Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC055876.9 Gene 0 2.33 1.25 2.84 5.94 2.15 3.83 3.93 4.00 4.74 4.90 0.52 1.28 2.07 3.43 3.09 0.48 0.18 4.35 1.27 2.34 1.88 0.84 1.65 2 340249 Transcript 0 1.97 1.37 3.79 8.06 3.07 5.35 5.33 4.31 6.56 6.45 0.50 0.98 3.06 2.52 2.50 0.09 0.05 4.66 0.50 1.88 0.89 0.58 1.59 3 317692 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.09 1.92 0.24 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.28 0.00 9 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER4a ExonRegion 0 0.91 0.00 0.77 1.04 0.26 0.97 0.64 0.00 0.79 1.19 0.00 0.64 0.00 2.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 0.57 0.00 11 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E4a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER5a ExonRegion 0 5.50 2.50 5.89 9.80 3.23 6.88 8.33 8.59 7.33 7.28 1.69 3.32 3.09 4.80 2.10 1.04 0.58 9.03 5.52 3.70 5.02 1.70 3.58 14 E5a_E6a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 3.31 2.90 0.00 0.00 15.36 1.64 0.00 0.00 14.12 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.51 0.00 15 ER6a ExonRegion 0 0.70 0.00 1.96 1.17 1.86 0.69 2.65 1.36 8.52 0.62 0.00 0.00 3.59 1.66 4.03 0.00 0.00 1.35 0.00 0.08 0.00 0.25 0.00 16 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER7a ExonRegion 0 2.62 0.94 3.41 9.26 1.24 0.00 1.24 6.82 6.31 4.53 0.00 0.00 2.56 4.96 2.00 0.00 0.00 5.68 0.00 2.51 1.02 0.97 1.36 18 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER8a ExonRegion 0 0.41 0.89 6.25 13.79 4.06 8.05 9.69 6.68 6.43 13.51 0.44 0.65 2.26 1.46 3.17 0.00 0.00 7.54 0.00 3.03 0.30 0.07 1.52 20 E8a_E9a KnownJunction 0 3.78 5.39 15.52 33.76 11.97 25.21 27.60 15.44 16.93 24.28 2.68 5.70 6.82 9.77 4.45 0.00 0.00 18.07 0.00 6.26 2.66 0.00 8.11 21 E9_Aa NovelBoundary 0 10.30 0.00 1.51 22.01 8.66 5.79 4.11 2.51 7.64 4.86 6.58 0.00 12.66 14.42 0.00 3.16 8.42 0.00 4.24 2.36 11.43 0.00 7.60 22 ER9a ExonRegion 0 4.92 5.33 8.61 20.85 8.10 15.16 9.07 8.55 11.26 19.09 0.66 1.16 1.17 5.10 5.48 0.00 0.00 9.63 0.00 5.04 0.80 0.93 2.94 23 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER10a ExonRegion 0 0.10 0.83 4.25 8.50 0.00 0.00 0.00 2.79 4.41 4.67 0.99 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 1.18 0.00 0.00 2.74 25 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER11a ExonRegion 0 1.81 0.81 2.14 2.96 1.01 7.64 4.46 1.08 2.97 3.00 0.00 0.00 0.00 2.10 1.24 0.00 0.00 2.45 0.00 1.32 0.44 0.00 0.23 27 E11_Da NovelBoundary 0 3.56 8.35 10.82 26.17 12.14 24.36 10.78 10.80 13.92 10.21 5.00 6.00 0.00 4.94 0.00 3.50 4.49 19.48 13.37 18.86 0.00 3.12 0.00 28 E11a_E12a KnownJunction 0 14.67 0.00 9.02 10.69 0.00 7.55 1.90 1.93 7.61 6.69 2.32 0.00 0.00 7.00 4.45 0.00 0.00 5.26 0.00 5.56 0.00 0.00 0.00 29 ER12a ExonRegion 0 2.92 1.33 1.48 4.73 2.65 1.79 3.60 4.77 5.29 4.57 0.63 2.66 4.14 6.18 7.50 1.29 0.36 4.95 1.73 3.91 3.83 1.59 2.55