Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-74N20.1 Gene 0 4.05 3.43 1.33 0.42 2.92 2.17 3.47 0.94 1.09 0.82 2.95 5.11 1.84 3.79 3.05 3.52 2.86 2.24 5.88 7.31 3.26 1.80 4.22 2 421703 Transcript 0 1.87 1.58 0.86 0.16 1.52 1.01 1.56 0.79 0.77 0.48 1.87 1.53 0.77 2.03 1.79 1.53 1.60 1.39 3.02 3.48 1.42 0.92 1.88 3 432837 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 IG48 Intergenic 0 0.68 0.65 4.11 2.12 0.86 2.95 2.55 4.14 8.43 6.73 22.51 4.21 6.40 17.39 9.29 9.07 9.80 13.28 13.56 27.34 9.20 5.52 10.14 5 IG48_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 0.68 0.66 4.12 2.13 0.86 2.95 2.56 4.15 8.45 6.75 22.58 4.23 6.42 17.45 9.32 9.10 9.83 13.32 13.60 27.42 9.23 5.54 10.17 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 2.18 0.00 0.00 0.00 0.00 2.88 1.72 0.00 5.15 0.00 0.00 3.79 2.90 0.00 2.02 2.87 3.19 1.89 0.00 1.16 0.00 7 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 8.90 0.36 0.00 0.00 1.53 6.43 6.85 3.04 24.58 4.33 0.00 19.35 3.60 4.85 5.38 11.17 22.71 21.00 9.29 7.43 8.24 8 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 16.00 1.43 0.00 0.00 3.97 12.98 12.07 6.88 18.48 13.95 0.00 28.90 0.00 7.52 4.02 19.23 43.39 37.58 17.54 11.02 16.30 9 E1a_E1c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER1c ExonRegion 0 1.16 0.37 2.02 0.67 0.81 1.22 1.36 1.37 2.00 1.70 4.06 3.84 1.87 5.18 2.94 1.72 1.66 2.67 4.29 6.29 2.30 1.84 2.40 11 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 2.00 0.00 0.00 0.00 2.55 1.74 0.00 5.37 27.16 0.00 4.89 0.00 3.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.85 0.75 1.16 0.00 0.00 1.64 0.60 0.28 0.00 1.33 20.94 1.73 1.57 2.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1_Db NovelBoundary 0 0.00 3.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.54 0.00 4.79 19.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E1b_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.42 19.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER2a ExonRegion 0 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 2.98 8.94 2.28 3.18 2.67 3.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 16 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 1.79 1.64 7.53 18.01 0.00 0.00 4.45 0.00 8.60 0.00 3.95 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 3.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 18 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 0.81 0.00 0.00 4.33 0.00 1.22 1.17 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 19 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E3a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.28 0.00 0.00 0.00 0.80 1.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E4_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 8.66 0.00 0.00 0.00 0.00 2.79 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.58 0.00 0.00 0.00 1.10 0.63 0.00 0.00 0.00 0.80 0.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER4c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER5a ExonRegion 0 10.04 9.14 0.94 0.26 7.03 4.82 7.98 0.50 0.12 0.11 1.98 5.33 2.73 3.19 4.27 7.44 5.94 2.78 10.63 12.69 6.22 2.54 8.87