Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 SLC47A2 Gene 0 0.71 1.11 1.11 0.92 1.02 1.41 1.18 0.98 1.83 1.24 0.04 0.03 0.22 0.08 0.16 0.22 0.03 1.89 1.07 1.02 0.46 0.34 1.33 2 463318 Transcript 0 0.25 0.06 0.11 0.18 0.00 0.32 0.39 0.08 0.43 0.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.16 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 3 467379 Transcript 0 0.27 0.29 0.69 0.43 0.65 0.32 0.16 0.67 1.14 0.97 0.00 0.14 0.00 0.03 0.18 0.12 0.00 1.79 0.51 0.29 0.09 0.08 0.12 4 456947 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 350657 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 483510 Transcript 0 0.13 0.16 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 1.17 0.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 0.97 0.30 0.00 0.00 0.16 0.27 7 478689 Transcript 0 0.64 0.74 0.94 1.04 1.05 1.00 1.08 0.39 1.04 0.41 0.00 0.00 0.61 0.08 0.00 0.00 0.10 0.77 0.73 0.94 0.20 0.00 0.44 8 325411 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 433844 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 467609 Transcript 0 1.40 4.07 2.24 2.14 1.77 1.67 5.48 4.22 9.91 5.50 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.58 4.01 1.85 2.18 1.38 7.36 11 ER1a ExonRegion 0 0.50 0.12 0.21 0.36 0.00 0.65 0.78 0.15 0.86 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 0.25 0.00 0.00 0.00 12 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 0.13 0.12 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 0.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.68 0.00 0.00 0.00 1.86 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E2_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E2_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E2_Ae KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E2_Af KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.77 0.00 3.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER2c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER2d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 1.32 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER2e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 1.32 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER2f ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 1.32 0.99 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E2_Ag KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.53 0.00 0.00 0.00 2.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER2g ExonRegion 0 0.00 0.00 0.38 0.78 0.00 0.70 0.00 0.69 0.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER3a ExonRegion 0 0.25 0.00 0.42 0.00 1.34 0.00 0.00 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E3_Da KnownBoundary 0 2.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E3a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER3b ExonRegion 0 0.25 0.32 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 0.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 31 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 2.93 0.00 0.00 0.00 0.00 1.97 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.02 0.00 1.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER3c ExonRegion 0 0.00 0.00 4.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.41 2.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.49 0.00 3.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 E3_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 4.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 E3b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 ER3d ExonRegion 0 0.00 0.00 1.76 0.00 0.00 0.00 0.00 1.44 1.62 0.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.59 0.00 0.00 0.00 0.55 36 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.09 0.00 0.00 0.00 0.00 37 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 1.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 E6_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.80 0.00 2.78 0.00 2.34 0.00 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 E6a_E6b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 E6a_E6c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 ER6b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.89 0.99 0.65 0.74 0.00 0.41 0.90 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 E6_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 ER6c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.83 0.00 0.87 0.63 0.00 1.83 0.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.31 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 47 E6_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 4.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48 ER6d ExonRegion 0 0.00 0.00 2.88 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.87 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.39 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 49 E6b_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 ER7a ExonRegion 0 1.10 0.00 0.00 0.00 1.39 0.00 0.00 0.00 0.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.08 0.00 51 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 52 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 1.86 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.00 0.00 1.31 53 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 ER9a ExonRegion 0 1.21 3.05 0.86 1.10 0.00 0.00 1.97 1.40 2.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.82 1.03 0.00 0.00 0.00 55 E9_Da KnownBoundary 0 2.96 0.00 1.74 1.73 0.00 0.00 0.00 2.01 2.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.13 0.00 0.00 0.00 56 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 E9a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 58 ER9b ExonRegion 0 0.82 0.73 1.18 0.31 1.28 0.22 0.48 1.32 2.39 1.03 0.00 0.43 0.00 0.00 0.53 0.36 0.00 2.87 1.52 0.86 0.26 0.25 0.35 59 E9_Db NovelBoundary 0 223.45 207.86 32.11 79.61 265.62 146.56 328.39 78.74 59.66 88.16 112.29 104.13 96.91 112.72 74.66 259.50 184.20 107.07 186.08 308.27 153.45 100.12 182.16 60 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 61 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 62 ER11a ExonRegion 0 0.99 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 1.24 0.00 2.46 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.49 0.00 0.00 0.00 0.00 63 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 64 E11a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 65 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.81 0.00 0.95 0.00 1.55 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 2.29 2.76 0.00 0.00 0.00 66 E12b_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 67 E12c_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 68 ER12b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 69 ER12c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 3.19 2.13 0.00 0.00 0.00 70 ER13a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.02 1.91 0.00 0.00 0.10 2.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.14 0.03 0.00 0.00 0.04 71 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 72 E13a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 73 E14_Aa NovelBoundary 0 11.04 0.00 5.47 6.53 0.00 0.00 9.01 0.00 2.86 4.54 0.00 0.00 20.45 0.00 0.00 0.00 0.00 2.11 4.61 3.00 2.29 2.45 0.00 74 ER14a ExonRegion 0 3.19 3.68 4.68 5.20 5.26 4.98 5.39 1.94 2.76 2.06 0.00 0.00 3.04 0.40 0.00 0.00 0.50 2.91 0.48 2.56 1.00 0.00 2.22 75 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 76 E15_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.37 4.24 2.84 0.00 2.55 0.00 2.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.49 3.58 0.00 2.35 0.00 15.45 77 ER15a ExonRegion 0 1.62 1.56 2.80 2.34 2.05 1.85 1.28 6.16 6.50 3.97 0.54 0.00 0.00 0.51 0.00 2.28 0.00 3.89 6.61 4.64 1.69 0.80 4.39 78 E15_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.22 2.16 2.18 3.44 0.99 2.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 5.94 0.00 0.00 0.00 79 E15a_E15b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 80 ER15b ExonRegion 0 1.40 4.07 2.24 2.14 1.77 1.67 5.48 4.22 9.91 5.50 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.58 4.01 1.85 2.18 1.38 7.36 81 E15_Ab KnownBoundary 0 0.00 2.57 6.56 4.93 0.00 0.00 8.17 8.87 18.37 9.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.75 13.46 3.00 3.03 0.00 8.02 82 ER15c ExonRegion 0 0.09 2.19 1.13 2.65 0.00 0.00 0.90 4.52 6.98 3.72 1.05 0.00 2.10 0.00 0.00 0.00 0.00 6.11 6.37 3.46 1.81 0.00 5.25 83 E15b_E16a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 84 ER16a ExonRegion 0 1.83 4.69 0.11 0.00 1.52 5.31 0.74 0.00 2.02 3.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.09 0.00 1.35 0.00 1.21 5.11 85 E16_Da NovelBoundary 0 3.11 9.08 3.25 4.93 0.00 5.62 12.50 1.68 13.28 3.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.40 3.95 2.75 2.90 13.84 0.00 86 E16a_E17a KnownJunction 0 3.78 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 87 ER17a ExonRegion 0 2.08 5.08 2.97 2.80 3.46 7.43 4.45 1.78 4.15 3.84 0.00 0.00 0.00 0.23 1.12 0.77 0.00 6.10 3.84 4.56 2.65 1.97 6.83