Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-438F14.2 Gene 0 0.41 0.16 0.00 0.00 0.31 0.00 0.10 0.59 0.00 0.00 41.55 6.27 22.36 9.62 2.18 9.68 21.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2 438623 Transcript 0 1.73 0.06 0.00 0.00 0.22 0.00 0.00 0.48 0.00 0.00 67.41 5.65 22.50 12.88 2.39 14.27 41.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 436515 Transcript 0 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 1.81 0.00 2.99 0.51 0.20 0.40 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.77 0.00 0.00 0.00 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 62.17 4.00 12.83 11.98 3.92 14.83 54.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.27 6.30 6.82 0.00 0.00 0.00 18.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 E1a_E2a KnownJunction 0 3.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 71.91 0.00 13.15 9.36 0.00 8.46 35.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 I1 Intron 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.11 3.07 16.04 3.70 0.49 6.06 11.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.18 3.09 16.13 3.73 0.50 6.10 11.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 I1 Intron 0 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.05 0.00 0.04 0.00 15.19 5.81 28.59 5.27 0.85 5.64 17.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.05 0.00 0.04 0.00 15.42 5.95 28.94 5.31 0.87 5.77 17.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 I1 Intron 0 0.16 0.04 0.00 0.00 0.05 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 16.51 6.71 32.78 4.17 0.85 6.26 16.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 I1_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.12 0.00 10.16 0.00 0.00 2.97 13.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 0.00 22.04 9.03 31.42 2.29 0.63 5.62 20.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 I1_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.00 1.22 34.12 1.32 0.00 1.02 1.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 I1_AR4 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19.13 5.92 25.94 7.74 2.14 7.39 16.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 I1_SR2 SilentIntronRegion 0 0.30 0.07 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.26 6.96 36.65 5.01 0.88 7.40 17.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E2_Aa NovelBoundary 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.21 0.00 40.26 14.83 0.00 3.93 41.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER2a ExonRegion 0 0.80 0.18 0.00 0.00 0.82 0.00 0.00 0.83 0.00 0.00 69.00 1.70 13.80 14.98 2.89 10.90 27.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E2a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER2b ExonRegion 0 0.79 0.17 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 1.44 0.00 0.00 68.16 12.96 41.51 17.31 3.24 19.54 34.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER2c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.48 0.00 0.00 28.47 14.24 38.70 6.80 2.19 8.88 18.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E2_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.21 0.00 19.97 11.60 11.00 4.10 21.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER2d ExonRegion 0 0.00 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 0.00 0.00 0.00 3.62 0.00 5.99 1.02 0.39 0.81 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 IG48_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.97 4.60 27.90 3.64 1.32 9.59 10.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00