Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 GDF1 Gene 0 1.14 7.99 25.01 6.60 1.07 8.37 1.43 9.45 12.62 10.02 0.00 0.14 0.00 0.03 0.19 0.24 0.13 28.21 20.96 19.09 5.36 1.20 3.45 2 247005 Transcript 0 0.69 4.55 16.26 4.35 0.59 5.63 0.73 5.65 8.86 6.80 0.00 0.10 0.00 0.01 0.04 0.06 0.03 18.00 12.41 10.53 1.95 0.91 1.61 3 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER2a ExonRegion 0 0.00 1.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER3a ExonRegion 0 1.84 1.85 0.51 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.59 0.00 8 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 Ix Intron 0 0.54 4.67 15.24 7.09 1.37 4.53 2.48 5.04 6.11 4.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.28 10.09 11.66 10.33 2.25 0.71 2.25 10 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.54 4.68 15.27 7.10 1.37 4.54 2.48 5.05 6.12 4.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.28 10.11 11.68 10.35 2.26 0.71 2.25 11 Ix Intron 0 0.84 7.24 7.94 4.01 1.06 5.80 2.09 7.13 8.00 3.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.00 0.00 14.88 10.07 10.09 0.87 0.82 3.48 12 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.84 7.24 7.94 4.01 1.06 5.80 2.09 7.13 8.00 3.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.00 0.00 14.88 10.07 10.09 0.87 0.82 3.48 13 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 1.04 4.32 9.56 3.32 0.44 2.10 3.46 7.99 6.02 4.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.12 6.25 7.30 2.88 0.68 1.92 14 ER4a ExonRegion 0 5.94 17.39 0.41 0.04 0.00 7.97 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER5a ExonRegion 0 0.00 10.33 39.62 23.41 0.92 14.56 2.58 15.36 25.71 15.92 0.00 1.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40.09 42.70 36.16 0.98 1.52 9.07 17 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER6a ExonRegion 0 0.00 2.40 58.14 12.45 0.00 2.08 0.13 22.17 37.93 32.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.86 29.83 35.65 11.24 2.78 5.61 19 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 Ix Intron 0 2.39 9.65 13.80 8.55 7.43 6.01 4.58 7.98 9.13 6.46 0.42 0.89 0.43 0.64 1.10 2.71 1.18 11.99 9.18 10.21 3.39 1.23 3.10 21 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 2.39 9.65 13.80 8.55 7.43 6.01 4.58 7.98 9.13 6.46 0.42 0.89 0.43 0.64 1.10 2.72 1.18 11.99 9.19 10.21 3.39 1.23 3.10 22 ER7a ExonRegion 0 2.37 19.37 58.01 15.79 2.71 17.77 3.80 18.43 22.23 21.63 0.00 0.29 0.00 0.00 0.42 0.48 0.00 56.25 41.43 38.38 9.83 2.19 5.39 23 E7_Da NovelBoundary 0 0.00 3.03 7.57 8.92 0.00 0.00 1.99 5.71 5.38 5.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.24 0.00 3.26 5.50 0.00 4.35 24 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 12.04 69.78 11.25 4.24 34.01 2.08 19.55 34.49 24.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 123.61 51.20 29.72 0.00 5.27 0.00 25 ER8a ExonRegion 0 0.13 3.50 17.41 2.36 1.04 7.55 0.64 9.20 11.99 7.02 0.00 0.00 0.00 0.08 0.25 0.36 0.40 34.15 21.00 18.01 7.23 1.25 4.11