Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 CASQ2 Gene 0 11.55 0.89 5.45 1.71 2.21 4.41 0.58 0.86 13.12 0.33 0.00 0.56 0.60 0.09 0.25 0.10 0.00 0.37 0.06 0.00 0.23 6.62 0.88 2 446755 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 456138 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 261448 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 488931 Transcript 0 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.84 6.11 0.92 2.54 1.04 0.00 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 0.52 6 460136 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 8.75 0.66 3.03 1.84 2.89 1.78 0.19 0.00 8.75 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.00 0.00 6.04 0.95 9 E1a_E2a KnownJunction 0 20.15 0.00 1.71 2.03 0.00 0.00 2.08 0.00 9.55 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.25 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 18.70 0.14 7.14 0.77 1.48 1.10 1.07 0.98 8.31 0.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.10 0.00 11 E2a_E3a KnownJunction 0 27.86 0.00 11.06 0.00 8.32 0.00 2.12 4.52 12.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.63 0.00 12 E2a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER3a ExonRegion 0 16.05 2.96 3.41 1.00 1.46 0.33 0.64 1.78 12.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.23 1.48 14 E3a_E4a KnownJunction 0 16.67 0.00 4.41 0.00 0.00 2.78 2.21 0.00 10.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.12 0.00 15 ER4a ExonRegion 0 7.88 0.00 6.39 0.00 0.00 2.73 0.65 1.64 13.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.25 0.00 0.00 1.28 11.44 0.00 16 E4a_E5a KnownJunction 0 17.71 0.00 11.89 0.00 0.00 2.90 2.03 4.44 21.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.78 11.39 0.00 17 ER5a ExonRegion 0 9.57 0.00 9.09 0.00 0.00 2.67 0.41 1.66 17.39 1.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.70 7.03 0.00 18 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E5a_E8a KnownJunction 0 20.15 0.00 6.18 0.00 0.00 11.58 2.25 0.00 21.33 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.82 0.00 20 ER5b ExonRegion 0 12.37 0.00 8.44 0.00 0.00 5.64 1.07 0.00 17.24 2.29 0.00 0.83 0.18 0.06 0.22 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.89 0.11 21 ER6a ExonRegion 0 1.14 0.00 0.00 0.00 0.00 2.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.51 18.32 2.75 7.63 3.13 0.00 0.00 1.71 0.00 0.00 0.00 1.55 22 E6_Da NovelBoundary 0 1719.49 1571.23 4879.51 5023.47 1430.82 1206.58 2261.48 4916.44 4041.83 4156.65 949.50 355.92 325.95 280.12 502.01 1887.45 1363.72 4645.97 1063.75 1979.64 1089.07 766.09 1359.66 23 E6a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER8a ExonRegion 0 11.71 0.00 6.52 0.25 7.06 5.13 0.42 0.81 15.83 0.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.49 0.00 0.00 0.00 11.17 0.00 27 E8_Da KnownBoundary 0 14.60 0.00 3.13 0.00 3.82 4.32 0.00 2.55 9.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.71 0.00 28 E8a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E8_Db KnownBoundary 0 6.82 0.00 0.00 1.73 3.57 0.00 0.00 0.00 5.82 2.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 30 ER8b ExonRegion 0 12.70 0.00 6.13 1.36 5.35 5.50 0.00 1.73 18.22 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.33 0.00 31 ER8c ExonRegion 0 15.46 6.10 6.46 1.36 3.49 5.61 1.40 1.47 16.32 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.19 0.00 32 E8c_E9a KnownJunction 0 19.93 9.67 5.38 1.76 3.23 11.02 4.20 0.00 9.72 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.88 0.00 33 ER9a ExonRegion 0 14.95 2.39 5.57 1.69 0.41 5.02 1.93 0.00 11.95 1.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.49 0.00 34 E9a_E10a KnownJunction 0 20.15 0.00 3.28 2.06 0.00 6.47 0.00 0.00 14.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.63 0.00 35 ER10a ExonRegion 0 19.32 0.00 2.27 1.02 0.68 6.10 0.00 0.25 15.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.05 0.00 36 E10a_E11a KnownJunction 0 17.04 0.00 5.20 0.00 3.82 5.68 0.00 1.60 19.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18.98 0.00 37 ER11a ExonRegion 0 11.25 3.60 3.76 1.61 2.20 12.35 0.49 1.16 18.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.25 0.00 38 E11a_E12a KnownJunction 0 12.59 3.35 6.92 3.16 0.00 2.73 1.99 0.00 18.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 39 ER12a ExonRegion 0 8.86 1.93 5.77 1.25 0.18 5.40 0.25 0.69 15.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.50 5.11 3.52 40 E12a_E13a KnownJunction 0 10.15 0.00 12.09 2.06 0.00 8.46 0.00 2.51 23.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.23 7.77 41 ER13a ExonRegion 0 13.55 0.81 7.07 2.45 2.59 5.69 0.76 1.17 15.92 0.37 0.00 0.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 0.24 6.88 1.08