Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-261C10.4 Gene 0 1.33 0.47 1.69 2.09 1.42 0.97 1.80 0.51 0.37 1.02 0.32 2.83 2.70 1.86 3.53 1.57 0.98 0.06 1.58 1.69 0.29 0.76 1.65 2 437691 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.01 0.00 0.00 0.00 3 450226 Transcript 0 6.24 2.59 2.90 2.02 5.44 3.63 8.11 0.49 0.76 1.84 1.31 11.86 13.49 8.80 19.54 7.35 4.37 0.39 5.56 5.15 0.94 3.54 9.01 4 420830 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 436756 Transcript 0 0.00 0.09 0.00 0.09 0.22 0.00 0.11 0.00 0.00 0.00 0.08 0.45 0.46 0.37 0.52 0.00 0.14 0.00 0.13 0.18 0.18 0.09 0.12 6 IG20_SR3 SilentIntergenicRegion 0 1.09 0.00 2.12 0.66 1.38 0.94 0.88 0.75 0.00 3.89 0.72 0.00 2.51 20.79 26.81 6.36 1.70 0.07 1.87 0.26 3.01 2.15 0.00 7 IG20_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.76 1.47 0.45 0.25 2.14 0.99 0.45 1.26 0.17 1.63 0.22 0.92 2.11 7.69 16.16 3.57 2.50 0.90 2.88 0.72 1.46 0.66 1.32 8 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.02 0.00 0.00 0.00 9 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E2_Aa NovelBoundary 0 105.20 79.85 97.19 95.16 77.16 72.86 104.09 108.52 100.06 92.11 66.81 0.00 31.98 24.78 29.05 135.78 92.47 162.58 84.05 110.77 53.93 37.84 127.11 11 ER2a ExonRegion 0 17.54 7.78 3.40 0.00 15.22 9.35 23.58 0.00 1.16 3.27 3.67 34.09 39.92 25.78 58.61 20.80 12.63 1.18 16.25 13.56 2.81 10.63 26.21 12 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 12.23 7.30 5.13 8.66 2.78 13.43 5.09 4.63 10.91 0.00 6.30 0.00 2.35 0.00 4.27 0.00 4.44 21.65 0.00 0.00 0.00 3.76 13 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.05 0.00 1.53 0.00 0.57 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 12.74 2.13 0.00 1.79 0.00 15 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.03 0.00 0.00 0.00 0.00 1.46 0.00 0.00 0.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.16 4.93 0.00 4.17 0.00 16 E3_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.99 0.00 0.00 0.00 0.00 6.39 0.00 0.00 6.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 6.26 0.00 0.00 0.00 17 ER3c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.52 0.00 1.97 0.00 0.00 3.23 0.00 0.00 1.76 0.70 0.76 0.00 0.00 0.00 1.41 1.81 0.00 0.19 0.00 18 E3b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E3b_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER3d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.21 0.00 3.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.26 2.20 0.00 0.00 0.00 1.53 1.53 0.00 0.00 0.00 21 ER4a ExonRegion 0 1.02 0.00 1.83 4.20 0.00 0.88 0.96 1.19 0.28 0.65 0.00 2.57 0.00 0.21 0.00 1.43 0.75 0.00 0.00 0.82 0.00 0.00 0.00 22 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER4b ExonRegion 0 1.18 0.00 5.29 6.05 1.12 1.53 0.74 1.46 1.12 2.24 0.27 1.49 0.54 0.63 0.00 1.24 0.49 0.00 0.44 1.89 0.00 0.00 0.82 25 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.26 0.00 0.26 0.67 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 0.24 1.35 1.39 1.11 1.55 0.00 0.42 0.00 0.40 0.54 0.56 0.26 0.37