Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP5-1096J16.1 Gene 0 1.71 1.28 23.12 1.28 5.05 0.00 0.12 0.00 1.98 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 3.72 0.00 0.00 0.00 0.00 2 460400 Transcript 0 1.13 2.42 17.58 0.67 3.49 0.00 0.14 0.00 1.29 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 3 ER1a ExonRegion 0 1.37 1.69 23.72 1.31 6.18 0.00 0.00 0.00 1.49 0.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.44 5.66 0.00 0.00 0.00 0.00 4 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 13.01 1.86 0.00 0.00 0.00 0.00 2.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 8.49 20.14 0.00 3.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 Ix Intron 0 0.84 0.40 13.85 1.44 1.37 0.00 0.42 0.00 0.65 0.61 0.00 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.47 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 7 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.84 0.40 13.86 1.45 1.38 0.00 0.42 0.00 0.65 0.61 0.00 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.47 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 8 Ix Intron 0 0.46 0.58 12.95 0.88 2.11 0.00 0.45 0.00 1.01 0.49 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.16 0.07 0.15 0.00 0.00 0.10 0.00 9 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.52 0.59 16.23 1.27 1.65 0.00 0.45 0.00 1.89 0.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.79 0.00 0.00 0.00 0.00 10 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.95 0.30 21.02 0.58 3.20 0.00 1.24 0.00 1.27 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.68 0.65 25.95 0.65 1.58 0.00 0.07 0.00 2.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E2_Aa NovelBoundary 0 3.78 0.00 22.29 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 2.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER2a ExonRegion 0 2.18 1.95 20.48 0.06 3.70 0.00 0.68 0.00 1.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 34.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.53 19.38 1.05 2.08 0.00 0.00 0.00 2.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E3_Aa NovelBoundary 0 3.04 0.00 45.92 3.96 8.66 0.00 3.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER3a ExonRegion 0 2.12 0.00 23.57 2.00 3.57 0.00 0.00 0.00 3.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00