Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-134P9.1 Gene 0 2.42 2.24 1.40 1.10 1.80 1.17 2.87 0.92 0.69 1.92 2.03 12.76 4.72 2.92 6.77 3.28 2.47 1.29 3.05 3.94 1.53 0.62 1.71 2 457348 Transcript 0 1.42 0.87 1.11 0.63 0.64 0.44 1.48 0.48 0.41 1.52 1.58 6.87 1.68 1.74 4.97 2.55 1.29 0.83 2.44 2.02 0.72 0.15 0.64 3 432511 Transcript 0 0.25 0.00 0.59 0.34 0.84 0.00 0.57 0.00 0.25 0.55 0.94 23.65 2.49 0.62 4.23 3.23 0.53 0.00 1.26 1.24 0.00 0.23 0.47 4 425698 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 ER1a ExonRegion 0 1.87 0.00 1.92 1.04 0.00 0.00 1.14 0.24 0.00 0.88 1.74 0.00 0.00 2.20 9.16 6.24 1.62 1.41 5.25 2.00 0.56 0.00 0.00 6 E1_Ab KnownBoundary 0 3.26 0.00 3.67 2.06 0.00 0.00 1.72 0.00 0.00 2.66 5.26 0.00 0.00 2.41 8.90 12.05 4.58 2.57 12.14 5.18 2.66 0.00 0.00 7 ER1b ExonRegion 0 0.60 0.00 1.69 0.75 0.04 0.00 0.05 1.24 0.48 2.45 3.18 15.84 0.00 1.42 4.68 3.59 1.26 0.34 3.58 2.65 0.41 0.00 0.00 8 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 2.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.58 2.58 13.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.13 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 4.45 4.19 0.00 0.00 0.00 2.36 0.00 0.00 0.00 10 ER1c ExonRegion 0 0.53 0.00 1.05 0.00 0.00 0.00 0.66 0.64 0.91 3.31 2.69 16.64 0.00 0.96 2.20 0.00 0.00 0.00 0.72 0.53 0.00 0.00 0.00 11 E1_Db NovelBoundary 0 3.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 2.68 39.16 0.00 0.00 0.00 8.46 3.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.19 12 E1b_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 I1 Intron 0 0.00 0.00 1.27 0.00 0.93 0.00 0.46 0.89 0.00 0.00 2.68 16.17 1.34 1.33 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 1.28 0.00 0.94 0.00 0.47 0.91 0.00 0.00 2.72 16.39 1.36 1.34 0.00 0.00 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E2_Aa NovelBoundary 0 3.70 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.63 56.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 4.35 16 ER2a ExonRegion 0 0.50 0.00 1.18 0.67 1.68 0.00 1.14 0.00 0.50 1.10 1.87 40.99 4.99 1.23 4.00 2.28 1.07 0.00 2.52 0.11 0.00 0.46 0.95 17 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 3.50 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 18 ER2b ExonRegion 0 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.53 0.94 0.00 38.50 0.00 0.00 6.42 2.97 0.00 0.00 3.19 2.13 0.00 1.19 0.00 19 ER3a ExonRegion 0 1.82 0.00 1.61 0.66 0.00 0.00 1.16 0.00 0.66 2.67 0.77 2.84 0.00 1.99 3.28 2.15 0.00 0.00 0.00 0.39 0.00 0.41 0.00 20 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 0.00 1.30 1.21 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 4.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.20 0.00 21 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.85 0.36 0.00 0.19 0.00 0.00 0.75 0.42 1.88 0.51 3.15 0.77 3.70 1.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.17 0.00 22 E3b_E4a KnownJunction 0 3.78 0.00 3.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 1.07 4.95 0.00 0.00 2.47 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER4a ExonRegion 0 1.48 0.00 1.07 0.00 1.02 0.59 0.50 1.96 0.41 1.19 3.14 8.92 0.00 1.33 1.02 1.09 0.00 0.00 0.00 0.81 0.00 2.38 0.00 24 E4_Da KnownBoundary 0 2.67 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 18.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER4b ExonRegion 0 3.27 3.48 1.47 1.47 2.56 1.76 4.11 1.05 0.75 1.89 1.87 10.85 6.74 3.81 8.52 3.97 3.55 1.92 3.80 5.56 2.31 0.61 2.57