Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	GRTP1	Gene	0	4.08	1.39	3.70	3.05	4.07	1.43	1.75	4.12	1.97	0.73	0.30	2.05	1.93	1.68	2.55	1.97	1.87	2.43	1.86	1.70	18.60	14.37	19.86
2	476439	Transcript	0	0.77	1.32	0.35	0.39	0.56	0.21	0.20	0.10	0.48	0.00	0.00	0.64	0.22	0.00	0.00	0.00	1.42	0.60	0.00	0.12	1.95	3.74	5.24
3	375431	Transcript	0	8.52	0.89	5.03	4.01	7.04	3.00	3.58	5.82	2.29	1.00	0.56	4.21	3.57	1.79	2.67	2.59	1.21	3.90	2.33	1.71	31.37	20.05	24.92
4	375430	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
5	326039	Transcript	0	3.24	1.71	5.63	2.40	2.16	1.54	1.11	7.05	2.46	1.08	0.37	1.12	3.66	3.40	4.52	2.81	4.46	4.93	2.88	2.91	11.23	8.27	15.65
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.00	0.00
7	ER1b	ExonRegion	0	0.20	0.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.77	1.79	2.10
8	ER1c	ExonRegion	0	4.04	3.51	0.19	0.00	2.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	23.24	11.55	23.40
9	E1_Da	KnownBoundary	0	10.89	5.99	0.00	0.00	4.24	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	23.97	11.27	32.61
10	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.11	0.00	0.00	0.00	5.76	11.78
11	ER1d	ExonRegion	0	3.17	1.45	1.23	0.00	3.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.14	3.29	13.33
12	E1b_E2a	KnownJunction	0	3.04	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	0.00
13	ER2a	ExonRegion	0	0.14	0.38	0.65	0.00	0.00	1.88	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.51	0.33	0.00	1.00	20.11	9.01	18.94
14	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	3.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.77	0.00	0.00	0.00	2.84	5.45	4.35
15	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.20	13.71	3.12	40.04
16	ER3a	ExonRegion	0	3.07	1.93	1.39	1.55	2.25	0.84	0.81	0.39	0.28	0.00	0.00	2.57	0.88	0.00	0.00	0.00	0.89	0.28	0.00	0.49	4.59	3.75	4.84
17	E3_Da	NovelBoundary	0	9.63	0.00	0.00	3.53	0.00	0.00	0.00	0.00	1.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.52	11.06	5.63	16.05
18	ER4a	ExonRegion	0	0.97	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00	1.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	17.49	13.68	24.77
19	E4_Ab	KnownBoundary	0	3.78	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	2.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.16	0.00	0.00	6.30	16.78	8.71
20	ER4b	ExonRegion	0	1.12	0.70	0.00	0.00	1.21	0.29	0.00	1.64	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	1.92	25.82	11.28	15.44
21	E4a_E5a	KnownJunction	0	3.78	6.31	0.00	0.00	0.00	2.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	40.77	8.39	11.95
22	ER5a	ExonRegion	0	4.30	1.66	0.75	1.10	5.91	0.48	1.19	2.10	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	28.93	16.67	31.88
23	E5a_E6a	KnownJunction	0	7.11	2.83	0.00	3.76	6.96	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	31.32	17.21	67.61
24	ER6a	ExonRegion	0	6.28	0.25	0.09	1.41	3.64	0.79	0.66	1.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.13	1.12	28.24	19.78	35.45
25	E6a_E7a	KnownJunction	0	6.37	0.00	0.00	1.93	0.00	2.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	31.01	10.29	35.94
26	I6_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.23	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.81	2.08	20.56
27	I6_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.58	0.00	1.02	1.23	1.49	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.79	7.89	1.29	9.63
28	I6_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.31	0.00	0.39	0.18	0.00	0.00	0.60	0.00	0.93	0.15	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.82	0.00	0.28	11.69	3.70	11.85
29	I6_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.32	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.31	0.00	0.50	0.69	0.00	0.00	9.28	2.82	8.84
30	I6_SR4	SilentIntronRegion	0	1.15	0.00	0.12	0.34	0.65	0.41	0.21	0.08	0.35	0.11	0.00	0.57	0.00	0.00	0.16	0.00	0.21	0.34	0.00	0.14	10.60	2.93	10.82
31	I6_AR5	ActiveIntronRegion	0	2.05	0.20	0.39	0.94	0.35	0.76	0.26	0.75	0.36	0.33	0.00	0.00	0.75	0.13	0.18	0.00	0.64	0.47	0.00	0.00	11.29	3.23	10.69
32	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	7.42	3.70	10.10	0.00	1.68	5.91	1.42	0.00	2.58	25.21	0.00	2.47	0.00	12.05	4.21	4.44	0.00	2.75	17.98	8.14	8.19
33	ER7a	ExonRegion	0	3.23	0.49	1.67	3.06	2.15	1.18	0.99	3.50	1.15	0.54	0.00	0.00	0.00	1.97	5.03	3.50	2.92	0.00	1.84	1.88	30.98	21.75	39.76
34	E7a_E8a	KnownJunction	0	3.78	2.63	0.00	3.93	3.82	0.00	2.08	2.51	1.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	36.39	19.59	45.41
35	E8_Aa	NovelBoundary	0	18.08	3.35	5.56	7.13	15.28	4.71	0.00	6.78	2.49	3.01	2.68	0.00	0.00	4.65	0.00	11.88	13.46	0.00	4.42	3.26	23.10	15.06	19.63
36	ER8a	ExonRegion	0	6.16	0.66	8.20	8.29	6.07	2.37	3.08	5.19	5.62	2.71	0.78	0.98	1.06	4.84	6.75	4.23	3.48	6.18	5.57	2.37	45.41	34.34	45.03
37	E8_Da	KnownBoundary	0	12.37	0.00	13.93	5.99	0.00	0.00	4.50	4.48	4.11	4.75	2.68	0.00	0.00	2.47	4.45	0.00	3.65	6.92	8.47	0.00	40.71	13.78	40.72
38	E8a_E9a	KnownJunction	0	7.48	0.00	1.30	0.00	0.00	2.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.70	0.00	0.00	34.53	5.82	23.65
39	ER8b	ExonRegion	0	3.36	0.91	7.57	5.56	1.60	0.82	0.52	5.84	6.63	0.87	0.63	0.00	0.00	2.14	4.33	5.14	0.46	2.85	4.25	1.85	18.19	10.11	18.55
40	E8_Db	KnownBoundary	0	3.78	0.00	5.17	1.76	7.89	0.00	0.00	7.80	8.59	0.00	2.11	0.00	0.00	4.94	0.00	0.00	3.65	5.43	14.87	0.00	19.46	17.57	19.38
41	ER8c	ExonRegion	0	3.24	1.71	5.63	2.40	2.16	1.54	1.11	7.05	2.46	1.08	0.37	1.12	3.66	3.40	4.52	2.81	4.46	4.93	2.88	2.91	11.23	8.27	15.65
42	E8_Dc	NovelBoundary	0	427.93	377.30	1383.98	1559.01	402.72	277.51	414.25	1296.34	1327.68	1078.37	92.55	105.63	168.17	47.03	158.35	455.01	254.60	2014.14	429.94	460.40	193.61	137.90	467.11
43	I8	Intron	0	6.40	0.00	4.05	4.09	5.93	0.74	1.87	3.63	2.60	0.34	0.39	0.72	0.78	1.50	2.65	3.59	0.67	0.93	3.85	2.57	19.53	17.64	30.19
44	I8_SR1	SilentIntronRegion	0	3.88	0.00	1.33	1.25	0.00	0.00	0.55	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.53	5.21	15.42
45	I8_AR2	ActiveIntronRegion	0	6.55	0.00	4.20	4.25	6.25	0.78	1.94	3.83	2.72	0.36	0.41	0.76	0.82	1.58	2.65	3.79	0.70	0.98	4.06	2.71	20.21	18.33	31.04
46	E9_Aa	NovelBoundary	0	58.60	12.43	17.39	12.02	75.04	19.82	42.18	18.61	18.46	0.00	7.11	5.85	7.30	4.89	8.90	36.49	16.74	13.72	25.69	3.20	35.27	37.41	82.72
47	ER9a	ExonRegion	0	9.55	1.78	8.75	8.02	14.08	3.56	7.15	11.65	4.57	2.00	1.13	8.41	7.14	3.58	5.34	5.19	2.41	6.09	4.65	3.42	28.21	34.28	26.20
48	IG15	Intergenic	0	13.63	2.73	2.45	2.18	5.75	6.40	2.13	4.84	4.94	1.38	2.08	4.99	0.00	3.90	7.38	3.19	3.54	0.50	2.57	6.85	1.77	8.95	7.88
49	IG15_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	13.70	2.74	2.46	2.19	5.71	6.37	2.14	4.87	4.97	1.38	2.09	5.02	0.00	3.91	7.41	3.18	3.56	0.50	2.58	6.89	1.78	8.98	7.92