Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC011447.1 Gene 0 3.25 5.85 0.00 2.72 6.67 2.11 3.30 6.41 1.41 4.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.90 5.11 0.00 3.26 0.00 0.00 0.56 2 430434 Transcript 0 1.77 1.22 0.00 0.00 0.71 1.31 1.30 0.32 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.22 0.22 0.00 1.41 0.00 0.00 0.00 3 339844 Transcript 0 0.10 0.21 0.00 0.19 0.56 0.00 0.10 0.25 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.36 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 1.70 8.89 0.00 5.60 7.52 2.19 3.66 13.27 2.88 9.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.22 0.00 4.09 0.00 0.00 1.18 5 E1_Db NovelBoundary 0 2.82 2.83 0.00 6.93 15.70 4.88 21.29 16.47 6.63 5.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.93 4.80 0.00 0.00 0.00 4.10 6 ER1b ExonRegion 0 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.46 1.32 1.30 2.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 Ix Intron 0 6.19 13.54 7.71 7.59 20.43 8.64 17.85 25.94 8.67 21.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.28 3.62 10.71 0.00 1.35 1.43 8 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 6.23 13.63 7.76 7.64 20.55 8.69 17.96 26.10 8.72 21.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.32 3.64 10.78 0.00 1.36 1.44 9 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.81 0.00 1.36 0.00 0.00 0.26 1.73 0.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 12 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 0.00 0.07 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 0.00 0.00 0.00 13 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER4a ExonRegion 0 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 16 E5_Ab NovelBoundary 0 2.74 32.89 3.55 0.00 52.29 27.65 30.12 20.00 4.60 10.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.02 0.00 2.56 0.00 0.00 0.00 17 E5_Ac NovelBoundary 0 9.63 19.27 2.69 3.76 8.66 7.15 14.40 4.68 7.12 17.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 8.25 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 0.71 0.68 0.00 0.00 0.89 0.00 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER5b ExonRegion 0 6.49 2.85 0.00 0.00 2.85 4.77 3.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.86 0.00 5.25 0.00 0.00 0.00 20 ER5c ExonRegion 0 10.79 7.36 0.00 0.00 15.25 4.18 6.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.31 3.51 0.00 4.85 0.00 0.00 0.00 21 ER5d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00