Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-399E6.1 Gene 0 0.96 0.07 0.06 0.21 1.02 0.25 0.05 0.27 0.45 0.24 0.20 0.50 0.00 0.27 0.25 1.65 3.78 0.10 0.00 0.15 0.69 0.07 0.41 2 425554 Transcript 0 0.69 0.40 0.00 0.53 2.93 0.62 0.00 0.00 0.33 0.00 0.00 0.36 0.00 0.12 0.03 0.34 0.60 0.00 0.00 0.11 0.11 0.00 0.15 3 445073 Transcript 0 0.28 0.00 0.00 0.00 0.24 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 2.05 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 4 422305 Transcript 0 0.54 0.00 0.01 0.00 0.68 0.00 0.08 0.49 0.35 0.11 0.12 0.23 0.00 0.17 0.00 0.38 1.88 0.17 0.00 0.00 0.69 0.00 0.19 5 ER1a ExonRegion 0 0.53 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 1.79 0.00 0.62 0.17 1.49 1.66 0.00 0.00 0.53 0.55 0.00 0.74 6 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.02 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 1.33 0.69 0.00 0.00 1.05 1.79 2.22 3.78 0.00 0.00 0.83 0.00 0.00 0.00 8 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.54 2.25 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 16.92 3.55 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 9 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E1a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.57 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.95 13.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.67 12 ER2a ExonRegion 0 2.06 1.98 0.00 2.13 2.68 3.10 0.00 0.00 1.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 1.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E2_Ab KnownBoundary 0 3.33 2.96 0.00 3.80 6.79 11.30 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER2b ExonRegion 0 0.30 0.29 0.00 1.32 4.48 2.75 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 1.98 0.00 0.00 0.00 1.55 4.92 0.00 0.00 0.00 0.10 1.15 1.63 15 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 11.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER3a ExonRegion 0 1.61 0.00 0.03 0.00 2.04 0.00 0.25 1.47 1.05 0.33 0.37 0.68 0.00 0.51 0.00 1.13 5.65 0.52 0.00 0.00 2.06 0.00 0.56 18 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER4a ExonRegion 0 2.79 0.00 0.57 0.00 1.03 0.00 0.00 0.00 0.61 0.57 0.64 0.00 0.00 0.00 0.68 2.97 2.20 0.00 0.00 0.00 1.47 0.00 0.98 20 E4_Da NovelBoundary 0 20.82 66.11 8.34 1.56 11.63 0.00 1.81 3.70 1.42 1.64 5.11 0.00 6.82 0.00 6.30 0.00 0.00 2.03 4.05 0.00 0.00 0.00 3.41 21 ER4b ExonRegion 0 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER5a ExonRegion 0 0.56 0.00 0.00 0.00 0.47 0.00 0.00 0.00 0.16 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 1.60 4.10 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.00