Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AL133445.1 Gene 0 0.39 0.50 0.61 1.99 38.78 0.45 0.53 81.51 9.85 67.10 0.12 0.33 0.62 0.19 0.31 1.18 0.81 0.45 0.58 0.20 0.34 0.32 0.99 2 322564 Transcript 0 0.51 0.64 0.79 1.85 44.50 0.29 0.57 87.26 10.03 71.89 0.03 0.45 1.16 0.20 0.17 0.79 1.00 0.28 0.95 0.22 0.33 0.13 0.93 3 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.39 9.85 0.00 0.00 25.30 2.47 27.94 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 1.14 1.27 0.00 0.61 0.00 0.00 0.00 0.00 4 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 16.55 0.00 0.00 10.43 1.07 20.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 I1 Intron 0 0.27 0.18 0.25 0.56 8.04 0.01 0.27 24.42 1.54 18.38 0.10 0.13 0.17 0.13 0.50 0.37 0.22 0.56 0.71 0.71 0.27 0.17 0.67 6 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.14 0.14 0.41 0.63 4.66 0.00 0.21 22.16 1.32 17.27 0.09 0.00 0.17 0.18 0.43 0.27 0.59 1.11 0.86 0.81 0.49 0.37 0.99 7 I1_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.18 0.00 0.00 0.82 8.92 0.00 0.22 28.33 1.54 24.32 0.00 0.00 0.32 0.11 1.43 0.74 0.55 0.46 0.48 0.53 0.00 0.00 0.00 8 I1_SR2 SilentIntronRegion 0 0.34 0.21 0.21 0.50 9.38 0.02 0.30 24.95 1.64 18.19 0.11 0.20 0.15 0.11 0.42 0.37 0.03 0.34 0.67 0.68 0.21 0.10 0.61 9 ER2a ExonRegion 0 0.56 0.00 0.00 0.10 29.77 0.00 0.00 58.34 1.79 43.40 0.00 1.93 2.54 0.00 0.00 3.57 0.00 0.00 0.00 0.00 1.20 0.00 0.22 10 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.37 4.33 0.00 0.00 22.84 1.48 21.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E2a_E3a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 1.27 31.66 0.00 0.00 68.02 7.73 28.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.24 12 ER3a ExonRegion 0 0.61 0.18 0.00 2.03 26.43 0.00 0.00 66.97 5.11 40.87 0.00 0.00 0.00 0.76 0.00 1.32 0.00 1.56 3.61 0.00 0.83 0.00 1.44 13 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 2.57 0.00 1.40 46.52 0.00 0.00 58.57 5.41 38.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.97 0.00 0.00 14 ER4a ExonRegion 0 0.00 1.14 0.88 1.10 48.16 0.00 0.00 61.10 2.94 42.78 0.00 2.14 0.00 0.00 0.00 3.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 0.00 0.00 15 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.54 1.86 40.83 0.00 0.00 82.76 5.93 58.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.51 1.50 43.92 0.00 0.00 90.12 3.64 73.86 0.00 0.19 0.00 0.74 0.00 0.00 2.44 0.00 2.84 0.95 1.22 0.00 3.26 17 E5_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 11.04 0.00 0.00 29.70 1.50 10.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.42 1.53 62.73 0.00 0.00 82.23 2.92 94.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.98 0.00 8.94 2.62 0.00 0.00 0.00 19 E6_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 2.06 23.51 0.00 0.00 18.69 6.16 7.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.00 0.00 20 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 0.85 66.24 0.00 0.00 83.36 6.71 80.61 0.00 0.00 2.92 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 1.20 0.40 0.00 0.00 0.00 21 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.06 82.60 0.00 0.00 89.71 8.54 68.28 0.00 0.00 6.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER7a ExonRegion 0 1.14 1.11 1.06 1.62 64.25 0.00 0.00 102.43 11.74 69.45 0.00 0.00 0.44 0.00 1.10 0.00 3.54 0.00 0.91 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E7_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.63 4.00 11.63 0.00 0.00 61.20 4.57 44.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.49 0.00 0.00 3.16 24 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 5.72 0.00 0.00 20.80 0.00 0.00 85.76 15.31 65.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 25 I7 Intron 0 0.10 0.49 0.53 0.89 35.22 0.18 0.39 40.41 4.83 29.22 0.00 0.00 0.19 0.11 0.22 0.00 0.00 0.45 0.62 0.10 0.00 0.20 0.29 26 I7_SR1 SilentIntronRegion 0 0.10 0.49 0.53 0.89 35.29 0.18 0.39 40.49 4.84 29.27 0.00 0.00 0.19 0.11 0.22 0.00 0.00 0.45 0.62 0.10 0.00 0.20 0.29 27 E8_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.50 19.78 0.00 0.00 74.14 3.99 39.68 0.00 0.00 0.00 0.00 5.19 0.00 0.00 1.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER8a ExonRegion 0 0.72 2.19 1.12 1.19 61.97 0.99 0.00 108.56 16.11 95.42 0.00 0.00 0.35 0.19 1.11 0.00 0.00 0.00 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E8a_E9a KnownJunction 0 3.70 0.00 3.58 0.00 58.15 0.00 0.00 154.23 16.96 122.71 0.00 0.00 6.17 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER9a ExonRegion 0 0.83 0.00 1.12 5.66 53.59 1.04 0.75 133.99 17.75 100.74 0.00 0.00 0.92 0.28 0.58 0.00 1.25 1.31 0.00 0.00 0.00 1.19 1.46 31 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 4.58 4.99 53.14 0.00 0.00 139.61 11.40 102.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.24 32 ER10a ExonRegion 0 0.00 3.12 0.51 0.95 45.53 0.22 0.84 98.31 11.98 82.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.79 2.28 0.84 0.71 0.00 0.00 0.85 0.80 0.29 33 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 40.92 2.67 9.01 120.68 16.87 110.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 ER11a ExonRegion 0 0.74 0.00 1.28 4.08 50.89 0.44 1.10 128.80 13.71 98.51 0.00 0.00 0.78 0.00 0.72 2.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.78 0.00 3.58 35 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 3.63 57.05 0.00 0.00 100.26 20.51 99.17 0.00 0.00 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 36 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 2.36 32.43 0.07 0.52 92.84 14.85 82.94 0.00 0.98 0.56 0.39 0.00 1.01 0.00 0.94 0.00 1.45 0.00 0.71 1.53 37 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 5.63 39.47 0.00 0.00 85.48 16.32 92.83 0.00 5.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 ER13a ExonRegion 0 0.54 0.00 0.93 2.00 29.03 1.82 1.97 53.52 13.04 55.45 0.49 0.17 0.98 0.29 0.00 0.76 0.00 0.70 0.00 0.00 0.00 0.53 0.75 39 IG33_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 1.41 0.00 0.82 0.40 9.14 0.00 0.00 15.59 6.92 20.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40 IG33_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.20 0.27 1.05 4.89 43.65 1.97 0.36 90.57 14.03 75.98 0.39 0.00 0.00 0.54 1.12 0.00 0.00 1.26 1.50 0.57 0.59 0.42 0.00 41 IG33_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.25 0.36 0.33 4.05 87.51 2.03 0.85 114.27 15.06 66.33 0.46 0.00 0.00 0.16 0.87 0.53 0.56 0.87 0.76 0.39 0.39 0.43 0.35