Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 A3GALT2 Gene 0 0.11 0.00 1.18 0.10 1.47 6.22 0.73 3.86 2.20 1.62 0.10 0.00 0.00 0.27 0.00 0.00 0.00 0.55 0.00 0.64 0.22 0.31 1.32 2 330379 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 442999 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 Ix Intron 0 0.52 0.33 1.33 0.62 5.54 31.51 2.01 4.85 3.79 1.12 0.11 0.10 0.52 0.02 0.30 0.22 0.19 0.68 0.65 0.43 1.25 1.70 4.07 6 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.53 0.33 1.33 0.62 5.54 31.52 2.01 4.85 3.79 1.12 0.11 0.10 0.52 0.02 0.30 0.22 0.19 0.68 0.65 0.43 1.25 1.70 4.07 7 I1 Intron 0 1.08 0.52 3.37 0.52 4.53 33.47 1.29 9.37 5.66 2.01 0.00 0.37 0.40 0.00 0.00 0.30 0.00 1.60 1.14 0.44 1.02 2.24 6.17 8 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 1.09 0.52 3.38 0.52 4.54 33.53 1.29 9.39 5.67 2.02 0.00 0.37 0.40 0.00 0.00 0.31 0.00 1.60 1.15 0.44 1.02 2.25 6.18 9 E2_Aa NovelBoundary 0 6.82 0.00 0.00 3.83 3.40 33.16 4.06 2.26 6.42 3.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.51 0.70 6.50 7.77 0.00 3.13 3.09 3.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.26 1.78 11 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 36.29 1.68 12.03 7.03 3.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.40 4.05 0.00 3.03 3.12 11.52 12 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.83 2.06 0.00 0.00 0.00 4.39 3.47 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 I2 Intron 0 0.50 0.96 0.86 0.48 0.63 33.34 0.31 4.87 4.35 0.40 0.00 0.00 0.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.65 0.00 0.00 0.52 1.48 1.39 14 I2_SR1 SilentIntronRegion 0 0.50 0.97 0.87 0.48 0.64 33.65 0.32 4.91 4.39 0.41 0.00 0.00 0.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.00 0.00 0.53 1.49 1.40 15 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 18.17 0.00 6.37 6.42 1.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 0.00 3.12 3.84 16 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.25 0.50 1.52 6.32 2.75 8.24 6.93 0.56 0.00 0.00 0.00 1.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 0.00 17 E3_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 5.03 0.00 0.00 55.31 2.16 2.55 6.13 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.53 0.00 18 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 2.08 5.83 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 19 E4_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 6.53 1.40 3.99 31.35 1.85 4.81 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 0.00 3.76 20 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.90 0.00 0.99 24.98 1.14 4.15 3.71 1.84 0.71 0.00 0.00 0.78 0.00 0.00 0.00 1.95 0.00 0.00 0.81 0.45 0.00 21 E4_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.77 0.00 7.64 52.87 1.77 10.39 2.75 1.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.11 22 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 I4 Intron 0 0.45 0.65 3.43 1.44 3.51 26.52 2.63 10.77 5.68 3.64 0.00 0.00 0.27 0.32 0.39 0.11 0.23 1.40 0.00 0.75 1.33 2.07 4.37 24 I4_SR1 SilentIntronRegion 0 0.45 0.65 3.43 1.44 3.51 26.55 2.63 10.79 5.68 3.64 0.00 0.00 0.27 0.32 0.39 0.11 0.23 1.40 0.00 0.76 1.33 2.07 4.38 25 ER5a ExonRegion 0 0.16 0.00 1.35 0.00 0.99 2.46 0.49 3.44 1.25 1.53 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 0.42 0.00 0.95 0.16 0.15 1.74