Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 MYL4 Gene 0 57.90 3.17 18.06 1.31 3.16 0.49 0.57 1.94 0.89 1.84 0.21 0.57 2.08 2.09 3.74 6.87 1.06 0.30 0.00 0.46 0.12 0.11 0.00 2 354968 Transcript 0 22.30 1.96 2.78 0.00 0.73 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 393450 Transcript 0 21.14 0.02 1.17 0.00 0.00 0.00 0.43 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.05 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 21.86 0.56 3.05 0.00 1.45 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E1a_E2b KnownJunction 0 22.74 3.35 2.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 40.16 0.05 2.33 0.00 0.00 0.00 0.85 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.10 0.00 0.00 7 E2_Ab KnownBoundary 0 122.47 0.00 4.70 0.00 0.00 0.00 3.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.16 0.00 0.00 2.66 0.00 0.00 8 ER2b ExonRegion 0 69.19 6.65 15.98 0.00 3.19 0.56 1.39 3.01 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.63 2.38 2.92 0.00 0.30 0.00 1.01 0.14 0.63 0.00 9 E2a_E3a KnownJunction 0 19.71 3.03 17.50 0.00 7.98 0.00 0.00 1.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 8.63 4.77 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 10 E3a_E4a KnownJunction 0 61.79 0.00 26.91 1.66 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.12 4.45 12.65 4.58 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER3a ExonRegion 0 30.99 2.25 28.80 0.00 4.40 0.00 0.00 2.84 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 3.36 1.55 10.61 0.00 1.85 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 12 ER4a ExonRegion 0 60.19 2.02 27.84 0.83 2.57 0.62 1.50 3.89 0.55 2.56 0.00 1.21 3.00 3.03 5.80 7.63 2.24 0.26 0.00 0.20 0.00 0.00 0.00 13 E4a_E5a KnownJunction 0 77.27 6.31 37.25 1.33 6.62 0.00 2.12 0.00 4.25 5.99 0.00 0.00 6.82 6.89 22.62 11.71 0.00 0.00 0.00 2.88 0.00 0.00 0.00 14 ER5a ExonRegion 0 80.59 6.66 28.56 3.85 5.75 1.07 0.26 1.75 3.65 5.30 0.69 1.00 5.34 3.19 5.95 8.59 0.00 0.38 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 15 E5a_E6a KnownJunction 0 63.72 0.00 22.35 1.86 20.97 0.00 0.00 2.22 2.52 0.00 2.21 0.00 0.00 7.00 4.45 11.88 0.00 2.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER6a ExonRegion 0 40.21 1.33 26.55 1.61 5.28 0.00 0.00 1.26 1.20 0.74 0.99 0.11 4.51 2.21 7.74 16.31 1.06 0.95 0.00 1.39 0.00 0.00 0.00 17 E6a_E7a KnownJunction 0 50.97 0.00 40.09 1.53 0.00 0.00 0.00 2.22 1.68 2.87 0.00 0.00 6.49 4.59 4.45 14.87 4.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER7a ExonRegion 0 34.78 0.00 18.97 1.83 3.77 0.00 0.00 1.73 0.76 1.15 0.00 0.00 5.22 5.83 3.56 12.09 3.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E7_Da NovelBoundary 0 31.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E7a_E8a KnownJunction 0 38.75 0.00 1.12 1.90 12.82 0.00 0.00 2.38 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 7.06 5.19 15.38 4.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 I7 Intron 0 11.97 0.00 1.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.44 0.37 0.46 0.67 0.37 0.31 0.00 0.00 0.00 0.94 0.00 22 I7_AR1 ActiveIntronRegion 0 12.02 0.00 1.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.44 0.37 0.47 0.68 0.37 0.31 0.00 0.00 0.00 0.95 0.00 23 ER8a ExonRegion 0 64.64 1.22 7.11 1.43 1.43 0.55 0.00 1.05 0.00 0.39 0.00 1.07 0.06 2.03 2.59 7.57 2.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER8b ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00