Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 FBXW10 Gene 0 0.21 0.73 0.43 1.33 1.11 1.15 0.29 1.43 1.25 1.61 0.00 0.30 0.05 0.00 0.03 0.08 0.05 0.47 0.57 0.35 1.13 0.35 0.12 2 395667 Transcript 0 0.00 0.29 0.00 1.39 1.70 2.33 0.28 0.00 0.18 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 0.00 3 308799 Transcript 0 0.00 0.17 0.00 2.13 0.26 0.00 0.14 1.97 0.00 2.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.17 1.05 0.00 4 301938 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 395665 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 488624 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.76 1.95 0.93 0.00 1.09 0.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.58 0.00 0.88 0.00 0.00 0.57 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.22 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 0.00 1.95 1.75 1.36 2.46 0.00 1.22 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.78 0.00 0.00 0.00 9 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.61 1.66 3.23 0.00 0.00 0.00 2.78 0.00 0.00 5.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.73 0.00 2.49 0.00 0.00 0.00 10 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.19 1.53 0.14 0.09 0.55 0.00 0.00 0.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 11 E1_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.55 0.05 0.06 0.54 0.19 0.13 1.34 0.41 1.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.28 0.32 0.22 0.00 0.00 0.00 13 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.45 0.83 0.00 0.00 3.96 2.64 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 1.36 0.00 0.00 15 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.57 1.27 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER3a ExonRegion 0 0.54 0.00 0.00 1.02 0.00 0.47 0.34 4.72 1.01 4.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 1.06 0.00 17 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E3a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.35 0.00 1.60 0.52 0.00 0.27 3.95 0.00 5.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.11 0.00 20 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 2.96 0.00 1.90 3.99 0.00 2.03 0.00 0.00 2.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.33 0.00 21 ER3c ExonRegion 0 0.00 0.58 0.00 0.53 0.72 0.00 0.88 0.69 0.23 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.20 0.00 22 E3b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.38 1.59 5.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.04 0.84 0.00 1.52 0.00 0.38 0.52 1.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.91 0.80 1.42 0.00 0.00 0.61 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.28 1.48 0.00 1.02 0.00 0.00 26 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.02 0.00 0.25 0.00 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.56 0.00 0.00 28 E6a_E7b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.76 1.95 0.93 0.00 1.09 0.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E7_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.86 0.00 0.74 0.00 0.09 0.00 0.50 0.24 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 32 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.25 0.57 0.01 0.00 1.10 0.22 1.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.16 1.04 1.08 0.00 34 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.60 4.33 0.00 0.00 2.18 1.68 4.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 3.09 0.00 0.00 35 ER9a ExonRegion 0 0.75 0.00 0.65 1.29 1.65 1.30 0.00 0.27 0.42 3.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.27 1.77 3.96 1.15 0.04 36 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.16 0.00 0.00 0.00 1.53 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.33 0.00 0.00 3.67 4.99 5.56 3.12 0.00 37 E9a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 ER10a ExonRegion 0 0.56 3.26 0.00 1.24 0.56 1.76 0.42 0.00 1.18 1.90 0.00 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 1.83 0.39 1.85 39 E10a_E11a KnownJunction 0 2.96 0.00 0.00 1.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40 ER11a ExonRegion 0 0.07 1.93 0.68 4.05 2.99 5.16 0.25 1.93 3.52 0.69 0.00 2.01 0.00 0.00 0.38 0.00 0.62 1.36 1.19 0.80 1.69 0.00 0.00 41 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 4.06 0.00 0.00 0.00 0.00 3.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.36 0.00 0.00 2.66 0.00 0.00 42 E11a_E13b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.35 0.00 0.00 43 ER12a ExonRegion 0 0.00 1.71 0.00 4.59 0.52 0.64 0.00 0.00 1.32 0.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.75 0.00 0.00 1.51 1.10 0.00 44 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 45 E12a_E13b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.90 3.40 4.66 0.00 0.00 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 E13_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 ER13a ExonRegion 0 1.06 0.00 0.00 2.39 0.67 0.92 0.00 0.00 0.00 0.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 2.08 0.00 48 ER13b ExonRegion 0 0.52 1.01 1.02 2.50 1.96 1.78 0.49 2.00 2.29 1.99 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.20 1.04 0.00 2.34 0.43 0.18 49 E13_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.58 1.63 0.00 0.00 0.00 4.07 0.00 7.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.05 0.00 2.41 0.00 0.00 50 ER13c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 3.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.48 0.00 0.00 0.00 0.00 51 ER13d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00