Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 GALR1 Gene 0 0.10 0.20 2.22 16.87 0.13 19.95 0.64 0.13 0.36 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 115.42 64.37 83.50 0.21 1.52 0.29 2 299727 Transcript 0 0.03 0.13 1.72 15.59 0.10 25.85 1.35 0.04 0.14 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 78.34 58.43 92.68 0.14 3.27 0.09 3 IG42_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 0.80 0.00 20.43 3.26 1.01 3.48 1.25 0.00 1.87 1.52 0.73 1.61 0.00 0.71 0.39 0.00 2.50 1.00 3.52 1.21 0.00 0.00 0.00 4 IG42_AR7 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.35 4.58 0.00 5.00 0.16 0.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 61.64 38.97 27.74 0.00 0.73 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.16 0.00 2.97 11.72 0.00 12.07 0.37 0.20 0.42 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 135.85 55.71 75.43 0.00 1.17 0.45 6 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 3.31 9.09 0.00 2.10 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40.33 35.11 41.03 0.00 0.00 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.45 13.98 0.00 21.52 2.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 69.02 45.37 109.11 0.00 2.94 0.00 8 I1 Intron 0 0.00 0.17 1.47 15.39 0.07 5.55 0.58 0.00 0.52 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 38.09 32.86 29.30 0.00 0.10 0.18 9 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.17 1.47 15.40 0.07 5.55 0.58 0.00 0.52 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 38.11 32.87 29.31 0.00 0.10 0.18 10 E2_Aa NovelBoundary 0 3.63 0.00 3.25 26.64 0.00 7.33 0.00 0.00 1.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.82 16.57 29.02 0.00 0.00 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 2.25 10.92 0.08 36.01 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46.98 69.11 105.48 0.00 4.36 0.00 12 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 5.23 21.58 0.00 2.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.84 16.38 46.15 0.00 0.00 0.00 13 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.30 12.45 0.00 26.52 2.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53.02 40.47 77.53 0.00 6.25 0.00 14 I2 Intron 0 0.06 0.43 1.37 23.06 0.24 4.32 0.17 0.12 0.63 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.03 30.62 31.20 27.02 0.00 0.10 0.11 15 I2_SR1 SilentIntronRegion 0 0.06 0.43 1.38 23.07 0.24 4.32 0.17 0.12 0.63 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.03 30.63 31.21 27.03 0.00 0.10 0.11 16 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.65 0.64 28.89 0.41 33.14 1.16 0.00 0.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.00 0.00 86.82 81.52 95.83 0.71 1.66 0.00 17 IG43 Intergenic 0 0.04 0.17 0.29 7.26 0.07 2.78 0.17 0.05 0.20 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.22 7.55 14.82 7.51 0.01 0.05 0.03 18 IG43_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.13 0.31 0.96 24.46 0.41 22.60 1.28 0.27 1.99 1.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 18.02 45.56 58.95 0.00 1.37 0.00 19 IG43_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 1.31 0.00 1.08 14.47 0.00 18.78 0.95 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.25 13.57 22.13 0.00 1.54 0.00 20 IG43_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.42 1.46 32.10 0.33 26.05 0.97 0.47 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36.52 40.11 71.29 0.27 0.89 0.00 21 IG43_SR2 SilentIntergenicRegion 0 0.10 0.71 0.53 21.81 0.15 11.81 0.48 0.07 0.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.52 22.39 24.67 29.75 0.04 0.13 0.03 22 IG43_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.20 0.20 1.24 18.84 0.26 2.59 0.26 0.00 0.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 1.33 18.35 35.37 7.61 0.00 0.00 0.00 23 IG43_SR3 SilentIntergenicRegion 0 0.27 0.00 0.24 17.43 0.35 1.25 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 14.97 32.28 7.25 0.00 0.00 0.00 24 IG43_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 0.25 0.73 0.22 29.96 0.32 1.54 0.00 0.00 0.44 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 13.40 27.00 10.12 0.00 0.00 0.00