Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 CA12 Gene 0 7.27 1.23 3.03 0.21 0.64 1.75 0.85 0.20 0.75 1.02 0.15 0.78 0.72 0.37 0.93 0.61 0.55 1.34 1.49 0.85 413.87 304.54 402.81 2 178638 Transcript 0 1.32 0.10 0.56 0.03 0.04 0.15 0.03 0.06 0.12 0.24 0.01 0.05 0.00 0.01 0.00 0.00 0.03 0.21 0.15 0.05 53.42 40.45 68.90 3 422263 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 344366 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 IG23_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.72 0.00 11.38 3.67 1.71 15.11 9.82 3.06 8.50 0.00 0.00 0.00 4.39 1.07 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.45 0.00 0.00 23.14 5.41 8.86 7 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 62.95 13.53 25.35 8 E1_Ac KnownBoundary 0 7.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.95 0.00 197.93 100.18 254.64 9 ER1b ExonRegion 0 4.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 198.33 79.31 171.11 10 ER1c ExonRegion 0 0.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.00 0.00 0.55 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.62 0.00 341.50 113.13 200.67 11 E1a_E2a KnownJunction 0 3.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 308.45 349.03 475.05 12 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.42 0.00 450.97 309.90 648.93 13 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.43 0.00 487.44 396.36 640.19 15 ER3a ExonRegion 0 0.91 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 0.38 0.00 0.68 0.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.33 0.62 0.60 659.39 308.87 473.88 16 E3a_E4a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.53 0.00 0.00 967.93 412.84 399.07 17 ER4a ExonRegion 0 3.76 0.00 1.11 0.00 0.00 1.17 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.70 3.41 0.76 879.67 347.26 497.94 18 E4a_E5a KnownJunction 0 3.78 0.00 1.60 0.00 0.00 2.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 990.66 438.68 806.17 19 ER5a ExonRegion 0 0.57 0.00 2.16 0.00 0.00 0.21 0.00 0.00 0.39 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 1.69 0.00 881.41 438.26 689.50 20 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 2.66 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.87 0.00 0.00 636.43 331.76 393.61 21 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 2.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.54 0.00 0.00 1.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.07 4.18 0.00 890.20 398.25 689.88 22 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21.46 0.00 1122.31 619.56 962.30 23 ER7a ExonRegion 0 2.05 0.00 2.76 0.00 0.00 2.24 0.00 0.00 1.16 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.44 4.98 0.00 900.13 413.99 738.88 24 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.51 0.00 0.00 2.38 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.15 8.28 0.00 878.10 355.77 506.03 25 ER8a ExonRegion 0 3.40 0.00 1.23 0.00 0.00 4.87 0.00 0.00 1.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.77 3.24 0.00 762.87 344.22 653.44 26 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.93 3.00 24.41 27 E8a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.09 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 1.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 0.00 651.87 292.33 526.35 28 E8a_E11a NovelJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.68 9.06 19.46 29 I8 Intron 0 0.76 0.18 0.44 0.05 0.02 0.18 0.10 0.03 0.26 0.16 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.35 0.33 0.12 71.75 39.63 82.26 30 I8_SR1 SilentIntronRegion 0 1.04 0.15 0.70 0.05 0.06 0.22 0.19 0.06 0.09 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 0.46 0.15 65.89 37.73 83.14 31 I8_SR2 SilentIntronRegion 0 0.97 0.31 0.70 0.10 0.00 0.05 0.20 0.07 0.35 0.13 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.47 0.33 0.04 68.67 51.07 88.31 32 I8_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.45 0.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.22 0.00 0.51 117.27 60.51 97.03 33 I8_SR3 SilentIntronRegion 0 0.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.53 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0.92 0.37 0.10 104.07 46.34 104.21 34 I8_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 94.21 35.31 74.71 35 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 7.95 3.09 25.18 36 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.99 3.12 35.08 37 I9_SR1 SilentIntronRegion 0 0.51 0.00 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.33 0.00 0.00 79.07 41.17 80.72 38 ER10a ExonRegion 0 5.43 2.94 1.18 0.00 0.00 1.29 0.00 0.00 0.46 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.63 3.75 0.00 685.64 312.04 516.81 39 E10a_E11a KnownJunction 0 7.26 3.35 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 1.53 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 0.00 732.49 381.36 644.15 40 ER11a ExonRegion 0 13.68 3.29 5.44 0.54 1.69 3.98 2.44 0.15 1.27 1.92 0.46 1.96 2.43 1.16 3.38 2.05 1.48 2.76 2.61 2.36 686.87 595.53 712.19 41 E11_Da KnownBoundary 0 87.05 56.44 27.97 39.42 78.44 44.29 91.73 38.12 29.14 22.94 36.27 19.66 12.82 27.37 10.01 79.38 53.02 27.82 54.12 44.17 101.31 178.99 142.30 42 E11_Db KnownBoundary 0 19.11 0.00 0.00 0.00 0.00 4.71 0.00 0.00 0.00 2.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 471.92 301.94 438.60 43 ER11b ExonRegion 0 73.63 28.90 2.13 1.94 31.12 31.37 48.92 0.45 1.43 0.48 6.61 32.81 29.87 15.81 16.34 29.72 30.92 14.68 20.29 28.22 331.60 340.82 354.56 44 ER11c ExonRegion 0 6.15 0.50 2.79 0.13 0.22 0.76 0.13 0.32 0.57 0.92 0.03 0.24 0.01 0.05 0.01 0.00 0.15 0.59 0.64 0.23 224.09 187.62 250.94