Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 SERPINA1 Gene 0 65.56 1.24 4.02 7.95 34.25 21.17 10.90 26.78 29.20 18.01 0.05 7.23 0.00 0.10 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.24 0.32 0.35 2 437397 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 355814 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.65 4.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 448140 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 449399 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 2.86 0.00 0.00 0.00 0.00 3.18 4.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 426226 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.38 0.00 0.00 0.00 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 448921 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 437074 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 404814 Transcript 0 0.00 0.00 1.77 0.00 0.00 2.90 0.00 2.55 0.00 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 393088 Transcript 0 0.00 0.00 1.74 1.50 0.00 0.00 3.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 440909 Transcript 0 3.19 0.00 1.66 7.09 0.00 2.27 1.99 13.35 53.93 34.97 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 393087 Transcript 0 1.38 0.00 0.01 0.75 0.99 0.68 0.03 0.01 1.28 0.02 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 402629 Transcript 0 0.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 0.00 14 489769 Transcript 0 0.47 0.12 0.07 0.45 0.15 0.31 0.15 2.21 3.11 2.92 0.00 1.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.14 15 ER1a ExonRegion 0 4.67 0.00 0.00 0.20 4.33 6.09 3.89 0.36 1.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 6.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E1_Ac KnownBoundary 0 94.39 0.00 0.00 3.63 37.95 54.63 8.48 4.56 3.50 3.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER1b ExonRegion 0 42.33 0.00 0.00 2.85 25.05 37.76 8.24 4.01 3.14 2.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER1c ExonRegion 0 40.86 0.97 1.58 4.40 56.86 101.58 17.12 16.46 28.94 18.64 0.00 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.83 20 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 3.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 4.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E1a_E2c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.86 0.00 0.00 0.00 0.00 3.18 4.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E1a_E2d KnownJunction 0 0.00 0.00 1.77 0.00 0.00 2.90 0.00 2.55 0.00 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E1a_E3b KnownJunction 0 3.19 0.00 1.66 7.09 0.00 2.27 1.99 13.35 53.93 34.97 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER1d ExonRegion 0 0.17 0.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 1.40 4.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E1b_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E1b_E2c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E1b_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.65 4.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER2a ExonRegion 0 3.67 0.37 0.68 1.84 1.42 0.49 1.92 2.35 0.49 2.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E2a_E2c KnownJunction 0 6.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 E2a_E2d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.38 0.00 0.00 0.00 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 E2b_E2c KnownJunction 0 0.00 0.00 1.74 1.50 0.00 0.00 3.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 E2b_E2d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 ER2b ExonRegion 0 3.41 1.81 1.23 2.35 0.00 0.00 3.97 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 ER2c ExonRegion 0 1.38 0.00 0.01 0.75 0.99 0.68 0.03 0.01 1.28 0.02 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 E2_Ac KnownBoundary 0 3.26 0.00 0.00 1.23 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 E2_Ad KnownBoundary 0 2.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 ER2d ExonRegion 0 6.35 0.00 1.63 8.18 2.68 0.61 3.97 2.30 3.71 3.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 ER2e ExonRegion 0 6.59 1.89 2.33 9.37 1.81 3.98 0.22 19.38 5.34 4.30 0.00 10.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40 E2c_E3b KnownJunction 0 9.56 0.00 0.00 3.73 0.00 0.00 1.90 25.01 9.72 9.37 0.00 17.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 41 ER2f ExonRegion 0 3.50 2.38 0.46 4.28 0.00 1.20 0.55 27.42 8.35 6.92 0.00 11.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.94 0.00 42 ER3a ExonRegion 0 1.41 0.34 0.20 1.36 0.45 0.92 0.44 6.63 8.85 8.22 0.00 2.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.35 0.00 43 ER3b ExonRegion 0 114.91 1.44 8.05 18.67 73.33 53.07 24.02 72.25 77.86 47.02 0.00 23.50 0.00 0.21 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 0.17 1.38 0.56 44 E3a_E4a KnownJunction 0 257.75 0.00 16.32 34.93 105.60 63.37 26.94 120.92 123.52 83.22 0.00 36.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 45 ER4a ExonRegion 0 374.12 6.15 15.37 32.63 117.39 68.03 45.79 103.94 122.12 74.24 0.73 26.28 0.00 0.31 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 2.49 0.39 2.51 46 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.27 47 E4a_E5a KnownJunction 0 266.86 23.81 15.35 30.90 243.21 111.75 118.14 130.49 113.60 79.51 0.00 12.15 0.00 2.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 48 ER4b ExonRegion 0 0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.47 0.54 0.00 1.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 49 E4b_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 ER5a ExonRegion 0 111.19 5.80 20.69 30.67 164.96 51.20 44.20 95.94 99.66 67.07 0.00 21.88 0.00 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.72 0.42 51 E5_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 52 E5a_E6a KnownJunction 0 95.57 3.29 19.01 40.02 126.57 32.37 34.80 91.84 95.25 69.14 0.00 36.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53 ER5b ExonRegion 0 0.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 0.00 54 ER6a ExonRegion 0 300.91 4.82 15.06 24.00 119.31 39.26 31.16 74.85 76.83 45.38 0.00 11.56 0.00 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.45 0.84 0.59 55 E6_Da KnownBoundary 0 80.90 5.79 5.80 6.06 66.21 7.84 17.97 9.90 15.13 14.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 56 E6_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 E6_Dc KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 58 ER6b ExonRegion 0 30.28 3.75 4.62 2.73 31.90 3.10 6.62 1.99 4.85 5.73 0.00 3.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 59 E6_Dd KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 60 ER6c ExonRegion 0 22.58 2.03 3.68 1.36 23.19 1.83 5.74 0.00 2.88 4.21 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 61 ER6d ExonRegion 0 4.14 1.69 0.41 0.00 6.91 0.76 0.39 0.00 0.98 1.00 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 62 ER6e ExonRegion 0 0.20 0.00 0.12 0.06 0.00 0.00 0.00 0.16 0.12 0.00 0.00 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00