Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 WFDC3 Gene 0 0.31 1.28 0.61 0.85 0.95 3.57 0.67 1.02 1.97 0.75 0.28 0.66 0.57 0.72 1.30 0.75 0.41 1.02 0.93 0.85 1.29 0.22 1.17 2 481847 Transcript 0 0.05 0.54 0.08 0.04 0.06 0.24 0.06 0.06 0.36 0.00 0.00 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.83 0.00 0.14 0.10 0.00 0.13 3 467679 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 337230 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 445841 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 243938 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 421912 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 462017 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 487343 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 445639 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 493693 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12 471401 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 13 490877 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 465935 Transcript 0 0.75 2.74 0.26 1.66 1.52 4.94 1.41 1.27 1.91 0.48 0.41 1.73 1.92 1.32 3.11 1.68 0.94 1.17 1.93 1.61 0.62 0.59 2.29 15 337205 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 372630 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.86 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 17 372632 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18 339259 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 474942 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER1a ExonRegion 0 0.00 1.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E1_Ae KnownBoundary 0 0.00 3.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER1b ExonRegion 0 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 2.20 0.00 0.00 23 E1_Af KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.62 2.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.61 0.00 3.03 0.00 0.00 24 ER1c ExonRegion 0 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 8.07 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 2.20 0.00 0.00 25 E1_Ag KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER1d ExonRegion 0 0.00 2.03 0.00 0.00 0.89 9.78 2.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 2.20 0.00 0.00 27 E1_Ah KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.40 0.00 1.99 0.00 0.00 1.67 2.32 0.00 0.00 4.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 2.84 0.00 0.00 28 ER1e ExonRegion 0 0.00 2.03 0.00 0.00 2.68 11.00 2.79 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.68 2.14 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 2.55 0.00 0.00 29 ER1f ExonRegion 0 0.00 0.34 0.00 0.00 2.68 11.00 3.97 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 0.00 4.33 2.90 0.00 0.00 0.00 3.19 1.77 4.41 0.00 0.00 30 ER1g ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 11.00 3.97 0.49 0.00 0.00 1.93 0.00 0.00 4.87 3.32 0.00 0.00 0.00 3.19 2.13 6.30 0.00 0.00 31 ER1h ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.49 3.77 2.32 1.73 0.00 0.38 1.93 0.00 0.00 3.65 3.55 0.00 0.00 0.00 0.35 2.13 6.31 0.00 0.00 32 E1a_E3c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 E1a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 35 E1a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 36 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.86 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 38 ER3b ExonRegion 0 0.00 1.53 0.00 0.00 1.38 7.60 0.00 0.00 1.94 0.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.21 0.00 0.00 39 E3_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 3.12 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 40 ER3c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.00 0.00 1.07 2.94 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 41 E3_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.56 0.00 11.24 0.00 2.18 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 ER3d ExonRegion 0 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 3.67 0.00 1.73 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 E3a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 ER4a ExonRegion 0 0.00 6.17 0.00 0.45 0.00 5.37 1.16 3.37 2.41 0.18 0.00 0.00 0.00 1.12 0.00 1.28 0.00 1.34 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 46 E4_Ab KnownBoundary 0 0.00 8.02 0.00 0.00 0.00 2.67 0.00 7.64 5.18 0.00 0.00 0.00 0.00 4.83 0.00 4.36 0.00 2.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 ER4b ExonRegion 0 0.00 1.51 0.00 2.80 0.00 2.99 0.00 3.46 3.35 1.15 0.00 0.00 0.00 3.57 1.99 2.21 0.00 2.96 3.19 0.00 0.00 0.00 0.00 48 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 2.35 0.00 0.00 0.00 0.00 3.58 0.00 2.35 0.00 0.00 49 E4_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 ER4c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 4.09 0.00 1.83 0.00 2.02 2.47 1.15 0.00 0.00 0.00 1.62 2.90 0.00 0.00 1.85 3.19 0.00 0.00 0.00 0.00 51 E4_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 3.00 0.00 0.00 0.00 52 E4b_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53 E4b_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 E4b_E7b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 55 E4b_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 56 ER4d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 3.45 0.09 1.34 0.00 0.00 1.77 0.99 0.00 0.00 0.00 0.16 0.58 0.00 0.00 1.60 2.65 1.13 0.00 0.00 0.00 57 ER4e ExonRegion 0 0.75 2.74 0.26 1.66 1.52 4.94 1.41 1.27 1.91 0.48 0.41 1.73 1.92 1.32 3.11 1.68 0.94 1.17 1.93 1.61 0.62 0.59 2.29 58 E4_Dc NovelBoundary 0 4237.27 3758.01 4188.47 4491.00 3708.41 2733.94 4143.74 4563.04 4737.34 3809.13 1668.32 1097.76 1199.11 830.72 1297.98 3788.66 2840.20 6389.87 2604.69 4110.96 2141.33 1375.73 3223.14 59 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.71 0.00 0.00 1.31 1.91 0.00 0.89 1.22 0.00 1.34 0.00 0.00 1.33 0.71 0.40 0.00 0.92 0.00 0.74 2.20 0.00 0.00 60 E5a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 61 E5a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 62 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 63 E6a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 64 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 65 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.72 1.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 0.00 0.83 1.72 0.00 2.29 66 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 67 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 2.42 0.79 0.67 9.27 0.00 2.03 3.14 3.23 0.02 0.00 0.00 0.00 1.14 0.00 0.00 0.78 0.07 1.02 5.56 0.00 1.18 68 E8_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 6.80 1.80 4.33 16.13 0.00 2.51 6.80 7.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 2.62 5.56 0.00 3.84 69 ER8b ExonRegion 0 1.01 0.00 1.59 1.73 2.25 8.76 0.08 2.89 8.16 3.29 1.05 0.00 0.00 2.18 2.22 0.28 1.33 2.32 3.39 1.38 5.72 0.00 3.22 70 E8b_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 3.53 0.00 0.00 0.00 2.42 9.09 2.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.25 4.11 0.00 0.00 0.00 7.48 0.00 3.76 71 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 72 ER10a ExonRegion 0 0.28 0.00 2.56 2.48 0.59 0.94 2.35 3.26 6.09 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 5.88 0.95 3.70 0.00 0.00 1.03 0.00 0.85 73 E10_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.61 1.90 3.48 2.44 2.08 2.55 4.54 2.26 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 2.49 4.33 0.00 0.00 0.00 0.00 74 E10a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 75 ER10b ExonRegion 0 0.00 0.00 4.67 1.62 1.72 2.59 0.93 0.58 3.46 4.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.58 0.13 1.77 3.05 0.00 0.00 1.18 1.12 0.00 76 E10_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.43 4.33 2.16 0.00 0.00 1.56 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 77 ER10c ExonRegion 0 0.00 0.00 2.05 0.19 0.91 2.16 0.00 1.44 0.35 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 1.72 0.00 0.00 0.00 1.65 78 ER10d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 0.00 0.00 0.00 79 ER10e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.64 0.00 0.00 0.00 0.00 80 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 81 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 82 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 83 ER13a ExonRegion 0 0.23 0.88 0.40 0.22 0.29 1.19 0.29 0.28 1.79 0.00 0.00 0.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.69 0.48 0.00 0.64