Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	RP11-347N5.2	Gene	0	0.78	18.92	5.66	12.10	5.75	5.85	28.62	9.18	2.26	3.25	0.00	0.20	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	19.10	68.47	56.98	4.40	0.96	5.05
2	418923	Transcript	0	0.38	10.79	3.42	6.25	4.28	4.82	12.64	3.38	0.92	1.77	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	12.41	45.42	31.12	2.80	0.66	3.24
3	437115	Transcript	0	0.34	4.18	1.40	3.52	1.40	0.52	11.06	4.79	0.79	1.11	0.00	0.40	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	4.17	8.36	18.82	1.06	0.04	0.62
4	IG44_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	1.96	2.74	2.00	4.60	5.64	4.64	2.34	1.95	3.72	2.01	4.37	1.52	1.22	10.70	3.01	5.26	6.40	3.73	2.95	2.51	2.21	2.58	2.72
5	IG44_SR3	SilentIntergenicRegion	0	4.08	1.86	2.96	4.56	7.05	5.02	4.16	2.35	3.36	3.83	2.98	16.78	4.01	5.56	3.03	4.52	1.34	0.63	1.94	1.73	0.70	1.91	1.49
6	ER1a	ExonRegion	0	2.34	67.73	17.30	36.14	21.11	21.81	46.02	16.24	4.36	5.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	60.95	281.34	140.82	17.39	4.61	17.59
7	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	29.99	18.21	47.61	48.30	29.87	99.76	17.99	5.35	4.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	145.00	232.95	143.62	8.71	15.37	4.35
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.66	0.00	0.00	4.94	1.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	I1	Intron	0	2.61	140.30	15.78	30.76	14.64	15.53	32.94	10.86	4.55	6.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	32.86	163.00	116.03	14.78	10.67	7.77
10	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	3.72	120.53	16.45	32.69	19.14	11.95	29.54	13.84	3.75	6.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	33.32	226.07	92.74	13.44	11.12	10.86
11	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.52	162.46	15.31	29.22	10.25	19.41	36.88	7.96	5.43	7.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	32.83	100.81	141.40	16.36	10.36	4.74
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	191.08	29.63	49.61	25.13	23.91	68.54	13.43	12.41	11.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	98.87	125.18	205.37	20.57	14.14	7.26
13	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.06	0.00	0.49	1.76	3.41	5.97	0.08	0.73	2.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	2.76	9.39	0.88	0.00	2.43
14	E2a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	Ix	Intron	0	0.13	9.76	5.87	6.10	1.47	1.65	22.81	4.63	1.16	2.38	0.00	0.78	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	6.26	22.63	42.02	1.33	0.13	2.20
16	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	0.23	10.92	7.14	5.49	1.81	1.85	15.04	5.36	1.25	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.38	27.59	34.40	1.53	0.04	1.93
17	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.23	12.50	12.01	11.61	1.80	1.53	37.39	6.93	1.48	3.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	17.14	57.01	0.00	0.45	0.41
18	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	9.65	3.67	7.86	1.48	1.21	34.78	3.42	1.15	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.09	23.35	47.22	1.86	0.00	2.90
19	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	5.75	2.43	3.67	0.00	1.20	24.78	2.98	0.30	1.83	0.00	0.47	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	2.79	16.51	53.15	1.19	0.00	2.11
20	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	6.18	3.50	5.11	1.39	2.38	26.93	3.88	0.88	0.92	0.00	4.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.87	13.86	48.65	0.77	0.36	3.31
21	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	8.28	1.57	1.74	0.00	0.79	16.71	2.21	1.97	0.37	0.00	6.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.55	6.14	40.53	0.94	0.89	3.15
22	Ix	Intron	0	0.48	11.37	3.15	8.81	3.86	3.45	28.34	2.37	0.52	1.05	0.01	2.60	0.43	0.67	0.17	0.21	0.10	5.09	11.60	28.19	0.81	0.08	1.63
23	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.29	11.92	3.48	11.43	3.71	4.43	36.43	3.15	0.44	1.57	0.02	3.62	0.15	0.69	0.34	0.22	0.08	5.84	15.15	36.08	1.11	0.16	2.57
24	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	10.34	1.23	2.69	5.93	3.75	20.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.85	0.00	0.00	0.00	0.00	2.17	13.63	1.63	0.00	2.17
25	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.78	38.14	9.54	25.51	15.19	7.29	62.77	4.38	1.23	2.82	0.00	3.46	0.94	0.73	0.00	0.18	0.00	12.52	19.18	41.75	2.07	0.00	1.79
26	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.38	9.26	2.56	6.65	3.11	2.84	23.03	1.97	0.53	0.69	0.00	2.22	0.55	0.68	0.12	0.23	0.12	3.99	9.50	24.34	0.43	0.04	1.11
27	Ix	Intron	0	0.55	7.93	3.27	7.92	3.06	1.64	25.69	2.87	0.76	2.09	0.00	1.97	0.38	0.66	0.25	0.08	0.05	5.55	13.78	33.11	0.94	0.06	1.86
28	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.28	7.09	2.29	5.05	2.46	1.47	19.73	1.47	0.74	1.22	0.00	3.61	0.48	1.24	0.42	0.18	0.10	2.19	11.41	27.59	0.65	0.06	1.74
29	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.74	14.49	9.61	12.00	4.72	5.12	40.23	5.96	0.38	1.00	0.00	0.97	0.57	0.46	0.60	0.00	0.00	6.98	9.96	33.15	0.32	0.31	0.86
30	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.59	7.42	2.96	10.07	3.34	1.09	28.89	3.69	0.86	3.25	0.00	0.44	0.24	0.08	0.00	0.00	0.00	8.77	17.08	38.93	1.37	0.00	2.20
31	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	9.34	2.54	6.06	3.48	0.00	14.49	8.34	1.10	4.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	19.03	32.66	37.46	5.07	0.00	3.33
32	ER3a	ExonRegion	0	0.00	6.29	0.71	4.69	0.00	0.71	5.68	7.75	0.00	1.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.91	12.38	23.07	2.57	0.00	0.00
33	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	9.41	1.83	8.92	0.00	0.00	1.72	5.63	0.00	3.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	12.23	14.40	33.43	5.50	0.00	7.34
34	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	Ix	Intron	0	0.79	8.90	2.05	9.14	2.34	0.69	18.37	9.34	2.07	2.99	0.00	0.83	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	2.88	9.95	22.88	0.00	0.00	0.00
36	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.80	8.92	2.06	9.16	2.35	0.69	18.41	9.36	2.08	3.00	0.00	0.83	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	2.88	9.98	22.93	0.00	0.00	0.00
37	ER4a	ExonRegion	0	1.28	4.95	3.31	3.69	4.01	0.00	16.74	5.60	0.56	1.55	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.91	16.28	31.37	1.98	0.00	0.89
38	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	4.91	4.00	0.00	8.52	17.89	3.94	3.47	4.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.67	8.85	38.99	3.15	0.00	4.35
39	E4a_E5b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	Ix	Intron	0	0.22	5.93	2.51	4.51	1.41	1.02	21.70	3.31	0.80	1.46	0.00	0.15	0.06	0.03	0.00	0.02	0.02	3.93	15.23	35.78	0.81	0.09	1.52
41	Ix_SR10	SilentIntronRegion	0	0.22	3.89	1.88	2.80	0.95	0.53	15.72	3.01	0.76	1.38	0.00	0.19	0.11	0.14	0.04	0.00	0.00	3.71	11.75	35.04	1.08	0.09	1.53
42	Ix_AR10	ActiveIntronRegion	0	0.39	6.17	2.30	2.88	0.00	3.46	35.46	2.50	0.74	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.79	15.05	36.29	0.00	0.00	4.51
43	Ix_SR9	SilentIntronRegion	0	0.21	4.92	1.99	3.31	2.09	1.53	24.75	2.80	0.63	0.62	0.00	0.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.65	10.31	32.81	0.43	0.40	0.75
44	Ix_AR9	ActiveIntronRegion	0	0.00	4.79	0.37	2.11	0.31	0.63	17.39	0.90	0.00	1.90	0.00	0.00	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	2.32	10.40	16.27	1.46	0.00	0.47
45	Ix_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.00	7.07	2.53	4.18	0.55	2.09	20.66	2.13	1.06	1.31	0.00	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	6.79	27.74	0.85	0.00	1.62
46	Ix_SR7	SilentIntronRegion	0	0.00	10.49	3.01	8.35	2.53	3.51	26.41	4.40	0.80	1.85	0.00	0.19	0.00	0.14	0.00	0.26	0.00	4.91	20.57	31.50	1.24	0.00	1.69
47	Ix_SR6	SilentIntronRegion	0	0.56	12.64	4.30	12.68	3.02	4.29	28.87	5.66	2.19	3.19	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	8.88	23.45	39.69	0.62	0.16	2.65
48	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.29	7.31	3.63	8.74	2.59	2.51	30.19	4.85	0.85	2.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.52	27.50	61.90	1.39	0.00	0.03
49	Ix_SR5	SilentIntronRegion	0	0.26	12.43	5.72	9.02	2.65	2.40	29.77	5.70	1.28	1.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	5.90	24.15	48.65	0.97	0.09	2.28
50	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.32	28.72	5.90	7.50	4.75	2.49	25.44	7.36	0.56	1.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.02	18.60	58.17	1.40	0.31	0.00
51	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	0.21	5.86	1.65	3.54	1.00	0.89	17.55	2.34	0.48	0.83	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.93	11.02	47.16	0.66	0.08	1.75
52	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.50	3.97	5.22	0.00	1.43	23.77	2.59	1.45	1.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.26	12.41	41.84	0.75	0.47	0.00
53	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.21	5.42	2.36	3.90	1.30	0.58	20.74	3.09	0.70	1.40	0.01	0.10	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	3.32	15.20	33.82	0.72	0.07	1.43
54	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.28	4.67	2.58	7.50	1.39	4.21	30.30	2.84	2.23	1.27	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.60	22.72	25.10	0.24	0.00	0.76
55	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.13	4.73	3.30	5.94	3.38	1.50	24.03	2.08	1.44	1.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35	15.50	24.10	1.15	0.03	1.17
56	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	4.73	3.82	8.33	2.88	1.54	40.04	4.62	1.42	3.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.40	18.69	28.38	0.00	0.22	1.46
57	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.25	5.52	2.95	5.27	1.27	1.14	29.38	4.49	0.87	1.95	0.00	0.05	0.27	0.00	0.00	0.00	0.04	5.62	18.68	36.35	1.22	0.05	1.93
58	ER5a	ExonRegion	0	0.00	1.02	0.61	1.36	6.69	0.00	3.97	0.00	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.77	4.78	18.09	0.00	0.00	0.00
59	ER5b	ExonRegion	0	0.00	11.40	2.67	8.01	2.80	0.00	21.00	3.33	0.00	2.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.87	24.71	43.00	1.14	0.00	3.47
60	E5_Da	KnownBoundary	0	0.00	9.54	4.82	13.42	0.00	0.00	33.65	7.85	0.00	4.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.64	43.30	43.66	2.97	0.00	8.19
61	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
62	ER5c	ExonRegion	0	0.43	9.69	2.99	9.23	3.00	1.87	32.89	10.61	3.38	2.68	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	4.19	13.12	39.66	0.74	0.21	2.24
63	E5_Db	NovelBoundary	0	0.00	15.13	1.83	1.66	0.00	0.00	47.74	9.08	1.33	2.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.80	18.64	43.21	0.00	0.00	3.84
64	Ix	Intron	0	0.00	3.16	1.89	3.15	1.39	2.85	27.08	7.33	2.86	3.10	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	7.37	17.32	36.35	0.57	0.00	0.00
65	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.19	1.91	3.19	1.40	2.88	27.35	7.41	2.89	3.13	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	7.45	17.50	36.73	0.58	0.00	0.00
66	E6_Aa	NovelBoundary	0	3.41	3.29	6.59	5.66	8.66	0.00	42.13	14.29	6.16	3.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.11	39.72	57.72	0.00	0.00	0.00
67	ER6a	ExonRegion	0	0.32	6.69	4.37	5.78	0.40	3.57	30.77	7.30	1.38	4.09	0.00	0.00	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	20.21	29.06	49.56	1.32	0.00	2.64