Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	LHX9	Gene	0	10.85	0.28	0.00	0.04	0.11	0.00	0.25	0.00	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.88	0.74	9.60	0.00	0.02	0.00
2	475727	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	367391	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
4	367390	Transcript	0	11.15	0.31	0.00	0.04	0.16	0.00	0.14	0.00	0.04	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.68	0.19	6.99	0.00	0.04	0.00
5	367388	Transcript	0	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47	0.07	0.41	0.00	0.00	0.00
6	442438	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
7	337020	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
8	367387	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
9	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER1b	ExonRegion	0	1.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00
11	ER1c	ExonRegion	0	2.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.59	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E1a_E3e	KnownJunction	0	3.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.36	0.00	0.00	0.00
14	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E2a_E3e	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER3a	ExonRegion	0	2.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER3b	ExonRegion	0	2.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	E3_Ad	KnownBoundary	0	51.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.85	3.58	28.19	0.00	0.00	0.00
19	ER3c	ExonRegion	0	17.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.74	1.02	12.26	0.00	0.00	0.00
20	ER3d	ExonRegion	0	9.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.06	6.95	14.79	0.00	0.00	0.00
21	E3_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	12.68	4.24	24.16	0.00	0.00	0.00
22	E3a_E3e	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER3e	ExonRegion	0	4.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.40	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.57	2.28	17.73	0.00	0.00	0.00
24	E3_Ae	KnownBoundary	0	13.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	20.02	0.00	18.15	0.00	0.00	0.00
25	ER3f	ExonRegion	0	3.92	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.93	0.00	19.39	0.00	0.00	0.00
26	E3_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	12.73	0.00	24.03	0.00	0.00	0.00
27	ER3g	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.41	0.00	22.12	0.00	0.00	0.00
28	E3c_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E3c_E5a	KnownJunction	0	3.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	11.65	0.00	23.71	0.00	0.00	0.00
30	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00
31	E4_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.52	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER4b	ExonRegion	0	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.95	0.14	0.82	0.00	0.00	0.00
33	ER5a	ExonRegion	0	2.19	0.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	16.48	1.60	18.52	0.00	0.00	0.00
34	E5a_E6a	KnownJunction	0	18.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	29.60	0.00	14.13	0.00	0.00	0.00
35	ER6a	ExonRegion	0	5.97	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.34	1.06	21.55	0.00	0.00	0.00
36	E6a_E7a	KnownJunction	0	27.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	16.58	4.42	21.92	0.00	0.00	0.00
37	ER7a	ExonRegion	0	24.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	19.29	7.06	29.42	0.00	0.00	0.00
38	E7a_E8a	KnownJunction	0	3.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.44	4.80	9.08	0.00	0.00	0.00
39	E7a_E8b	KnownJunction	0	8.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.68	17.98	21.22	0.00	0.00	0.00
40	E8_Aa	NovelBoundary	0	11.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.43	0.00	0.00	0.00
41	ER8a	ExonRegion	0	8.35	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.00	0.96	9.11	0.00	0.00	0.00
42	E8_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.94	0.00	0.00	0.00
43	ER8b	ExonRegion	0	8.29	0.39	0.00	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.07	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.07	5.99	0.00	0.08	0.00
44	E8_Ab	KnownBoundary	0	12.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.34	14.96	0.00	0.00	0.00
45	ER8c	ExonRegion	0	25.53	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.10	0.78	15.68	0.00	0.00	0.00
46	E8_Db	KnownBoundary	0	16.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	14.96	0.00	0.00	0.00
47	ER8d	ExonRegion	0	10.50	0.37	0.00	0.37	0.49	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35	1.69	11.92	0.00	0.00	0.00
48	E8_Dc	KnownBoundary	0	6.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.48	11.51	0.00	0.00	0.00
49	ER8e	ExonRegion	0	14.01	0.24	0.00	0.08	0.21	0.00	0.16	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.32	7.98	0.00	0.00	0.00