Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C17orf66 Gene 0 2.46 2.63 4.03 1.28 1.63 0.80 4.26 1.37 4.48 2.77 1.55 1.13 2.74 0.95 1.01 1.98 3.08 1.59 1.09 5.87 0.59 0.24 0.67 2 417195 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 444168 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 443570 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 311880 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 462028 Transcript 0 2.53 2.92 7.00 1.25 2.29 0.94 6.32 1.94 7.33 5.76 1.17 2.27 5.42 1.34 1.06 1.68 3.33 2.89 1.47 6.54 0.66 0.13 0.25 7 ER1a ExonRegion 0 0.00 1.42 2.15 1.77 0.00 0.00 0.45 0.42 1.82 1.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.80 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 8 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 3.03 6.56 3.56 0.00 0.00 2.12 1.77 3.59 2.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.75 0.00 0.00 0.00 9 ER1b ExonRegion 0 1.76 1.28 4.95 1.18 0.74 0.51 2.08 1.31 5.14 1.00 1.08 0.00 2.14 0.00 0.00 0.00 2.85 1.53 0.00 2.80 0.00 1.15 1.63 10 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 1.46 0.00 1.38 0.37 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.65 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 12 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER3a ExonRegion 0 1.14 0.00 1.51 0.00 0.75 0.00 3.67 0.72 2.66 2.77 0.00 1.00 1.08 1.45 0.57 1.67 0.47 0.00 0.89 1.80 0.00 0.00 0.00 14 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER4a ExonRegion 0 0.65 0.63 4.15 0.00 0.00 0.42 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.78 0.00 0.48 0.00 17 ER4b ExonRegion 0 0.92 0.86 4.21 0.00 0.00 0.00 2.81 0.00 1.56 0.73 0.82 0.00 0.00 0.57 0.00 2.53 0.00 0.00 0.00 3.28 0.94 0.00 0.00 18 E4b_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E5_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 3.28 5.16 0.00 0.00 17.00 2.22 7.26 0.00 0.00 0.00 0.00 2.30 0.00 3.59 0.00 3.94 0.00 5.88 0.00 0.00 0.00 20 ER5a ExonRegion 0 1.86 3.60 0.00 1.22 4.69 1.54 3.46 0.00 2.80 0.18 0.95 0.00 3.21 1.94 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 1.79 0.00 21 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.86 0.00 0.00 0.00 0.00 2.69 0.00 2.37 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER6a ExonRegion 0 1.75 3.00 7.59 1.82 3.66 7.05 2.28 3.18 6.74 8.05 2.71 1.90 0.25 1.57 4.33 2.03 2.32 6.22 1.40 6.16 0.58 1.83 0.00 23 E6_Da KnownBoundary 0 7.04 3.09 14.61 1.86 4.33 2.67 3.84 7.39 8.59 13.94 5.37 6.30 0.00 4.94 4.33 4.02 12.44 11.07 4.80 17.58 4.76 0.00 0.00 24 E6a_E6b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER6b ExonRegion 0 5.12 5.16 7.38 1.30 2.56 0.71 7.87 3.12 7.30 7.14 4.05 2.75 8.42 2.88 0.59 6.90 4.44 9.83 3.73 12.65 6.33 1.43 1.61 26 E6_Db KnownBoundary 0 12.52 3.09 11.27 4.13 12.39 0.00 17.36 2.55 6.74 5.43 0.00 0.00 6.01 5.24 0.00 0.00 4.11 8.66 4.71 4.79 5.31 6.12 0.00 27 ER6c ExonRegion 0 2.53 2.92 7.00 1.25 2.29 0.94 6.32 1.94 7.33 5.76 1.17 2.27 5.42 1.34 1.06 1.68 3.33 2.89 1.47 6.54 0.66 0.13 0.25 28 E6_Ab KnownBoundary 0 3.26 0.00 1.71 0.00 7.39 0.00 4.24 3.53 3.21 1.37 0.00 0.00 6.82 2.47 4.45 4.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER6d ExonRegion 0 1.41 1.75 0.56 0.00 1.92 0.61 0.74 3.46 2.64 1.11 1.56 0.00 1.07 2.71 1.73 1.15 2.95 0.23 0.00 1.87 0.00 0.00 0.00 30 E6_Dc NovelBoundary 0 0.00 0.00 3.19 1.40 0.00 0.00 4.15 0.00 7.49 1.53 7.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.68 1.62 0.00 6.01 0.00 0.00 0.00 31 E6c_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.84 0.00 0.00 0.00 0.00 1.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER7a ExonRegion 0 0.00 3.04 2.20 0.79 4.17 1.88 4.12 2.14 3.05 2.01 1.62 1.39 3.33 1.04 1.93 4.63 1.29 0.00 1.24 4.19 0.00 0.00 0.00 33 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.33 0.00 2.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 ER8a ExonRegion 0 2.12 1.79 8.05 0.00 4.47 0.72 2.95 0.74 3.22 2.85 2.19 3.19 6.07 0.75 1.95 1.88 4.56 1.28 0.00 5.95 0.61 0.00 0.82 35 E8a_E9a KnownJunction 0 3.56 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 6.49 0.00 0.00 3.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 ER9a ExonRegion 0 1.64 0.02 0.11 1.11 0.00 0.59 2.08 0.00 8.42 1.07 2.76 0.00 1.66 0.00 1.12 1.18 5.54 1.33 0.00 7.12 0.00 0.00 0.00 37 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.90 1.97 7.87 0.00 5.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 ER10a ExonRegion 0 4.99 3.44 3.10 0.86 0.00 0.78 4.56 0.00 4.95 3.53 3.51 0.00 0.00 0.00 0.87 0.00 2.78 2.48 0.00 6.21 0.00 0.00 0.00 39 E10a_E11a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40 ER11a ExonRegion 0 0.66 2.80 0.00 0.00 0.00 0.00 2.74 0.00 2.27 0.00 2.66 0.00 2.66 0.00 0.00 2.05 2.27 0.00 2.28 7.33 0.00 0.00 2.02 41 E11_Da NovelBoundary 0 21.63 5.85 1.27 4.56 0.00 0.00 9.23 0.00 1.16 1.56 0.00 0.00 0.00 2.18 5.44 0.00 0.00 4.44 0.00 2.75 0.00 0.00 0.00 42 E11a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 ER13a ExonRegion 0 1.55 0.00 0.00 0.37 0.00 0.00 1.32 0.00 2.42 0.00 1.19 0.00 0.00 1.22 0.67 0.06 0.00 0.00 3.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 E13a_E14a KnownJunction 0 3.41 0.00 0.00 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 5.09 0.00 7.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 ER14a ExonRegion 0 6.25 1.19 6.42 2.10 0.00 2.15 2.33 0.10 2.87 0.00 1.56 0.00 0.00 0.56 0.80 5.19 1.94 0.00 0.00 4.99 0.00 0.00 0.00 47 E14a_E15a KnownJunction 0 3.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48 I14 Intron 0 10.67 4.51 4.42 1.23 1.62 1.11 5.60 1.56 2.60 0.69 1.56 1.44 1.56 1.31 2.13 4.19 3.33 1.67 1.93 5.58 0.44 0.00 1.78 49 I14_SR1 SilentIntronRegion 0 10.75 4.55 4.45 1.24 1.63 1.12 5.65 1.57 2.62 0.69 1.57 1.45 1.55 1.32 2.15 4.23 3.35 1.68 1.94 5.62 0.45 0.00 1.79 50 ER15a ExonRegion 0 4.08 5.47 2.05 3.43 1.20 0.41 6.08 2.29 3.50 1.34 1.52 0.80 1.30 0.93 1.42 2.67 5.55 0.72 2.14 10.72 0.74 0.00 1.97 51 ER15b ExonRegion 0 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00