Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	CA6	Gene	0	3.49	1.72	0.20	1.45	6.34	1.31	2.90	1.34	0.36	0.37	0.92	2.11	2.09	1.56	2.70	1.68	1.87	0.18	1.25	2.26	1.58	0.72	2.17
2	319474	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
3	377436	Transcript	0	1.10	0.00	0.94	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	413627	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
5	377442	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	475703	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	476083	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	480186	Transcript	0	2.98	3.55	0.25	0.59	4.33	2.71	4.57	0.66	0.37	0.23	1.91	4.37	4.31	3.22	5.57	3.46	3.86	0.37	2.57	4.68	3.26	1.49	4.48
9	377443	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	2.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER1c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER1d	ExonRegion	0	0.08	0.00	0.73	2.18	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E1a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E1a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER2a	ExonRegion	0	1.53	0.00	0.18	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E2a_E5a	KnownJunction	0	9.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER3a	ExonRegion	0	0.77	0.00	0.00	0.74	3.89	0.00	0.96	1.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E3_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	ER3b	ExonRegion	0	8.56	10.66	0.74	1.37	9.73	8.13	13.71	1.45	0.74	0.69	5.72	13.10	12.92	9.65	16.72	10.39	11.57	1.12	7.72	14.03	9.78	4.46	13.45
23	E3_Db	NovelBoundary	0	244.41	278.04	147.95	173.30	155.77	140.09	247.84	122.28	123.70	133.69	65.17	210.52	211.67	132.56	243.65	206.70	122.49	181.65	160.85	185.62	93.28	55.29	163.13
24	E3b_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E4_Aa	NovelBoundary	0	49.12	117.81	152.36	113.31	51.27	120.33	115.13	136.32	114.12	123.91	68.81	39.16	39.28	32.61	39.31	121.34	85.55	167.26	82.07	104.25	104.84	77.09	113.28
26	ER4a	ExonRegion	0	0.40	0.00	0.00	0.41	3.26	0.00	0.00	0.52	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER5a	ExonRegion	0	4.41	0.00	0.00	1.80	2.70	0.00	0.00	1.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E5_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	1.40	12.39	0.00	0.00	2.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E5a_E8b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER5b	ExonRegion	0	1.32	0.00	0.00	1.74	6.29	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	E5b_E6a	KnownJunction	0	3.78	0.00	0.00	2.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E6_Aa	NovelBoundary	0	43.04	0.00	0.00	1.43	89.05	2.78	8.61	15.57	5.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER6a	ExonRegion	0	2.84	0.00	0.00	3.74	15.45	0.00	3.63	4.16	0.00	0.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	E6_Da	NovelBoundary	0	48.60	0.00	0.00	7.13	59.68	0.00	24.02	20.66	1.39	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	6.29	12.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	I6	Intron	0	9.42	0.00	0.00	3.53	26.13	0.60	4.67	10.06	0.50	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	I6_SR1	SilentIntronRegion	0	5.63	0.00	0.00	4.20	30.84	0.81	3.71	13.71	0.82	0.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	I6_AR1	ActiveIntronRegion	0	11.67	0.00	0.00	3.15	23.51	0.47	5.25	7.99	0.32	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	E7_Aa	NovelBoundary	0	14.82	0.00	1.60	10.79	41.43	0.00	17.36	15.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	ER7a	ExonRegion	0	5.71	0.00	0.00	3.50	13.88	0.00	0.06	0.10	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
41	E7_Da	NovelBoundary	0	7.41	0.00	0.00	5.43	20.03	0.00	8.57	8.79	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
42	E7a_E8a	KnownJunction	0	3.78	0.00	0.00	1.76	11.71	0.00	0.00	0.00	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	I7	Intron	0	10.91	0.00	0.00	2.16	20.19	0.61	5.28	5.14	0.24	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	I7_SR1	SilentIntronRegion	0	11.36	0.00	0.00	1.41	22.66	0.59	5.88	4.89	0.34	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	E8_Aa	NovelBoundary	0	17.48	0.00	0.00	4.03	33.36	0.00	8.17	1.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
46	ER8a	ExonRegion	0	9.56	0.00	0.00	4.06	17.91	0.00	2.98	4.46	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
47	E8_Ab	KnownBoundary	0	21.93	0.00	0.00	1.66	26.83	0.00	0.00	3.90	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
48	ER8b	ExonRegion	0	10.29	0.00	0.00	1.49	21.28	0.00	1.78	0.43	0.00	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
49	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	1.93	8.23	0.00	0.00	0.00	0.00	3.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	I8	Intron	0	8.11	0.00	0.00	1.33	19.74	0.86	5.19	3.13	0.17	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
51	I8_SR1	SilentIntronRegion	0	8.14	0.00	0.00	1.33	19.82	0.86	5.21	3.14	0.17	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
52	E9_Aa	NovelBoundary	0	10.45	0.00	1.83	1.40	59.85	2.38	14.84	4.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
53	ER9a	ExonRegion	0	3.38	0.00	0.55	2.46	22.22	0.00	4.07	3.77	0.47	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
54	E9b_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
55	E9b_E11a	KnownJunction	0	6.00	0.00	0.00	1.27	3.65	0.00	0.00	2.26	1.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
56	ER9b	ExonRegion	0	4.23	0.00	1.23	1.36	2.68	0.00	0.00	1.73	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
57	ER10a	ExonRegion	0	2.20	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
58	ER11a	ExonRegion	0	1.87	0.00	0.00	1.91	1.75	0.00	0.27	0.59	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
59	E11_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	5.06	0.00	0.00	0.00	2.55	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
60	ER11b	ExonRegion	0	2.53	0.00	0.00	1.07	0.58	0.00	0.00	1.57	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
61	ER11c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	2.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00