Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 MATN1 Gene 0 0.66 0.32 0.85 0.81 0.68 1.93 0.31 1.23 1.75 0.57 0.47 0.20 0.04 0.52 0.43 0.23 0.26 0.38 0.42 0.14 1.85 0.81 1.33 2 373765 Transcript 0 0.32 0.04 0.34 0.44 0.20 0.59 0.24 0.50 0.42 0.18 0.44 0.04 0.00 0.85 0.45 0.60 0.20 0.41 0.31 0.04 1.15 0.64 0.32 3 477320 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 494561 Transcript 0 0.00 0.22 0.39 0.00 0.00 0.19 0.28 0.27 0.39 0.73 0.21 0.00 0.00 0.28 0.44 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 2.58 0.44 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.83 0.00 0.72 0.00 0.00 0.00 1.04 1.02 0.00 0.00 1.52 0.00 0.00 3.90 1.94 3.50 0.00 0.00 1.25 0.00 1.73 0.00 0.00 6 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 3.36 0.00 0.00 0.00 1.63 1.11 0.16 0.63 3.12 0.79 2.71 2.61 6.35 4.59 6.29 10.62 2.42 0.00 0.39 0.52 7.90 3.98 6.29 8 E2_Aa NovelBoundary 0 3.70 0.00 0.00 0.00 3.65 5.62 2.03 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 6.82 0.00 14.59 7.09 4.11 0.00 0.00 3.00 5.44 6.00 7.43 9 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.54 0.00 0.00 0.00 0.50 0.85 0.00 0.00 0.79 0.60 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.86 10 E2_Da NovelBoundary 0 23.93 0.00 3.02 3.60 7.56 0.00 2.16 4.11 3.94 5.80 2.68 0.00 6.49 14.54 9.77 3.33 8.79 0.00 4.80 0.00 30.21 3.12 4.35 11 E2a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 2.94 4.01 14 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 1.14 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.51 0.48 2.00 15 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER4a ExonRegion 0 0.86 1.65 0.00 0.36 0.00 1.12 0.00 1.04 0.69 0.00 0.02 0.00 1.56 0.48 0.37 1.20 0.00 1.09 1.29 0.00 1.78 1.69 5.99 17 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 2.90 0.00 0.00 1.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.54 1.33 0.48 2.65 0.00 0.00 1.69 1.59 3.12 0.00 0.00 0.58 2.26 0.79 0.00 0.35 0.00 0.00 1.27 0.56 3.14 19 E5_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.24 1.33 4.16 0.00 0.00 0.00 2.92 1.67 4.11 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 2.35 0.00 0.00 20 ER5b ExonRegion 0 0.99 0.56 0.83 1.05 0.42 1.30 0.00 2.25 3.31 2.02 1.45 1.39 0.00 0.27 1.36 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 2.93 0.97 2.75 21 E5_Da KnownBoundary 0 0.00 8.09 1.21 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 5.30 0.00 4.79 5.25 0.00 0.00 5.19 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER5c ExonRegion 0 0.92 3.02 0.69 1.65 1.17 1.25 0.27 0.99 5.48 0.74 0.28 0.26 0.00 1.14 0.67 0.00 0.00 0.71 0.00 0.09 1.45 0.00 2.26 23 E5b_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 3.80 2.22 3.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.09 0.00 3.33 24 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.77 0.00 2.80 0.67 1.07 1.89 0.57 0.47 1.19 0.00 0.89 0.00 0.00 1.10 0.92 0.00 0.64 8.08 1.29 4.11 25 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.34 0.00 0.00 0.00 0.00 2.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.44 0.00 8.28 26 ER7a ExonRegion 0 0.00 1.28 0.00 1.09 0.00 1.61 0.00 1.58 2.32 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 0.00 0.00 5.96 3.16 3.77 27 E7_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.84 0.00 0.00 28 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.95 0.00 0.00 2.53 2.76 0.00 29 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.22 0.39 0.00 0.00 0.19 0.28 0.27 0.39 0.73 0.21 0.00 0.00 0.28 0.44 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 2.58 0.44 0.00 30 ER8a ExonRegion 0 1.10 0.26 1.34 1.24 1.22 3.02 0.43 1.95 2.51 0.59 0.29 0.23 0.00 0.43 0.15 0.13 0.21 0.48 0.62 0.23 1.68 1.07 1.08