Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC138915.2 Gene 0 0.65 0.04 83.29 0.00 0.00 0.45 0.15 57.17 0.18 0.26 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.92 0.06 6.40 0.00 0.00 0.00 2 330048 Transcript 0 0.34 0.00 94.95 0.00 0.00 0.00 0.03 50.44 0.39 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.37 0.00 7.50 0.00 0.00 0.00 3 431994 Transcript 0 1.21 0.00 63.55 0.00 0.00 0.00 0.00 63.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.13 6.91 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 1.65 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 5 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 9.41 22.38 3.26 0.00 13.69 4.11 40.09 17.25 21.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27.82 4.61 18.22 14.89 17.51 28.34 6 ER1b ExonRegion 0 0.41 0.00 22.17 0.00 0.00 0.35 0.25 43.23 0.67 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.98 0.00 2.68 0.00 0.00 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 30.59 0.00 0.00 0.00 0.00 34.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.20 0.00 4.56 0.00 0.00 0.00 9 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER3a ExonRegion 0 1.30 0.00 86.79 0.00 0.00 0.00 0.54 99.60 0.38 0.70 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.79 0.00 11.48 0.00 0.00 0.00 11 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 67.62 0.00 0.00 0.00 0.40 85.34 0.00 0.00 0.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.56 0.00 14.96 0.00 0.00 0.00 13 E4_Da NovelBoundary 0 3.78 0.00 185.06 0.00 0.00 0.00 1.94 176.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.43 0.00 39.56 0.00 0.00 0.00 14 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 29.24 0.00 0.00 0.00 1.85 40.79 0.00 0.00 2.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.55 0.00 5.62 0.00 0.00 0.00 15 I4 Intron 0 0.58 0.00 51.64 0.00 0.00 0.30 0.14 46.17 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.21 0.00 6.61 0.00 0.00 0.00 16 I4_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.58 0.00 51.75 0.00 0.00 0.30 0.14 46.27 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.22 0.00 6.62 0.00 0.00 0.00 17 E5_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 56.21 0.00 0.00 0.00 0.00 50.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.97 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 17.63 0.00 0.00 0.00 0.11 22.67 0.00 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.26 0.00 2.44 0.00 0.00 0.00 19 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER6a ExonRegion 0 0.92 0.00 69.55 0.00 0.00 0.00 0.00 77.05 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.97 0.00 4.44 0.00 0.00 0.00 21 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E6a_E7b KnownJunction 0 2.74 0.00 246.50 0.00 0.00 0.00 0.00 248.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.82 0.00 26.21 0.00 0.00 0.00 23 ER7a ExonRegion 0 1.06 0.00 102.93 0.00 0.00 0.00 0.00 108.03 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.00 9.57 0.00 0.00 0.00 24 ER7b ExonRegion 0 0.09 0.00 104.89 0.00 0.00 0.00 0.00 91.65 0.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.14 0.00 4.58 0.00 0.00 0.00 25 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E8_Da NovelBoundary 0 16.15 47.82 87.02 32.63 14.43 43.55 7.64 60.34 41.20 43.33 0.00 0.00 6.33 4.59 0.00 0.00 4.21 40.21 24.38 68.01 34.53 51.74 53.78 28 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E8b_E9b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER8b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 E9_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 10.70 0.00 0.00 0.00 4.06 17.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.92 0.00 5.88 0.00 0.00 0.00 32 ER9a ExonRegion 0 2.12 0.00 7.66 0.00 0.00 0.00 0.00 6.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.53 1.42 0.00 0.00 0.00 33 ER9b ExonRegion 0 1.21 0.00 17.90 0.00 0.00 4.10 0.00 15.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 1.14 0.67 0.00 0.00 0.00 34 E9_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 16.14 0.00 0.00 0.00 0.00 25.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 ER10a ExonRegion 0 1.29 1.01 97.01 0.00 0.00 0.00 0.00 28.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.19 0.00 8.37 0.00 0.00 0.00 37 E10_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 26.52 0.00 0.00 0.00 0.00 12.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 38 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 165.87 0.00 0.00 0.00 0.00 27.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.16 0.00 14.38 0.00 0.00 0.00 39 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 146.66 0.00 0.00 0.87 0.00 90.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.21 0.00 11.65 0.00 0.00 0.00 40 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 221.10 0.00 0.00 8.01 0.00 158.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.14 0.00 8.25 0.00 0.00 0.00 41 ER12a ExonRegion 0 1.89 0.00 175.06 0.00 0.00 2.77 0.39 110.15 0.00 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.18 0.00 7.09 0.00 0.00 0.00 42 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 E12a_E14a NovelJunction 0 0.00 0.00 11.27 0.00 0.00 0.00 0.00 28.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 0.00 0.00 0.00 44 ER13a ExonRegion 0 0.63 0.00 184.01 0.00 0.00 0.00 0.00 69.32 0.00 1.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.98 0.00 12.73 0.00 0.00 0.00 45 E13_Da KnownBoundary 0 31.34 56.31 543.18 162.32 16.89 56.90 10.16 300.21 211.63 238.10 4.95 0.00 0.00 2.94 0.00 0.00 12.44 152.30 131.77 122.85 153.21 164.35 116.95 46 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 344.90 0.00 0.00 0.00 0.00 143.02 0.00 2.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.16 0.00 30.49 0.00 0.00 0.00 47 ER13b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48 E13_Db NovelBoundary 0 193.96 285.61 880.60 331.26 49.83 170.02 56.79 649.01 440.30 416.33 2.05 0.00 0.00 4.94 0.00 4.27 9.16 444.50 115.96 267.62 136.65 281.37 266.42 49 E14_Aa NovelBoundary 0 11.56 81.30 693.56 156.42 13.16 31.35 15.85 316.72 110.56 0.00 2.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 118.56 18.64 132.50 48.74 55.60 51.90 50 ER14a ExonRegion 0 1.32 0.00 216.26 0.00 0.00 0.00 0.21 100.26 0.29 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.49 0.00 12.26 0.00 0.00 0.00