Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C14orf54 Gene 0 0.62 4.08 1.06 4.19 4.28 0.96 2.81 3.74 2.30 1.94 3.03 1.70 3.91 4.35 1.93 2.42 2.78 1.23 1.02 3.09 0.45 0.42 0.60 2 311864 Transcript 0 0.95 5.83 0.00 6.65 3.35 2.49 0.73 9.83 1.16 3.90 3.23 1.68 1.40 7.25 0.52 5.94 0.00 1.32 3.09 1.46 0.59 1.09 1.67 3 334061 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 2.30 11.77 0.66 8.79 3.87 0.00 5.27 4.22 3.88 3.09 4.89 3.41 1.40 3.27 2.22 3.50 4.57 1.99 0.00 3.85 0.80 0.55 1.06 5 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 3.35 3.81 19.15 8.66 0.00 4.20 3.74 3.96 4.54 2.26 0.00 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 4.68 0.00 0.00 2.72 3.18 4.35 6 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 1.27 0.00 0.00 12.60 0.00 0.00 0.00 7.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.76 0.00 7 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 3.22 0.00 6.56 0.00 0.00 6.18 6.12 3.24 0.00 2.16 0.00 0.00 0.00 4.45 4.36 4.02 2.16 16.28 9.46 2.97 0.00 0.00 8 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.78 0.00 0.57 4.52 1.77 2.41 0.00 5.33 1.19 4.58 3.99 1.23 1.30 3.26 0.79 0.00 0.00 0.00 2.78 0.00 9 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.00 0.00 2.90 0.00 2.09 3.07 0.00 2.05 0.00 8.12 7.00 0.00 0.00 11.31 2.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER3a ExonRegion 0 0.00 2.45 1.51 4.69 2.37 1.75 1.52 2.29 2.52 0.98 3.89 3.02 4.82 7.06 2.81 0.82 5.89 1.66 0.00 2.88 0.61 1.72 0.00 11 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 3.29 0.00 0.00 3.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER4a ExonRegion 0 1.25 3.29 0.75 3.24 6.68 2.11 3.38 0.86 1.83 2.14 3.24 0.78 2.84 4.57 1.47 3.79 4.27 1.12 0.00 3.00 0.00 0.00 0.00 13 E4a_E5a KnownJunction 0 3.48 2.96 3.19 1.66 0.00 2.73 0.00 1.97 1.10 0.00 4.53 0.00 0.00 7.42 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 14 ER5a ExonRegion 0 0.72 4.18 2.26 3.10 4.94 0.43 1.83 4.99 3.24 2.68 3.42 0.33 5.26 6.21 2.46 2.19 3.02 1.40 1.53 4.19 0.81 0.00 0.81 15 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.50 0.00 0.00 0.00 8.17 0.00 2.28 2.53 0.00 6.82 4.59 4.45 0.00 0.00 1.66 3.76 2.68 0.00 0.00 0.00 16 ER6a ExonRegion 0 0.00 2.12 0.00 4.84 1.42 3.67 0.65 8.22 0.88 3.82 6.51 2.47 2.68 2.72 5.51 2.79 0.00 2.64 4.36 0.48 0.00 0.00 0.00 17 E6_Da KnownBoundary 0 0.00 5.00 0.00 10.79 7.47 0.00 2.25 9.69 1.79 7.25 7.21 6.30 0.00 0.00 0.00 8.72 0.00 4.15 4.42 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E6a_E6b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER6b ExonRegion 0 0.95 5.83 0.00 6.65 3.35 2.49 0.73 9.83 1.16 3.90 3.23 1.68 1.40 7.25 0.52 5.94 0.00 1.32 3.09 1.46 0.59 1.09 1.67 20 E6_Ab KnownBoundary 0 3.78 11.58 0.00 5.79 3.23 2.27 1.77 10.76 1.50 1.07 2.05 0.00 6.82 4.83 4.45 11.79 0.00 0.00 4.05 6.52 2.97 2.94 3.84 21 ER6c ExonRegion 0 0.34 5.65 0.00 5.97 3.97 1.57 5.48 6.68 1.22 1.89 2.11 5.12 5.26 2.58 2.11 3.99 1.28 2.13 1.50 3.35 0.55 0.25 1.42 22 E6b_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.47 0.00 0.00 0.00 0.00 4.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.07 0.00 0.00 0.30 25 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.63 7.08 5.53 0.00 2.34 2.66 1.90 0.59 0.00 2.75 1.33 0.40 0.00 2.05 0.00 0.00 2.17 2.96 0.00 0.00 0.95 26 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER9a ExonRegion 0 0.00 5.09 0.00 1.83 5.02 0.57 4.09 0.81 0.58 0.53 0.60 1.09 4.83 0.42 1.28 0.93 1.03 0.00 0.00 2.64 0.00 0.00 0.00