Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP4-738P15.1 Gene 0 0.48 0.58 1.24 0.28 0.53 33.66 0.24 1.44 3.56 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.98 0.82 1.45 0.00 0.13 0.00 2 438287 Transcript 0 0.00 0.68 0.00 0.39 0.55 10.94 0.20 0.02 0.75 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.00 0.00 0.00 3 440357 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 454676 Transcript 0 0.16 0.21 0.52 0.10 0.20 20.87 0.09 2.36 2.37 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.38 0.48 0.62 0.00 0.04 0.00 5 426854 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.50 0.22 0.00 0.33 14.72 0.08 0.17 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.01 0.97 1.17 0.00 0.00 0.00 10 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER4a ExonRegion 0 0.00 2.45 0.73 0.00 1.07 26.28 0.53 0.94 4.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.35 0.00 5.13 0.00 0.00 0.00 13 E4_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.14 16.69 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.07 34.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E4b_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.99 27.43 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 19.87 0.00 0.48 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E5_Aa NovelBoundary 0 0.00 2.63 0.00 0.00 0.00 22.94 0.00 6.00 1.74 2.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 2.19 2.31 0.64 0.02 1.54 89.84 0.10 3.68 4.32 2.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.66 0.00 2.55 0.00 0.73 0.00 19 E5_Da KnownBoundary 0 0.00 2.50 0.00 0.00 0.00 10.28 0.00 0.00 0.00 2.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22.88 0.00 7.27 4.08 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E5_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.35 1.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER5b ExonRegion 0 1.41 4.07 0.00 1.36 0.00 26.90 1.32 1.73 0.00 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 23 ER5c ExonRegion 0 0.00 1.35 0.00 0.77 1.09 20.82 0.39 0.04 1.50 0.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.31 0.00 0.00 0.00 24 E5_Dc NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20.78 0.00 3.94 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.36 0.00 0.00 0.00 25 I5 Intron 0 0.00 0.76 0.46 0.76 0.00 19.48 0.00 1.94 2.76 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.60 0.00 0.00 0.00 26 I5_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.71 0.36 0.86 0.00 16.49 0.00 2.07 3.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.25 0.00 0.00 0.00 27 I5_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.85 0.60 0.63 0.00 24.09 0.00 1.76 2.16 0.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.00 0.00 0.00 28 ER6a ExonRegion 0 0.63 0.36 1.87 0.41 0.47 40.07 0.30 1.98 5.07 1.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.95 1.33 0.00 0.16 0.00