Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-255H23.1 Gene 0 2.34 0.73 0.09 1.37 5.14 26.97 20.68 7.12 2.74 12.03 0.28 0.34 0.38 0.16 0.05 0.07 0.08 0.04 0.08 0.31 0.16 1.00 1.34 2 471224 Transcript 0 1.27 0.40 0.00 0.12 2.06 4.09 4.28 1.01 0.26 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.45 3 475499 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 472297 Transcript 0 1.32 0.51 0.05 0.81 3.30 15.81 11.62 4.46 1.84 6.89 0.24 0.45 0.49 0.17 0.00 0.09 0.10 0.06 0.10 0.40 0.16 0.67 0.46 5 432090 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 ER1a ExonRegion 0 2.55 0.80 0.00 0.24 4.11 8.19 8.56 2.03 0.52 0.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.89 7 E1_Ab KnownBoundary 0 19.34 3.35 0.00 1.33 14.94 44.86 44.25 6.70 2.86 3.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 0.00 12.21 8 ER1b ExonRegion 0 4.75 0.40 0.00 0.71 2.15 16.31 13.00 3.13 1.46 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.05 9 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E1a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 Ix Intron 0 2.96 0.98 0.81 1.95 2.36 1.58 21.58 8.85 1.59 6.16 0.26 0.47 0.67 0.62 0.81 0.40 0.89 1.06 1.16 1.92 0.21 0.28 1.58 12 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 2.96 0.98 0.81 1.95 2.36 1.58 21.59 8.85 1.59 6.17 0.26 0.47 0.67 0.62 0.81 0.40 0.89 1.06 1.16 1.92 0.21 0.28 1.58 13 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 Ix Intron 0 2.16 0.13 0.12 1.42 2.42 3.14 21.71 5.25 0.89 4.67 0.06 0.08 0.03 0.01 0.06 0.06 0.00 0.07 0.07 0.14 0.06 0.29 1.13 15 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 2.16 0.13 0.12 1.42 2.42 3.14 21.72 5.25 0.89 4.67 0.06 0.08 0.03 0.01 0.06 0.06 0.00 0.07 0.07 0.14 0.06 0.29 1.13 16 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 2.86 1.85 4.63 4.99 3.88 0.60 2.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.43 17 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 Ix Intron 0 1.03 0.00 1.77 0.00 5.20 6.23 19.94 0.00 0.00 0.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 1.01 1.43 19 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 1.05 0.00 1.81 0.00 5.30 6.36 20.32 0.00 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.91 0.00 0.00 0.00 1.03 1.45 20 ER4a ExonRegion 0 1.65 0.00 0.00 2.65 2.06 23.13 11.25 2.66 0.84 6.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.39 21 E4a_E5a KnownJunction 0 6.30 0.00 0.00 1.90 0.00 40.94 15.28 6.94 1.22 7.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.24 22 ER5a ExonRegion 0 2.73 0.65 0.00 0.45 3.53 26.97 16.33 9.10 3.13 14.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 1.34 23 E5_Ab KnownBoundary 0 30.08 23.22 25.75 97.76 62.82 57.81 130.54 93.11 107.49 132.35 15.64 14.40 0.00 0.00 0.00 17.09 4.77 6.59 4.42 74.91 3.15 51.31 17.16 24 ER5b ExonRegion 0 1.32 1.11 0.00 1.11 5.13 31.39 27.25 6.82 2.75 13.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.94 0.53 25 E5_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.23 24.93 39.53 10.10 2.78 7.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER5c ExonRegion 0 2.15 0.34 0.33 1.43 6.65 28.82 27.25 5.87 2.27 14.58 0.66 0.00 0.00 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 1.31 1.49 27 E5_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.67 1.40 7.72 24.99 32.50 11.46 0.00 18.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.09 2.82 0.00 28 ER5d ExonRegion 0 2.64 1.02 0.10 1.63 6.60 31.61 23.25 8.93 3.67 13.79 0.48 0.89 0.98 0.33 0.00 0.19 0.21 0.12 0.20 0.80 0.33 1.34 0.92 29 IG38_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.36 4.10 4.89 17.30 3.57 3.71 6.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.08 0.00 30 IG38_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.36 8.03 7.34 17.71 2.38 3.71 5.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 0.00