Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	ELF3	Gene	0	1.92	1.50	1.41	1.24	1.78	1.27	2.08	1.39	1.33	1.07	2.54	1.09	5.48	15.25	38.79	1.08	10.49	1.35	1.60	2.25	0.94	2.33	3.85
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20	E1_Af	KnownBoundary	0	3.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.21	2.55	0.00	0.00	5.37	0.00	0.00	32.02	129.55	0.00	23.84	0.00	0.00	0.00	3.15	6.25	17.16
21	ER1d	ExonRegion	1	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.65	1.73	0.00	0.00	5.80	0.00	0.00	15.27	103.28	0.00	41.59	0.00	0.00	2.13	0.00	2.08	5.87
22	ER1e	ExonRegion	1	0.00	0.00	0.71	0.00	0.00	0.00	2.60	2.73	0.00	0.00	4.68	0.00	0.00	22.11	137.81	2.29	30.60	0.36	0.00	1.39	2.20	6.17	9.83
23	E1_Ag	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.83	0.00	0.00	0.00	0.00	2.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.54	4.45	8.54	4.77	4.52	0.00	3.26	0.00	6.06	10.76
24	ER1f	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.23	0.00	0.00	0.00	1.25	3.46	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	21.80	99.71	5.94	23.11	1.85	0.00	2.13	2.20	8.33	17.31
25	ER1g	ExonRegion	0	1.57	0.00	1.90	0.57	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	0.48	0.81	0.00	0.00	24.00	34.11	2.11	12.83	1.55	0.00	1.61	0.21	3.93	16.58
26	E1_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.57	3.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.07	0.00	3.12	0.00
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28	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	ER1h	ExonRegion	0	1.99	0.61	1.05	2.41	1.20	0.00	0.08	3.46	0.54	0.50	0.86	0.00	0.00	0.16	6.18	0.00	1.48	0.70	0.00	2.43	0.00	0.55	0.00
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33	E1_Ah	KnownBoundary	0	6.67	0.00	0.00	0.00	0.00	8.63	2.16	0.00	3.53	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	5.81	0.00	0.00	4.27	0.00	0.00	0.00	0.00	7.60
34	ER1j	ExonRegion	0	1.26	0.63	1.05	0.23	1.66	2.40	0.41	0.33	1.23	1.55	6.36	0.00	3.60	36.08	101.17	0.00	37.60	0.44	0.99	0.61	0.69	5.41	10.19
35	E1_Dc	KnownBoundary	0	2.74	0.00	1.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.90	0.00	0.00	6.53	17.68	0.00	6.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.16
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37	E1_Dd	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.29	0.00	0.00	0.00	0.00	4.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	E1d_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.69	2.06	0.00	0.00	0.00	2.55	0.00	1.34	4.79	0.00	0.00	38.14	81.34	0.00	43.01	0.00	0.00	0.00	0.00	3.12	12.12
39	ER1k	ExonRegion	0	2.12	0.00	2.45	1.36	0.00	0.00	1.10	1.73	0.21	2.87	8.38	0.00	0.00	37.08	87.52	0.00	41.81	0.00	0.00	0.00	0.00	3.47	11.75
40	ER1l	ExonRegion	0	3.61	2.24	0.91	1.02	3.22	2.20	3.84	1.29	1.29	1.85	0.97	5.39	6.96	4.93	13.47	3.28	2.64	1.56	2.87	1.71	1.32	1.04	3.83
41	E1_De	NovelBoundary	0	118.32	105.11	50.77	156.19	107.30	45.49	143.62	78.33	48.12	44.97	14.69	25.21	20.45	19.72	38.07	95.10	93.13	74.57	92.33	142.34	45.34	51.31	72.90
42	ER2a	ExonRegion	0	0.29	0.00	2.93	1.63	0.61	1.69	0.58	0.90	3.05	1.81	9.73	0.00	8.15	45.80	102.64	0.00	40.79	0.63	0.00	1.19	0.00	5.40	5.61
43	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.79	1.02	2.37	0.00	0.00	9.48	10.63	0.00	0.00	0.00	0.00	5.18	0.00	2.82	0.00
44	E2a_E2b	KnownJunction	0	3.78	0.00	0.00	4.10	0.00	0.00	0.00	0.00	4.08	0.00	13.42	0.00	13.64	38.38	100.75	0.00	42.73	0.00	0.00	0.00	0.00	5.88	7.94
45	ER2b	ExonRegion	0	0.03	0.00	1.68	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.86	0.05	1.09	0.00	0.40	4.02	8.21	0.00	3.26	0.57	0.98	1.03	0.00	3.33	1.84
46	E2_Ab	KnownBoundary	0	0.00	3.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.33	9.54	5.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.94	0.00
47	ER2c	ExonRegion	0	2.83	0.00	3.24	2.24	0.00	0.00	0.00	0.09	1.28	0.95	8.45	0.00	18.40	57.48	102.30	0.00	38.32	1.10	0.00	0.00	0.00	5.34	4.76
48	E2_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.47	0.00	0.00	3.65	2.16	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00
49	E2b_E2e	KnownJunction	0	0.00	0.00	3.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.32	0.00	12.99	53.56	78.37	0.00	39.27	0.00	0.00	0.00	0.00	2.76	4.35
50	E2_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.45	0.00	4.58	0.00	0.00	0.00	0.00	2.82	4.01
51	ER2d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.82	0.00	0.00	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.62	15.80	0.00	8.07	1.85	0.00	0.00	0.00	4.17	2.94
52	ER2e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.86	0.31	0.00	0.79	0.00	0.79	4.11	13.38	0.00	3.38	0.94	1.31	0.88	0.00	1.75	0.81
53	E2_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
54	E2_Dc	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.79	0.00	0.00	0.00	6.82	0.00	4.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.00	0.00
55	ER2f	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	9.38	1.62	2.90	0.00	6.60	0.00	0.00	0.00	0.00	2.08	0.00
56	ER2g	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.00	0.98	0.00	0.77	0.00	0.76	0.00	4.28	4.28	9.25	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.04
57	E2_Ae	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.68	0.00	0.00	4.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
58	ER2h	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.64	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	2.24	0.06	5.80	0.00	16.29	60.22	140.94	0.00	29.27	0.00	0.00	0.00	0.00	2.63	3.55
59	E2_Dd	KnownBoundary	1	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.59	0.00	2.26	0.00	12.66	35.67	243.40	0.00	36.09	2.57	0.00	0.00	0.00	2.88	12.46
60	E2d_E2f	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
61	ER2i	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	1.15	2.46	0.00	6.77	42.83	115.06	0.00	21.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89	5.75
62	E2e_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
63	E2e_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.39	0.00	0.00	0.00	0.00	45.68	80.47	0.00	38.43	0.00	0.00	0.00	0.00	3.12	4.01
64	ER2j	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.47	0.42	1.58	0.00	4.69	37.65	87.30	0.00	30.91	0.00	0.00	0.00	0.00	2.08	2.94
65	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	2.52	8.26	0.00	2.07	1.04	0.00	0.00	0.00	0.02	0.77
66	E3_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.47	14.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.35
67	ER3b	ExonRegion	0	3.84	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.98	0.36	4.79	0.00	5.18	49.26	98.58	0.00	35.76	0.00	0.00	0.00	0.00	2.52	4.34
68	E3_Da	KnownBoundary	0	9.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	7.84	0.00	12.99	54.27	114.22	0.00	40.02	0.00	0.00	0.00	0.00	3.00	3.24
69	ER3c	ExonRegion	0	0.77	1.54	0.00	2.59	0.00	0.27	2.94	0.08	1.51	1.51	8.72	0.00	17.73	80.06	114.28	0.00	22.95	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	7.66
70	E3b_E4a	KnownJunction	0	0.00	3.35	0.00	4.13	0.00	0.00	5.83	0.00	3.07	1.37	5.37	0.00	26.30	96.71	135.73	0.00	23.09	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	7.68
71	ER4a	ExonRegion	0	0.93	2.03	0.00	3.83	1.67	1.83	3.48	1.73	4.71	2.29	5.32	0.00	16.42	71.66	140.71	0.00	24.34	0.00	0.00	0.00	0.00	8.33	4.96
72	ER4b	ExonRegion	0	3.49	0.11	0.00	4.45	1.55	0.75	0.48	1.41	3.39	1.23	5.23	0.00	13.28	67.39	130.68	0.00	41.24	1.72	0.00	0.21	1.12	6.43	7.53
73	E4_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	3.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	2.47	0.00	0.00	43.56	66.88	0.00	21.88	4.64	0.00	0.00	2.84	5.57	0.00
74	E4d_E5b	KnownJunction	0	3.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.33	0.00	1.74	1.40	12.27	0.00	6.49	51.50	149.82	0.00	35.44	0.00	0.00	2.88	0.00	0.00	8.45
75	ER4c	ExonRegion	0	2.12	0.00	0.00	2.21	0.00	0.00	2.65	0.00	1.08	1.15	5.07	0.00	23.45	74.71	112.79	0.00	37.14	3.70	0.00	2.13	2.20	6.25	4.40
76	ER4d	ExonRegion	0	3.66	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00	2.65	0.00	1.24	1.15	9.23	0.00	19.83	63.86	135.96	0.00	36.91	3.44	0.00	2.51	0.70	3.98	8.54
77	ER5a	ExonRegion	0	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.40	0.02	0.02	0.19	0.00	0.36	3.00	10.38	0.00	0.57	0.53	0.00	0.08	0.00	0.04	0.11
78	E5_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.63	0.00	0.00	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.47	4.45	0.00	0.00	1.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
79	ER5b	ExonRegion	0	1.83	0.27	1.89	2.54	4.20	0.00	0.23	3.05	2.50	2.08	7.16	0.00	21.74	62.42	145.11	0.00	19.31	1.71	0.00	1.94	0.58	5.45	6.52
80	E5a_E6a	KnownJunction	0	9.26	3.03	3.67	7.16	0.00	0.00	0.00	2.26	1.79	2.90	8.05	0.00	6.82	79.11	141.54	0.00	17.86	4.68	0.00	9.14	0.00	2.51	4.35
81	ER6a	ExonRegion	0	4.96	1.84	3.59	2.77	1.40	0.48	0.81	3.61	2.15	1.83	7.89	1.24	14.73	59.98	169.35	0.00	34.16	0.91	0.00	2.10	1.01	7.13	7.21
82	E6_Da	KnownBoundary	0	6.67	0.00	3.84	5.63	0.00	0.00	0.00	5.13	0.00	1.48	5.05	0.00	0.00	34.20	113.98	0.00	8.88	0.00	0.00	2.88	5.56	8.39	7.68
83	ER6b	ExonRegion	0	1.76	0.05	1.99	2.91	2.61	0.45	0.32	1.22	1.29	1.44	5.03	0.00	8.84	26.74	80.92	0.00	19.62	0.00	0.00	1.21	2.54	11.40	10.57
84	E6_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	0.00	2.09	0.00	0.00	0.00	0.00	13.64	0.00	18.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.53	0.00
85	E6_Dc	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.94	8.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
86	ER6c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.73	0.00	0.00	0.00	1.73	2.47	1.15	0.00	0.00	9.38	4.06	11.61	0.00	3.30	0.00	0.00	0.00	0.00	2.78	5.87
87	ER6d	ExonRegion	0	0.18	0.44	0.16	0.31	0.23	0.79	0.17	0.80	0.16	0.13	0.92	0.00	3.86	3.12	8.16	0.26	1.84	0.48	0.00	0.46	0.00	0.81	0.81