Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C1orf62 Gene 0 0.85 1.14 0.73 0.90 0.76 0.54 1.02 0.90 1.85 0.76 0.37 0.61 0.54 0.35 0.74 0.88 0.80 1.11 0.81 1.24 1.77 0.97 1.15 2 474186 Transcript 0 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.22 0.21 0.00 3 357393 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 370000 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 370001 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 472781 Transcript 0 1.09 1.13 0.72 1.00 1.21 0.76 1.69 1.11 1.32 1.02 0.68 0.60 0.97 0.65 1.35 1.72 1.29 1.70 1.25 2.14 0.82 0.34 1.45 7 369995 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 461774 Transcript 0 0.01 0.25 0.00 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.37 0.00 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.16 0.85 0.21 0.00 9 369994 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 477908 Transcript 0 0.27 0.53 1.15 0.30 0.00 0.27 0.39 0.00 1.70 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.00 2.30 0.61 0.86 11 466413 Transcript 0 0.78 0.37 0.00 1.12 1.47 1.35 0.45 0.00 1.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 2.43 0.04 0.54 12 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.62 0.00 13 E1a_E2d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E2_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER2c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER2d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.40 0.00 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.83 0.61 0.81 0.00 19 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.84 0.00 0.00 20 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.65 0.00 0.00 21 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER3b ExonRegion 0 0.21 0.10 0.18 0.30 0.00 0.00 0.00 0.25 0.79 0.17 0.00 0.00 0.19 0.00 0.00 0.00 0.64 0.40 0.00 0.00 0.65 0.10 0.29 23 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 27 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER6a ExonRegion 0 0.00 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 2.19 29 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E6a_E7b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.16 32 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.02 0.70 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 1.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.69 0.00 0.07 33 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.59 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.77 0.00 0.00 0.00 35 E8_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.33 0.00 0.00 0.00 0.00 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 E8a_E9b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 E8a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 ER8b ExonRegion 0 3.27 3.26 2.15 2.99 3.63 2.27 5.07 3.34 3.96 3.06 2.04 1.81 2.91 1.94 4.06 5.15 3.87 5.10 3.75 6.43 2.46 1.03 4.18 40 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 41 E9_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.60 0.00 0.00 0.00 0.00 3.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.94 0.00 42 ER9b ExonRegion 0 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 43 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 E9a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 E11_Aa NovelBoundary 0 16.37 2.50 2.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.16 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.06 0.00 0.00 6.05 0.00 4.01 48 ER11a ExonRegion 0 0.00 2.14 1.57 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 2.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.83 0.00 0.00 4.26 2.31 1.63 49 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 2.84 1.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.66 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 50 ER12a ExonRegion 0 0.00 2.61 1.19 2.78 0.00 0.00 0.00 0.00 1.84 0.00 0.00 3.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.21 0.00 1.11 5.17 0.47 1.23 51 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 3.35 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.07 0.00 0.00 6.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 3.50 52 ER13a ExonRegion 0 0.00 2.13 0.15 1.46 0.00 0.00 0.00 2.11 1.50 0.56 0.00 1.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.77 0.00 1.61 3.30 3.08 1.67 53 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 0.00 2.58 1.26 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.56 3.09 0.00 8.45 54 ER14a ExonRegion 0 0.00 2.43 0.00 0.25 0.00 0.00 0.00 0.03 1.33 0.30 0.00 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.89 5.08 3.70 1.14 55 E14_Da KnownBoundary 0 0.00 3.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.94 3.09 2.82 0.00 56 E14a_E14b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 E14a_E14c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 58 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 59 E14a_E16b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 60 ER14b ExonRegion 0 0.02 0.49 0.00 0.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.74 0.00 0.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 1.69 0.42 0.00 61 E14_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 62 E14_Ac KnownBoundary 0 3.78 0.00 0.00 1.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 63 ER14c ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 3.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.08 0.00 64 ER14d ExonRegion 0 0.53 0.00 0.00 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 1.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.40 0.00 0.00 0.80 0.44 0.00 65 E14_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.56 0.00 0.00 2.53 0.00 0.00 66 ER14e ExonRegion 0 1.16 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 0.43 1.14 0.00 67 ER14f ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 68 ER15a ExonRegion 0 1.25 1.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 2.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.44 0.00 1.62 69 E15_Ab KnownBoundary 0 3.78 3.35 0.00 1.90 0.00 0.00 0.00 0.00 3.30 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 4.35 70 ER15b ExonRegion 0 1.41 1.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 2.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 0.13 2.14 71 E15a_E16b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 72 E16_Aa NovelBoundary 0 3.48 3.29 0.00 0.00 0.00 7.84 4.06 0.00 2.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 1.99 0.00 0.00 9.14 0.00 4.35 73 ER16a ExonRegion 0 0.78 0.37 0.00 1.12 1.47 1.35 0.45 0.00 1.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 2.43 0.04 0.54 74 E16_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.52 0.00 4.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 75 ER16b ExonRegion 0 0.95 3.41 0.00 1.61 0.00 1.45 2.18 0.00 3.06 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.72 2.52 0.00 6.00 3.80 1.16 76 E16_Da KnownBoundary 0 2.82 2.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.53 0.00 0.00 77 E16a_E17a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.76 0.00 78 ER16c ExonRegion 0 0.54 1.05 0.97 0.60 0.00 0.54 0.78 0.00 3.41 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 0.00 4.60 1.22 1.72 79 E16b_E17a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 80 E17_Aa NovelBoundary 0 0.00 3.35 11.32 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.66 9.25 0.00 81 ER17a ExonRegion 0 0.67 1.82 2.21 0.64 1.19 0.23 0.84 2.99 4.29 1.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 3.11 4.87 1.87 82 E17_Da KnownBoundary 0 0.00 2.70 6.50 0.00 4.33 2.90 0.00 2.55 3.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.91 0.00 0.00 3.15 21.43 0.00 83 ER17b ExonRegion 0 1.39 1.42 2.13 0.00 0.36 0.24 0.00 1.88 1.88 1.47 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.73 2.20 0.00 84 ER17c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 85 ER17d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00