Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-465L10.2 Gene 0 1.59 0.97 2.20 4.16 1.95 0.63 1.36 4.86 5.07 4.66 0.40 0.49 0.16 0.58 2.10 0.14 1.05 4.31 5.51 5.13 0.10 0.71 0.33 2 372317 Transcript 0 1.41 0.28 0.67 1.76 0.94 0.33 0.99 1.81 1.55 1.51 0.08 1.56 0.62 0.89 1.71 0.26 0.16 2.28 2.49 1.85 0.38 0.41 0.35 3 419897 Transcript 0 1.97 0.54 1.40 0.90 0.00 0.00 0.35 0.92 4.65 1.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 0.26 1.47 4.13 6.49 2.65 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.31 0.42 0.00 0.07 0.39 0.04 0.48 0.00 0.62 0.40 0.18 0.00 0.00 0.00 0.48 0.00 0.00 1.05 3.63 0.06 0.00 0.00 0.00 5 E1_Ab KnownBoundary 0 3.48 17.69 2.99 12.22 32.00 15.79 9.76 4.15 9.55 5.59 14.58 0.00 0.00 0.00 5.19 0.00 0.00 22.05 35.77 5.24 0.00 0.00 0.00 6 ER1b ExonRegion 0 0.31 2.34 0.98 1.40 0.00 0.86 1.17 0.00 2.73 1.46 2.60 0.00 0.00 1.34 5.87 0.00 2.49 4.29 9.82 5.78 0.00 0.00 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 3.78 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.23 9.60 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER2a ExonRegion 0 0.15 1.08 1.58 1.80 0.00 0.00 0.71 1.83 4.84 3.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.53 2.93 4.02 3.39 5.29 0.00 0.00 0.00 10 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 3.09 10.23 8.66 3.99 0.00 6.49 7.89 8.01 3.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.50 0.00 14.18 4.42 5.75 0.00 0.00 0.00 11 ER3a ExonRegion 0 4.57 0.00 0.00 0.96 1.13 0.75 2.83 1.11 0.00 0.06 0.00 7.67 3.10 4.01 6.20 1.28 0.00 2.80 2.75 2.58 1.90 0.90 1.27 12 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 Ix Intron 0 6.21 0.92 3.30 5.04 10.26 0.00 3.29 4.65 3.74 5.40 0.00 0.80 0.00 0.00 1.58 0.67 1.49 7.46 13.66 4.80 0.00 0.47 1.33 14 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 6.26 0.93 3.33 5.09 10.36 0.00 3.32 4.69 3.76 5.45 0.00 0.81 0.00 0.00 1.59 0.68 1.50 7.52 13.78 4.84 0.00 0.47 1.31 15 E4_Aa NovelBoundary 0 2.82 3.35 0.00 9.16 21.39 0.00 3.93 14.58 9.46 17.73 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 4.58 3.48 17.98 18.54 0.00 9.12 0.00 16 ER4a ExonRegion 0 2.18 0.97 3.33 6.51 3.18 0.88 1.63 7.96 7.15 7.11 0.23 0.14 0.00 0.43 1.87 0.00 0.78 5.39 6.06 6.59 0.00 1.16 0.46