Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 DISC1 Gene 0 9.76 1.74 11.03 7.85 10.41 10.94 6.03 5.36 10.23 4.19 0.08 0.65 0.75 0.65 1.74 3.23 7.39 2.35 6.94 4.43 4.80 8.06 5.75 2 317586 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 366633 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 295051 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 366636 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.00 1.03 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 366637 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 366638 Transcript 0 2.58 0.00 4.11 3.21 3.12 16.54 4.81 2.59 6.91 2.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.15 5.67 3.96 3.99 6.10 8.58 12.71 6.61 8 439617 Transcript 0 0.00 0.00 2.91 0.00 1.87 1.14 0.00 0.00 2.53 0.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.97 7.06 0.00 0.00 0.00 2.72 0.00 2.09 9 468399 Transcript 0 2.17 0.06 0.92 0.98 1.16 0.29 2.35 0.89 0.74 0.39 0.00 0.00 0.29 0.00 0.01 0.43 0.00 0.15 0.17 0.17 0.00 0.00 0.24 10 366632 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.22 0.09 1.20 0.00 0.00 0.00 0.00 11 422590 Transcript 0 0.90 0.64 2.34 1.20 0.45 0.00 0.34 1.04 3.60 0.30 0.00 0.00 0.33 0.04 0.17 0.00 0.28 0.00 1.08 1.08 0.09 1.56 0.25 12 427560 Transcript 0 0.22 0.00 0.95 0.84 0.28 0.57 1.78 0.27 0.57 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.92 0.00 0.00 0.66 0.44 0.23 0.00 0.00 13 ER1a ExonRegion 0 0.90 0.00 0.00 0.00 1.14 2.34 0.56 0.52 0.92 1.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 2.81 0.79 9.56 0.87 2.24 4.06 6.19 14 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 1.27 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.37 0.00 0.00 0.00 0.00 2.78 3.00 0.00 15 ER2a ExonRegion 0 1.17 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 1.46 0.00 0.00 0.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 0.00 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 0.00 0.89 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER4a ExonRegion 0 2.57 0.00 3.83 1.00 0.38 0.11 0.59 0.61 5.20 1.84 0.00 0.00 0.00 1.05 0.00 3.00 3.74 2.94 10.35 4.03 8.39 3.01 1.69 20 E4_Da KnownBoundary 0 5.78 0.00 9.99 3.36 3.90 2.16 0.00 1.60 8.01 4.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.02 11.13 4.60 35.77 2.49 14.89 5.51 3.33 21 E4a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER4b ExonRegion 0 0.36 0.00 8.25 2.12 2.47 1.62 3.08 0.59 8.29 2.10 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 1.21 14.52 6.44 10.04 2.97 5.85 2.24 8.02 23 E4_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 4.44 0.00 0.00 2.90 4.50 2.38 15.25 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.76 16.64 9.16 0.00 9.08 5.62 5.76 3.50 24 ER4c ExonRegion 0 4.65 0.13 7.10 2.37 1.61 4.60 3.07 2.52 11.48 2.63 0.00 0.00 0.51 0.54 0.88 2.89 12.12 6.31 5.88 7.45 9.47 3.99 7.00 25 E4b_E5a KnownJunction 0 3.78 0.00 9.49 2.06 0.00 5.39 1.94 1.93 9.78 7.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.35 8.42 12.68 4.42 8.63 18.72 7.78 13.06 26 E4b_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER5a ExonRegion 0 4.23 1.45 12.92 8.88 16.90 8.67 8.98 6.79 14.61 7.42 0.00 3.71 1.54 0.72 4.02 15.67 18.53 10.40 23.03 8.45 7.02 11.19 10.40 28 E5_Da KnownBoundary 0 3.78 0.00 3.19 0.00 3.57 0.00 6.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E5a_E7a KnownJunction 0 12.45 0.00 14.75 17.18 19.02 14.99 2.21 9.24 22.28 8.03 0.00 5.40 6.82 2.77 0.00 10.42 7.29 1.58 32.94 6.07 8.65 14.39 11.95 31 ER5b ExonRegion 0 5.33 0.17 2.25 2.93 3.47 0.88 5.59 2.68 2.21 0.68 0.00 0.00 0.88 0.00 0.03 0.48 0.00 0.44 0.51 0.51 0.00 0.00 0.71 32 E5_Db NovelBoundary 0 16.89 0.00 3.81 0.00 7.47 0.00 3.89 0.00 4.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 I5_AR7 ActiveIntronRegion 0 10.78 0.19 3.71 3.16 3.18 1.01 4.70 0.51 2.15 1.79 0.00 1.05 0.00 0.12 0.00 0.82 0.11 0.17 0.58 0.25 0.07 0.19 0.81 34 ER6a ExonRegion 0 3.44 0.41 0.49 2.01 2.30 1.16 2.02 0.51 1.53 0.79 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 0.49 1.43 0.37 1.97 0.64 0.51 0.14 0.89 35 ER7a ExonRegion 0 7.16 0.69 15.63 8.61 3.69 8.37 3.52 5.95 16.01 5.23 0.00 0.92 0.59 0.15 2.08 10.92 15.52 4.36 13.46 7.59 12.22 10.69 10.27 36 E7a_E8a KnownJunction 0 16.67 0.00 23.30 19.84 0.00 10.33 4.15 7.02 15.60 6.90 0.00 5.40 0.00 2.35 0.00 24.01 8.51 8.54 22.78 5.62 18.41 21.19 15.37 37 ER8a ExonRegion 0 6.45 0.00 12.81 5.54 2.55 7.14 5.09 2.33 7.89 7.72 0.00 0.53 1.52 1.42 0.00 8.60 13.97 1.21 11.91 6.74 10.07 8.99 7.64 38 E8a_E9a KnownJunction 0 3.56 0.00 7.69 1.27 7.05 7.72 6.32 0.00 7.49 12.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.19 12.90 2.57 27.11 5.75 3.03 5.08 22.79 39 ER9a ExonRegion 0 5.21 0.88 10.25 4.58 7.00 7.66 5.74 2.76 10.33 10.16 0.42 1.34 0.83 1.26 0.00 4.06 20.97 4.33 11.65 6.27 7.12 11.37 9.46 40 E9a_E10a KnownJunction 0 3.33 0.00 15.46 2.06 4.24 0.00 4.37 1.68 11.98 5.99 0.00 6.30 0.00 2.47 0.00 12.99 30.11 9.29 9.32 8.82 2.97 9.06 11.27 41 E10_Aa NovelBoundary 0 10.96 0.00 4.79 0.00 0.00 0.00 4.37 2.34 3.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 ER10a ExonRegion 0 5.00 0.00 11.85 2.40 14.69 10.20 7.44 0.41 11.32 2.98 0.00 1.57 0.00 3.25 1.58 5.67 35.23 6.58 4.58 6.81 6.77 4.51 10.04 43 E10a_E11a KnownJunction 0 6.82 0.00 8.84 5.13 12.22 0.00 10.20 1.68 14.55 2.31 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 6.92 27.21 5.14 13.93 0.00 9.27 5.94 0.00 44 ER11a ExonRegion 0 5.67 1.01 10.37 7.09 14.03 15.12 12.74 2.99 11.74 3.03 0.00 0.00 3.82 1.25 2.20 6.38 34.32 4.74 18.06 3.49 7.06 10.72 2.91 45 E11a_E12a KnownJunction 0 6.67 0.00 7.57 4.86 0.00 8.12 12.98 2.55 11.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.29 47.22 2.45 8.09 3.00 5.56 5.69 0.00 46 ER12a ExonRegion 0 5.32 0.16 6.57 3.94 5.54 16.60 5.65 2.75 14.08 2.51 0.00 0.96 0.84 1.69 1.11 4.25 27.37 5.67 12.44 6.29 6.17 5.89 3.99 47 E12_Da NovelBoundary 0 3.70 0.00 6.62 1.86 0.00 0.00 1.99 1.81 6.94 0.00 0.00 0.00 6.66 0.00 0.00 0.00 18.51 0.00 0.00 5.69 2.84 3.00 0.00 48 E12a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 49 E12a_E17a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.84 0.00 0.00 50 E12a_E18a KnownJunction 0 0.00 3.03 2.66 0.00 12.48 10.79 2.25 2.55 13.89 1.16 0.00 0.00 6.33 2.47 0.00 0.00 11.41 9.33 12.14 12.53 10.93 5.69 11.10 51 ER13a ExonRegion 0 0.44 0.00 1.89 1.69 0.55 1.14 3.57 0.53 1.14 0.00 0.00 0.00 1.60 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 1.32 0.88 0.46 0.00 0.00 52 E13a_E18a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53 ER14a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 ER15a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 55 ER16a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 56 I16_AR3 ActiveIntronRegion 0 12.90 0.56 4.17 3.24 4.82 1.02 2.48 1.78 1.40 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 1.44 2.52 0.64 3.31 0.59 0.15 0.00 1.42 57 I16_SR3 SilentIntronRegion 0 13.92 1.19 3.84 4.36 10.66 1.68 4.80 2.92 0.77 1.53 0.00 0.00 2.83 0.00 0.38 1.85 4.24 0.86 1.17 0.00 1.21 0.38 0.00 58 I16_AR4 ActiveIntronRegion 0 12.14 0.81 6.51 0.98 4.68 3.48 2.76 6.22 2.57 2.46 0.00 0.00 1.13 0.00 0.30 2.00 1.93 0.52 1.70 0.31 0.97 0.30 0.86 59 ER17a ExonRegion 0 3.77 0.00 0.00 0.61 0.00 0.54 1.05 0.00 2.08 3.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.00 4.72 1.26 0.46 0.00 3.48 60 ER17b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.00 1.03 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 61 ER18a ExonRegion 0 0.14 1.20 3.90 2.99 3.99 11.09 1.37 3.80 12.96 2.75 0.00 0.00 0.62 0.35 0.43 4.97 11.53 6.15 27.26 5.44 8.13 10.45 12.71 62 E18a_E19a KnownJunction 0 0.00 0.00 6.00 4.30 3.90 8.63 2.25 4.39 14.64 3.33 0.00 0.00 0.00 0.00 4.94 8.72 4.49 0.00 30.02 3.07 8.28 14.14 8.62 63 ER19a ExonRegion 0 3.57 0.52 6.12 3.11 4.38 12.54 2.43 3.62 11.23 2.22 0.00 0.91 0.00 0.34 1.02 3.17 11.86 5.18 12.42 3.64 10.76 9.10 8.96 64 E19_Da KnownBoundary 0 3.56 0.00 3.67 4.06 3.31 14.82 1.94 2.34 4.83 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 12.13 4.77 0.00 0.00 0.00 2.47 9.12 8.71 65 E19a_E20a KnownJunction 0 0.00 0.00 3.19 2.83 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 5.62 2.69 0.00 66 ER19b ExonRegion 0 2.93 0.00 6.91 2.73 0.55 7.19 1.32 5.19 5.23 2.71 0.00 0.00 0.00 0.50 4.31 7.62 2.12 0.00 2.37 0.00 3.79 8.17 8.73 67 E19_Db KnownBoundary 0 3.33 0.00 6.89 0.00 0.00 2.44 2.25 4.52 2.84 3.09 0.00 0.00 0.00 2.35 0.00 2.99 0.00 0.00 4.80 0.00 5.31 5.27 7.34 68 E19_Dc KnownBoundary 0 0.00 3.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.97 4.31 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 2.94 0.00 69 E19c_E20a KnownJunction 0 0.00 0.00 5.82 0.00 3.74 2.27 0.00 0.00 5.06 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.95 14.12 0.00 0.00 0.00 5.44 0.00 4.18 70 ER19c ExonRegion 0 1.41 1.13 6.49 0.45 1.29 1.83 1.23 4.87 6.77 3.23 0.00 0.00 0.00 3.19 0.11 4.62 7.95 0.00 2.60 0.00 7.18 4.09 6.96 71 ER19d ExonRegion 0 0.90 0.64 2.34 1.20 0.45 0.00 0.34 1.04 3.60 0.30 0.00 0.00 0.33 0.04 0.17 0.00 0.28 0.00 1.08 1.08 0.09 1.56 0.25 72 ER20a ExonRegion 0 2.49 0.00 5.79 4.19 3.17 15.63 2.32 2.11 11.66 2.73 0.00 3.08 0.00 1.20 0.00 4.21 9.99 2.46 2.92 5.45 9.32 8.02 6.27 73 E20a_E21a KnownJunction 0 3.04 0.00 4.55 3.70 0.00 16.58 4.33 1.73 7.64 2.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.36 8.04 4.23 4.80 6.52 8.34 15.00 7.34 74 E20b_E21b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 75 ER20b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 76 ER21a ExonRegion 0 2.12 0.00 3.68 2.73 6.24 16.50 5.30 3.46 6.18 2.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.94 3.30 3.70 3.19 5.67 8.81 10.42 5.87 77 ER21b ExonRegion 0 19.19 3.84 21.66 15.83 21.82 21.88 10.68 10.87 17.61 7.60 0.18 1.25 1.10 1.13 3.70 5.02 9.14 2.82 10.27 7.12 6.86 15.67 9.47 78 E21_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.67 3.76 0.00 14.48 3.89 2.42 1.79 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.74 0.00 79 ER21c ExonRegion 0 3.84 0.00 2.62 1.28 0.97 1.40 1.19 0.34 1.59 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.25 0.00 80 ER21d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00