Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 GPR61 Gene 0 0.91 0.24 0.59 1.24 1.70 0.70 1.02 1.73 9.85 2.42 1.18 3.62 0.47 0.86 0.79 0.50 0.36 0.51 0.77 1.23 0.11 0.25 0.11 2 404129 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 286603 Transcript 0 0.18 0.08 0.17 0.33 0.71 0.28 0.46 0.46 3.55 0.60 0.48 1.38 0.00 0.10 0.17 0.28 0.06 0.14 0.12 0.30 0.00 0.07 0.00 4 469383 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 4.25 0.00 0.00 2.88 1.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.08 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.38 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.67 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.27 0.82 0.00 0.00 1.42 6.24 2.10 0.00 0.00 0.00 0.21 0.55 0.00 0.00 0.00 3.67 0.84 0.00 0.00 0.00 9 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 0.00 9.03 1.34 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 10 E2a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER2b ExonRegion 0 0.31 0.00 0.00 0.81 1.12 0.27 0.58 1.08 8.72 2.03 0.00 0.52 0.00 0.28 0.31 0.00 0.00 0.40 2.78 1.23 0.00 0.00 0.00 12 E2_Ab KnownBoundary 0 3.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.64 11.14 3.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.20 0.00 0.00 0.00 13 ER2c ExonRegion 0 0.19 0.00 0.44 0.61 0.24 0.50 0.28 1.57 9.66 2.93 0.35 0.22 0.00 0.13 0.27 0.00 0.00 0.61 0.00 1.39 0.00 0.06 0.18 14 E2b_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 0.00 0.88 2.95 0.87 0.12 2.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.19 0.00 0.00 0.00 16 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 2.55 6.13 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.43 0.00 0.00 0.00 17 E3a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER3b ExonRegion 0 0.49 0.93 0.00 0.23 0.64 0.94 1.81 1.92 10.52 2.85 0.87 4.21 0.00 0.00 0.00 0.34 0.00 0.32 0.37 1.49 0.51 0.53 0.00 19 E3_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 8.40 0.00 1.63 0.00 13.17 3.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER3c ExonRegion 0 0.54 0.23 0.51 0.98 2.13 0.85 1.37 1.37 10.64 1.79 1.44 4.15 0.00 0.29 0.52 0.85 0.19 0.42 0.36 0.89 0.00 0.21 0.00 21 E3_Ab KnownBoundary 0 3.78 0.00 4.52 2.06 0.00 0.00 0.00 2.18 9.17 1.61 7.53 0.00 6.17 2.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.88 0.00 0.00 0.00 22 ER3d ExonRegion 0 5.18 0.78 2.47 5.18 7.45 1.06 3.05 3.64 12.77 2.36 5.18 17.13 3.79 5.70 4.25 2.28 2.54 0.88 1.84 1.37 0.42 1.00 0.28 23 ER3e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 IG30 Intergenic 0 4.56 1.15 1.45 4.53 5.05 1.87 3.90 1.17 8.97 1.87 3.80 14.89 4.02 4.32 2.82 3.59 1.62 1.18 1.32 1.21 1.25 1.50 0.33 25 IG30_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 7.03 1.96 1.56 7.00 8.46 2.83 5.76 1.70 9.07 2.72 4.42 23.90 6.31 4.26 2.82 3.75 1.42 0.99 1.72 1.65 0.38 1.29 0.68 26 IG30_SR1 SilentIntergenicRegion 0 6.80 1.26 2.04 6.26 0.13 0.00 4.70 3.05 10.76 3.41 5.66 16.39 11.73 6.07 5.87 7.78 1.73 0.09 0.76 3.14 5.61 1.69 0.00