Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C17orf73 Gene 0 2.38 3.90 2.60 2.21 3.95 2.17 4.82 1.81 2.45 2.56 0.86 2.10 2.80 1.53 3.25 3.13 1.95 3.65 2.94 3.14 1.87 1.08 3.47 2 300458 Transcript 0 7.97 10.15 4.14 4.95 11.46 7.46 11.33 6.06 5.58 4.14 3.14 4.70 8.45 3.88 8.94 10.51 6.55 9.15 9.70 9.26 6.24 3.23 9.69 3 419688 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 450727 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 1.36 0.00 0.00 1.65 0.00 0.00 0.91 0.00 0.00 0.00 0.00 2.79 0.00 0.00 1.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.54 1.76 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 2.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E1a_E1d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E1a_E1e KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER1d ExonRegion 0 0.00 3.65 0.29 0.95 0.00 0.00 5.92 0.88 1.33 1.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E1_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 2.21 0.00 0.00 1.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER1e ExonRegion 0 0.52 0.69 0.74 0.00 0.00 0.00 0.22 0.72 0.89 1.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E1_Db KnownBoundary 0 3.78 3.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E1b_E1e KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER1f ExonRegion 0 0.26 1.18 0.45 0.86 0.14 0.46 2.71 0.30 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E1_Ae KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.80 3.40 0.00 4.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER1g ExonRegion 0 0.00 0.73 0.68 1.20 0.78 0.00 0.41 0.00 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E1c_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E1c_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.80 0.36 1.52 0.72 0.36 3.66 0.00 0.69 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 1.09 1.75 0.68 0.00 0.00 0.25 22 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.56 4.16 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.58 0.00 3.95 3.07 0.00 0.00 4.35 23 ER2b ExonRegion 0 0.13 0.60 1.65 0.85 0.74 0.08 1.94 0.21 1.24 2.58 0.00 0.28 0.00 0.00 0.58 0.37 0.23 1.46 0.29 0.64 0.18 0.00 0.93 24 E2_Ab KnownBoundary 0 3.78 0.00 11.56 1.70 0.00 0.00 1.77 0.00 0.00 1.21 0.00 12.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 0.00 0.00 0.00 25 ER2c ExonRegion 0 0.37 0.66 3.68 2.56 0.85 0.00 4.58 0.00 1.17 4.25 0.00 1.30 0.00 0.00 0.00 0.00 1.05 0.59 0.00 0.13 0.00 0.00 0.00 26 E2b_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 4.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER3a ExonRegion 0 1.62 6.75 4.60 1.58 4.11 1.14 3.05 0.82 2.14 0.41 0.30 5.68 4.86 4.29 5.15 1.87 0.51 2.77 0.99 3.28 1.35 1.93 4.50 28 E3_Da KnownBoundary 0 2.74 3.22 4.82 4.10 0.00 0.00 3.89 0.00 2.95 1.67 4.47 0.00 0.00 0.00 6.06 0.00 6.92 9.33 0.00 3.20 0.00 0.00 0.00 29 ER3b ExonRegion 0 39.45 45.31 17.69 22.08 56.43 36.75 46.11 28.91 24.90 17.10 15.68 23.20 42.27 19.39 44.12 52.17 32.51 42.79 48.20 45.65 31.00 16.14 47.53 30 IG39 Intergenic 0 49.00 168.07 63.64 265.02 204.35 188.48 135.43 134.38 149.61 165.90 16.12 40.46 27.13 17.15 10.56 17.13 14.72 36.50 26.54 98.81 3.89 18.43 12.67 31 IG39_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 87.61 298.45 111.97 484.76 372.47 346.95 245.32 244.35 273.10 302.18 29.61 73.68 48.22 31.58 17.50 29.86 26.38 63.32 45.41 177.79 6.79 33.90 20.23