Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 DIO1 Gene 0 4.41 0.89 1.45 2.28 3.23 3.97 5.66 4.94 9.24 2.02 1.06 3.51 2.23 1.68 1.56 4.65 1.63 3.28 1.66 1.46 2.36 2.06 9.02 2 322679 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 388876 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 361921 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.53 0.00 2.08 0.00 0.00 6 ER1b ExonRegion 0 2.85 0.00 0.54 1.84 0.40 2.46 1.89 2.69 7.45 0.76 0.29 2.24 3.37 0.20 2.14 0.89 0.00 0.82 0.45 0.01 1.86 2.80 8.69 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E2_Aa NovelBoundary 0 47.49 0.00 0.00 0.00 3.57 2.90 5.74 4.35 18.61 4.35 0.00 0.00 6.82 2.47 15.95 14.70 0.00 5.14 3.67 2.36 2.66 2.76 15.71 10 ER2a ExonRegion 0 10.48 0.00 2.59 2.16 0.95 4.05 2.34 0.91 9.01 1.21 0.00 2.53 3.03 0.47 3.32 3.16 0.00 0.90 3.32 2.23 1.61 3.75 9.52 11 E2_Da NovelBoundary 0 10.08 0.00 0.00 2.03 7.98 0.00 5.70 9.24 13.80 2.82 0.00 0.00 0.00 2.47 10.14 11.19 12.81 5.14 7.72 3.26 2.90 5.57 21.00 12 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 I2_AR1 ActiveIntronRegion 0 2.79 0.88 2.84 0.40 2.55 1.29 2.26 3.14 3.17 0.00 1.76 0.00 0.00 0.00 5.21 15.00 0.00 1.18 0.00 1.55 2.05 0.00 2.47 15 I2_SR1 SilentIntronRegion 0 11.17 1.59 1.69 1.37 5.29 2.40 4.71 5.01 6.54 2.86 1.14 2.59 2.15 0.76 3.27 4.41 4.60 3.95 3.55 0.70 2.52 2.90 9.52 16 E3_Aa NovelBoundary 0 2.96 0.00 3.67 10.69 3.23 0.00 2.25 7.85 11.89 8.86 0.00 5.40 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 5.37 0.00 30.13 17 ER3a ExonRegion 0 3.24 0.52 1.46 2.04 0.68 1.87 3.38 4.60 4.79 1.31 0.99 0.91 0.98 1.70 2.09 3.76 1.68 1.88 2.44 0.00 1.73 1.02 5.27 18 E3_Da NovelBoundary 0 10.82 0.00 1.27 7.66 0.00 0.00 2.16 4.64 7.93 1.26 0.00 0.00 0.00 4.94 4.45 7.95 4.21 3.32 4.52 0.00 2.41 2.51 8.71 19 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 I3 Intron 0 5.28 1.11 2.74 3.68 5.58 3.51 4.70 8.09 8.18 3.21 1.52 2.44 4.71 2.14 3.80 6.20 2.93 4.14 2.83 1.31 2.93 3.20 11.34 21 I3_AR2 ActiveIntronRegion 0 6.32 1.01 3.98 5.76 6.45 2.36 5.85 10.57 13.88 5.58 1.97 2.59 3.31 2.02 5.35 9.69 3.41 7.46 2.92 2.68 2.48 5.45 9.79 22 I3_SR2 SilentIntronRegion 0 3.94 1.40 2.86 2.51 5.69 4.05 2.63 5.27 4.32 1.83 0.74 2.26 3.35 2.47 3.84 3.99 1.52 3.19 2.57 0.79 2.74 1.44 11.35 23 I3_AR3 ActiveIntronRegion 0 5.35 0.61 2.85 4.65 6.63 5.73 6.51 11.30 9.01 3.26 2.80 2.52 9.96 2.37 4.16 5.96 2.97 2.73 3.34 0.88 4.69 4.06 16.93 24 E4_Aa NovelBoundary 0 10.45 0.00 7.92 6.36 6.79 12.89 0.00 3.90 13.83 3.33 4.63 6.30 6.82 4.71 0.00 0.00 0.00 4.48 0.00 0.00 8.59 2.33 15.37 25 ER4a ExonRegion 0 4.39 1.35 1.60 2.51 4.85 4.84 7.66 6.26 10.73 2.64 1.45 4.51 2.05 2.30 1.11 6.18 2.33 4.60 1.70 2.07 2.71 1.84 9.86 26 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER4c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00