Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 TCTEX1D1 Gene 0 3.58 0.44 1.07 1.98 3.19 1.79 0.52 3.08 9.71 3.41 0.00 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 0.14 0.00 2.26 0.70 2 282670 Transcript 0 0.99 0.19 1.42 0.83 2.21 5.93 0.70 1.79 5.79 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.00 0.00 0.00 2.14 0.00 3 491611 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 489510 Transcript 0 2.29 0.00 0.21 1.37 8.58 0.07 0.42 2.77 8.64 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 0.37 0.00 0.67 0.00 5 IG1 Intergenic 0 1.99 15.78 8.34 18.32 60.98 94.11 22.14 73.73 76.45 57.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.97 1.91 6.79 0.22 14.09 5.77 6 IG1_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 1.68 19.06 10.12 31.53 76.33 143.30 33.42 99.91 124.29 96.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.04 2.15 12.05 0.00 21.06 6.71 7 IG1_SR1 SilentIntergenicRegion 0 3.16 24.01 10.51 22.22 88.11 129.47 30.61 96.98 91.02 69.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.36 2.07 8.26 0.37 19.04 7.16 8 IG1_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 2.87 16.84 16.94 25.15 78.44 103.51 23.45 117.88 122.09 83.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.17 5.34 8.33 0.00 17.46 11.55 9 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.43 5.30 0.00 0.00 1.84 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.08 0.00 10 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.65 15.73 0.00 0.00 6.31 1.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.76 0.00 11 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 3.35 0.00 0.00 2.68 0.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 12 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.64 0.00 0.64 4.24 0.76 1.29 4.68 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.10 0.00 2.19 1.23 14 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E2a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.24 0.00 4.33 2.90 2.03 4.07 7.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 5.33 0.00 16 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 2.30 0.00 2.12 4.25 1.93 3.74 7.24 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.20 0.00 1.04 0.00 2.88 0.00 21 E5a_E6b KnownJunction 0 0.00 0.00 3.13 0.00 0.00 14.48 0.00 0.00 2.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER5b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.83 2.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E6_Aa NovelBoundary 0 3.78 0.00 0.00 9.16 0.00 2.33 0.00 4.85 14.87 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.95 0.00 3.26 0.00 2.57 7.94 24 ER6a ExonRegion 0 2.29 0.00 0.21 1.37 8.58 0.07 0.42 2.77 8.64 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 0.37 0.00 0.67 0.00 25 E6_Ab KnownBoundary 0 7.48 0.00 1.45 3.63 3.23 0.00 4.42 3.78 12.88 2.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 2.63 0.00 26 ER6b ExonRegion 0 4.13 0.84 1.31 2.43 2.87 6.52 0.66 5.07 18.89 4.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 4.28 1.54 27 E6a_E7a KnownJunction 0 6.08 0.00 2.84 2.06 4.33 14.48 0.00 4.19 24.80 6.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.00 3.84 28 ER7a ExonRegion 0 6.67 0.36 1.13 1.74 4.75 1.60 0.12 4.80 12.15 5.02 0.00 0.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 3.48 2.29 29 E7_Da KnownBoundary 0 3.78 0.00 3.46 1.27 7.47 2.27 0.00 3.94 14.58 4.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.00 0.00 30 ER7b ExonRegion 0 3.95 0.75 1.32 3.31 3.06 1.05 0.77 3.10 11.26 4.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.00 0.00 2.15 0.00