Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP5-968D22.3 Gene 0 0.06 0.00 0.00 0.00 1.78 0.20 30.66 0.07 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00 0.00 0.16 0.17 0.00 14.19 0.00 0.30 0.18 0.00 0.00 2 441851 Transcript 0 0.03 0.00 0.00 0.00 1.97 0.34 20.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.06 0.00 5.34 0.00 0.09 0.04 0.00 0.00 3 422548 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 IG31 Intergenic 0 0.37 0.12 0.20 0.20 11.34 0.24 61.29 0.48 0.07 0.07 0.04 0.08 0.03 0.03 0.02 0.10 0.04 36.01 0.19 0.38 0.03 0.04 0.08 5 IG31_SR7 SilentIntergenicRegion 0 0.33 0.18 0.27 0.20 16.23 0.29 62.63 0.47 0.06 0.06 0.00 0.06 0.00 0.00 0.03 0.10 0.03 27.75 0.21 0.33 0.02 0.00 0.12 6 IG31_AR8 ActiveIntergenicRegion 0 0.79 0.38 0.00 1.13 28.86 0.00 82.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.59 51.89 0.00 0.39 0.00 0.00 0.54 7 IG31_AR7 ActiveIntergenicRegion 0 1.14 0.64 0.00 0.00 15.84 0.00 69.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.03 60.33 0.00 0.92 0.00 0.00 0.94 8 IG31_SR6 SilentIntergenicRegion 0 0.83 0.00 0.00 0.19 11.33 0.50 60.71 0.24 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 41.62 0.29 0.71 0.00 0.00 0.00 9 IG31_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 0.52 0.00 0.73 0.74 19.14 0.68 94.88 1.18 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 0.37 0.00 24.92 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 10 IG31_SR5 SilentIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.17 0.12 7.46 0.00 51.24 0.12 0.13 0.43 0.24 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37.85 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 11 IG31_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.41 0.83 7.46 0.00 37.48 0.57 0.00 0.00 0.22 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 68.13 0.00 0.13 0.00 0.00 0.00 12 IG31_SR4 SilentIntergenicRegion 0 0.50 0.14 0.26 0.00 9.13 0.13 56.29 0.52 0.04 0.06 0.18 0.00 0.09 0.06 0.00 0.00 0.00 43.74 0.30 0.27 0.00 0.20 0.00 13 IG31_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 0.28 0.27 0.96 0.00 11.93 0.24 69.47 1.17 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43.25 0.84 0.28 0.00 0.00 0.00 14 IG31_SR3 SilentIntergenicRegion 0 0.15 0.14 0.25 0.21 7.22 0.38 51.67 0.89 0.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.21 0.00 49.58 0.44 0.44 0.00 0.00 0.00 15 IG31_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 1.08 0.26 0.00 0.12 7.53 0.24 51.59 0.00 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51.25 0.00 0.27 0.00 0.00 0.00 16 IG31_SR2 SilentIntergenicRegion 0 0.45 0.00 0.00 0.50 5.61 0.39 44.60 0.15 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33.16 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 17 IG31_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.14 7.70 0.19 65.75 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48.09 0.00 0.23 0.00 0.00 0.31 18 IG31_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.31 0.02 0.04 0.15 6.85 0.21 63.39 0.40 0.06 0.05 0.02 0.15 0.08 0.07 0.00 0.18 0.03 33.79 0.13 0.53 0.09 0.04 0.06 19 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 11.46 2.56 89.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42.82 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 21 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 I1 Intron 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.54 0.49 53.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29.70 0.84 0.85 0.00 0.00 0.00 23 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.56 0.49 54.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29.85 0.85 0.85 0.00 0.00 0.00 24 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.57 0.00 83.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20.81 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 25 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.71 1.25 18.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 75.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 I2 Intron 0 0.42 0.04 0.21 0.08 11.40 0.13 70.72 0.24 0.02 0.05 0.02 0.20 0.08 0.02 0.08 0.12 0.00 26.74 0.23 0.44 0.00 0.24 0.27 29 I2_SR1 SilentIntronRegion 0 0.42 0.04 0.21 0.08 11.41 0.13 70.75 0.24 0.02 0.05 0.02 0.20 0.08 0.02 0.08 0.12 0.00 26.75 0.23 0.44 0.00 0.24 0.27 30 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.57 0.00 120.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 12.38 1.30 67.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 E3_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 30.98 0.00 60.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 I3 Intron 0 0.59 0.00 0.20 0.04 11.42 0.81 69.31 0.10 0.31 0.00 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 24.22 0.24 0.31 0.00 0.12 0.16 35 I3_SR1 SilentIntronRegion 0 1.15 0.00 0.20 0.00 18.35 1.19 80.17 0.15 0.40 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30.94 0.00 0.92 0.00 0.34 0.16 36 I3_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 9.20 0.00 72.29 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 I3_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 10.52 0.00 139.37 1.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 I3_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 19.16 3.37 129.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 46.66 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 39 I3_SR2 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 12.14 4.41 33.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.75 0.00 59.71 0.00 0.00 0.00 0.00 1.31 40 I3_AR4 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 9.17 11.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 I3_AR5 ActiveIntronRegion 0 0.53 0.00 0.00 0.51 2.19 0.54 39.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 22.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 42 I3_SR3 SilentIntronRegion 0 0.26 0.00 0.44 0.00 7.88 0.11 59.59 0.00 0.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 0.00 17.12 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 43 I3_AR6 ActiveIntronRegion 0 0.21 0.00 0.00 0.00 9.76 0.61 67.75 0.00 0.00 0.00 0.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 0.00 15.69 0.42 0.00 0.00 0.00 0.00 44 I3_SR4 SilentIntronRegion 0 0.81 0.00 0.00 0.00 3.06 0.27 65.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 E4_Aa NovelBoundary 0 6.74 0.00 0.00 0.00 25.13 5.79 96.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.27 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 46 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 E4_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.83 0.00 22.67 0.00 68.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 7.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 49 I4 Intron 0 0.11 0.00 0.00 0.00 3.71 0.05 39.60 0.00 0.05 0.00 0.15 0.09 0.00 0.00 0.13 0.08 0.00 10.75 0.00 0.11 0.06 0.11 0.00 50 I4_SR1 SilentIntronRegion 0 0.11 0.00 0.00 0.00 3.73 0.05 39.85 0.00 0.05 0.00 0.16 0.10 0.00 0.00 0.13 0.08 0.00 10.82 0.00 0.11 0.06 0.11 0.00 51 E5_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 52 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.34 0.00 25.88 0.43 0.00 0.00 0.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18.74 0.00 0.36 0.37 0.00 0.00 53 E5_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 E5a_E5b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 55 ER5b ExonRegion 0 0.21 0.00 0.00 0.00 1.01 0.18 33.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.55 0.00 0.43 0.00 0.00 0.00 56 E5_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.74 0.00 82.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 ER5c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.68 0.00 43.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 58 E5_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 59 ER5d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.63 0.00 25.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.45 0.46 0.00 18.76 0.00 0.33 0.34 0.00 0.00 60 IG30 Intergenic 0 0.13 0.01 0.13 0.06 3.04 0.11 40.40 0.18 0.06 0.06 0.01 0.15 0.09 0.03 0.04 0.21 0.11 14.51 0.20 0.28 0.10 0.01 0.00 61 IG30_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.18 0.00 25.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26.73 0.70 0.70 0.48 0.00 0.00 62 IG30_SR3 SilentIntergenicRegion 0 0.05 0.00 0.14 0.03 2.02 0.07 40.24 0.23 0.04 0.00 0.03 0.20 0.00 0.01 0.03 0.09 0.10 13.68 0.19 0.22 0.10 0.00 0.00 63 IG30_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.26 0.00 0.00 0.00 4.91 0.00 48.40 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 0.00 0.00 0.00 0.36 0.40 23.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 64 IG30_SR2 SilentIntergenicRegion 0 0.13 0.00 0.22 0.00 3.48 0.23 36.07 0.00 0.23 0.21 0.00 0.00 0.00 0.13 0.18 0.73 0.03 23.81 0.20 0.39 0.00 0.00 0.00 65 IG30_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.21 0.37 0.41 5.55 0.56 57.44 0.00 0.37 0.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.59 29.25 0.00 0.31 0.22 0.00 0.00 66 IG30_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 2.23 0.00 2.35 0.00 45.62 0.00 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29.93 0.00 0.93 0.00 0.00 0.00 67 IG30_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.25 0.02 0.08 0.10 3.91 0.09 40.95 0.22 0.03 0.04 0.00 0.09 0.23 0.02 0.02 0.20 0.08 9.92 0.22 0.29 0.09 0.04 0.00