Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 NR2E3 Gene 0 2.26 3.78 1.92 1.27 2.61 2.50 0.76 1.42 1.19 1.07 0.14 0.28 0.21 0.15 0.24 0.11 0.36 2.30 2.41 1.92 2.64 1.11 1.51 2 398840 Transcript 0 0.40 2.35 1.03 0.75 0.00 0.23 0.53 0.49 1.62 0.57 0.00 0.00 0.00 0.08 0.31 0.00 0.00 3.46 3.00 2.00 0.97 0.26 1.66 3 326995 Transcript 0 4.13 6.22 2.79 1.94 4.91 4.84 1.16 2.36 1.34 1.50 0.29 0.58 0.44 0.10 0.31 0.11 0.50 1.30 1.83 1.96 3.73 3.35 1.23 4 ER1a ExonRegion 0 0.35 0.00 0.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 2.19 0.00 0.49 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.38 0.82 2.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.18 3.84 0.00 0.00 0.84 1.18 7 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER3a ExonRegion 0 0.22 0.00 0.44 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 1.44 9 E3a_E4a KnownJunction 0 3.11 0.00 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER4a ExonRegion 0 0.38 0.00 0.63 0.50 0.61 0.84 0.30 0.00 0.42 1.17 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.76 1.87 0.00 0.49 4.18 0.00 1.35 11 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.83 1.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.09 0.00 0.00 12 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.59 0.26 0.39 0.00 0.53 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.63 0.00 2.47 4.93 0.60 0.00 13 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER6a ExonRegion 0 0.54 0.52 0.69 0.00 1.36 0.00 0.00 0.65 0.44 0.43 0.00 0.00 0.00 0.44 0.00 0.00 0.84 1.40 4.18 1.56 3.20 0.53 0.75 15 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 3.86 2.36 5.93 0.00 0.00 16 ER7a ExonRegion 0 1.24 0.00 1.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 0.00 0.00 0.00 0.12 2.91 0.28 3.78 0.00 0.00 17 E7a_E8a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER8a ExonRegion 0 0.48 0.56 0.00 0.17 0.00 0.00 0.41 0.00 0.00 0.55 0.02 0.00 0.00 0.02 0.00 1.43 0.00 5.25 3.07 2.01 3.45 0.53 2.83 19 E8_Da KnownBoundary 0 0.00 3.35 0.00 1.43 0.00 0.00 2.16 0.00 1.79 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 3.12 0.00 21 ER8b ExonRegion 0 0.40 2.35 1.03 0.75 0.00 0.23 0.53 0.49 1.62 0.57 0.00 0.00 0.00 0.08 0.31 0.00 0.00 3.46 3.00 2.00 0.97 0.26 1.66 22 ER9a ExonRegion 0 8.25 12.44 5.58 3.88 9.82 9.67 2.33 4.73 2.67 3.01 0.59 1.17 0.89 0.20 0.63 0.23 1.01 2.60 3.65 3.92 4.30 3.58 2.47 23 IG2 Intergenic 0 2.81 6.46 6.52 4.02 5.20 16.79 4.67 5.20 4.85 3.42 1.01 0.67 1.02 0.91 1.38 0.33 1.66 5.01 3.63 4.41 2.88 2.96 4.28 24 IG2_SR1 SilentIntergenicRegion 0 7.28 17.27 9.30 5.18 13.21 26.92 7.41 3.20 6.75 5.07 1.13 1.17 0.00 0.00 0.82 0.36 2.04 3.83 1.81 6.19 5.29 4.42 1.93 25 IG2_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 14.83 16.29 12.52 6.74 5.69 10.89 5.14 13.28 10.58 6.56 1.97 0.78 0.00 0.00 3.87 1.71 4.73 11.14 3.33 9.12 4.49 4.07 4.18 26 IG2_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 3.00 8.84 5.05 6.05 7.58 16.48 4.08 6.05 6.04 5.16 0.90 1.14 1.57 1.12 2.18 0.83 1.23 8.22 3.54 5.43 2.31 2.53 4.40 27 IG2_SR4 SilentIntergenicRegion 0 1.35 4.64 7.12 2.86 2.95 17.32 4.24 5.26 4.36 2.50 0.97 0.11 0.84 0.96 1.07 0.11 2.14 3.51 4.59 3.49 2.67 3.52 4.53