0.66 0.43 0.00 0.00 4.24 0.00 0.64 0.22 0.00 1.47 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E5a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER6a ExonRegion 0 11.36 0.00 0.26 1.15 3.02 0.26 1.50 1.09 0.52 0.00 1.09 0.00 1.21 0.16 0.00 1.26 0.47 0.00 0.00 0.30 0.00 0.00 0.00 20 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 I6 Intron 0 17.31 0.00 0.00 0.56 5.19 0.00 2.76 0.00 0.77 0.47 2.95 0.00 1.07 0.00 0.00 0.41 2.29 0.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 I6_SR1 SilentIntronRegion 0 17.35 0.00 0.00 0.56 5.21 0.00 2.76 0.00 0.77 0.48 2.95 0.00 1.07 0.00 0.00 0.41 2.29 0.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E7_Aa NovelBoundary 0 28.08 0.00 0.00 1.37 16.72 0.00 2.12 0.00 1.62 3.01 2.47 0.00 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER7a ExonRegion 0 23.55 0.65 0.00 2.52 5.67 0.00 0.42 0.08 2.48 0.90 3.07 0.00 4.75 0.06 0.00 1.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E7_Da KnownBoundary 0 23.56 0.00 1.57 1.63 0.00 0.00 2.21 0.00 1.24 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E7a_E7b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E7a_E8a KnownJunction 0 23.86 0.00 0.00 1.27 7.72 0.00 0.00 0.00 2.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER7b ExonRegion 0 13.03 0.00 1.31 3.74 0.88 0.00 0.66 0.00 0.91 1.14 1.05 0.00 4.64 0.66 0.00 2.45 2.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E7_Ab NovelBoundary 0 16.97 0.00 3.13 3.36 4.16 0.00 0.00 2.38 0.00 1.67 2.21 0.00 14.45 0.00 0.00 0.00 4.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER7c ExonRegion 0 2.34 0.00 1.84 1.90 4.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.69 0.00 6.70 0.00 0.00 0.00 2.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER7d ExonRegion 0 5.49 0.71 0.32 1.74 5.27 0.00 0.92 0.45 1.27 0.30 2.73 0.00 4.47 0.00 0.00 2.57 2.85 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 32 E7c_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER8a ExonRegion 0 61.51 1.10 1.39 2.92 19.18 0.37 2.33 2.47 3.23 0.85 4.25 0.14 4.29 0.16 0.06 3.03 2.84 0.11 1.14 0.94 0.00 0.00 0.00 34 ER8b ExonRegion 0 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00