Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	ITGBL1	Gene	0	2.94	21.20	3.57	10.89	3.51	23.23	5.84	3.67	1.53	3.69	0.00	0.67	1.32	4.21	0.22	0.00	0.00	5.99	10.28	22.65	20.98	5.04	2.00
2	478675	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	376180	Transcript	0	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	3.20	0.49	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	11.61	0.00	0.00
4	376162	Transcript	0	0.00	0.00	0.31	0.00	0.00	4.58	0.66	0.86	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.06	0.00	0.00
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6	490242	Transcript	0	1.29	28.16	2.69	14.79	7.97	21.98	7.43	3.48	0.83	3.14	0.00	0.14	0.36	5.08	0.00	0.00	0.00	7.25	13.28	26.61	9.91	5.19	1.40
7	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.33	0.29	0.00	0.00	3.22	0.43	0.83	1.18	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.44	0.00	0.34	16.60	1.34	0.00
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	21.13	0.00	0.00
9	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	21.40	0.00	0.00
10	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	24.46	0.00	0.00
11	E2a_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	6.41	0.98	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.77	21.02	0.00	0.00
13	E2_Ab	KnownBoundary	0	0.00	2.96	0.00	0.00	0.00	5.34	0.00	2.55	0.00	1.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	43.86	0.00	0.00
14	ER2c	ExonRegion	0	1.04	1.70	0.24	0.00	0.00	8.50	0.15	0.90	0.00	0.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.53	42.95	2.04	1.44
15	E2b_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	33.11	0.00	1.73	1.56	3.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	25.21	0.00	0.00
16	E3_Ac	NovelBoundary	0	0.00	5.46	1.60	0.00	0.00	4.71	4.24	4.44	0.00	2.66	0.00	0.00	0.00	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	15.44	2.76	3.84
17	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.31	0.00	0.00	4.58	0.66	0.86	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.06	0.00	0.00
18	ER3b	ExonRegion	0	0.00	0.96	1.23	0.32	0.00	19.63	2.65	4.07	0.07	2.29	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	22.81	1.47	2.07
19	ER3c	ExonRegion	0	0.00	2.03	1.23	1.36	0.00	20.17	2.65	5.19	1.24	2.29	0.00	0.00	0.00	1.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	24.24	2.08	2.94
20	ER3d	ExonRegion	0	1.91	4.18	2.56	4.10	0.53	8.69	0.61	5.54	1.77	1.71	0.00	1.75	0.00	8.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.86	40.75	7.08	3.10
21	E3b_E4a	KnownJunction	0	6.52	6.38	0.00	0.00	4.33	8.69	1.81	6.94	1.79	1.21	0.00	0.00	0.00	2.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.49	46.21	14.45	3.59
22	ER4a	ExonRegion	0	4.08	3.09	4.97	4.06	0.57	26.14	1.54	6.46	0.91	0.56	0.00	5.03	3.20	8.13	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	1.63	34.42	9.15	3.77
23	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	8.62	2.63	7.06	0.00	19.36	0.00	11.54	1.71	3.33	0.00	13.95	0.00	12.36	0.00	0.00	0.00	4.10	0.00	0.00	54.18	10.35	0.00
24	ER5a	ExonRegion	0	0.86	5.54	1.62	3.26	0.85	18.85	0.25	6.41	1.92	2.30	0.00	1.32	5.89	7.08	0.00	0.00	0.00	2.49	0.00	1.54	51.92	4.82	6.37
25	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	3.03	3.55	1.86	8.32	17.38	2.25	9.12	2.92	2.87	0.00	0.00	0.00	9.95	0.00	0.00	0.00	2.28	0.00	0.00	63.32	7.90	0.00
26	ER6a	ExonRegion	0	3.56	4.53	2.85	3.42	3.02	24.98	1.15	5.12	2.90	6.04	0.00	2.86	6.99	6.70	0.00	0.00	0.00	2.49	0.00	0.77	57.16	6.61	2.65
27	E6a_E7b	KnownJunction	0	3.63	3.35	4.94	3.16	0.00	28.00	1.68	4.31	1.19	4.73	0.00	0.00	0.00	6.83	0.00	0.00	0.00	1.74	0.00	0.00	73.95	8.51	4.35
28	ER7a	ExonRegion	0	0.26	0.76	0.46	0.34	0.00	3.21	0.33	0.86	0.15	0.86	0.00	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	8.81	1.56	0.37
29	ER7b	ExonRegion	0	1.73	2.81	2.87	1.91	2.20	24.07	0.97	5.79	0.08	4.09	0.00	0.00	1.35	8.80	0.00	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	53.16	6.68	0.50
30	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	3.16	2.54	3.60	10.95	33.33	0.00	6.49	0.00	2.71	0.00	0.00	0.00	7.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	38.86	13.90	0.00
31	ER8a	ExonRegion	0	1.85	2.47	3.57	3.46	0.75	16.77	1.12	2.60	0.00	2.87	0.00	0.00	3.37	10.19	0.00	0.00	0.00	0.28	0.00	3.13	41.34	8.87	1.05
32	E8_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.47	0.00	0.00	0.00	2.07	0.00	6.01	0.00	0.00	0.00
33	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	3.29	3.16	2.00	0.00	7.15	0.00	2.51	0.00	4.06	0.00	0.00	0.00	11.83	0.00	0.00	0.00	2.03	0.00	0.00	36.63	3.12	3.41
34	ER8b	ExonRegion	0	0.00	0.85	1.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00
35	ER9a	ExonRegion	0	0.00	7.99	3.50	1.36	0.00	7.47	1.32	1.73	0.35	4.59	0.00	0.00	0.00	13.92	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	0.91	40.30	2.98	1.89
36	ER9b	ExonRegion	0	2.85	4.31	4.68	4.65	0.99	28.75	1.38	2.03	3.20	4.92	0.00	0.00	3.00	8.57	0.00	0.00	0.00	2.03	0.00	4.86	48.33	8.10	2.61
37	E9a_E10a	KnownJunction	0	3.78	0.00	3.08	6.26	0.00	20.33	0.00	2.30	1.79	5.78	0.00	0.00	0.00	9.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	60.17	14.57	4.01
38	I9_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.42	13.58	2.48	7.94	1.84	9.53	3.47	1.54	1.40	0.74	0.00	0.00	0.28	0.74	0.00	0.00	0.00	6.86	11.54	19.98	0.40	0.08	0.37
39	I9_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	8.56	0.26	2.99	1.31	4.37	0.74	0.36	0.26	0.72	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	2.13	9.83	19.86	0.15	0.00	0.62
40	E10_Aa	NovelBoundary	0	0.00	2.70	0.00	3.46	0.00	13.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	15.63	12.05	26.27	0.00	0.00	0.00
41	ER10a	ExonRegion	0	0.46	11.08	5.70	7.38	1.24	32.20	1.93	7.61	2.78	7.82	0.00	0.08	1.81	11.33	0.92	0.00	0.00	6.58	18.64	23.74	43.07	10.84	3.19
42	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.83	8.66	0.00	34.75	1.63	4.52	0.00	9.91	0.00	0.00	0.00	7.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	48.87	10.16	8.54
43	I10	Intron	0	0.00	5.85	0.83	3.38	0.94	3.33	2.07	0.52	1.11	0.17	0.00	0.36	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	4.55	12.05	22.22	0.11	0.21	0.00
44	I10_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	5.87	0.83	3.39	0.95	3.34	2.08	0.52	1.12	0.17	0.00	0.36	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	4.57	12.10	22.30	0.11	0.21	0.00
45	ER11a	ExonRegion	0	3.52	18.88	2.58	9.04	4.51	34.34	3.48	6.59	1.89	9.39	0.00	1.88	6.22	11.05	1.48	0.00	0.00	1.02	6.68	19.24	33.39	9.06	2.81
46	E11_Da	KnownBoundary	0	0.00	16.31	3.22	6.59	0.00	31.40	0.00	0.00	1.27	4.27	0.00	0.00	6.17	16.07	0.00	0.00	0.00	0.00	3.58	24.16	14.21	5.14	3.41
47	E11_Db	KnownBoundary	0	7.11	3.35	6.77	4.03	0.00	21.81	0.00	9.65	2.46	3.33	0.00	0.00	0.00	0.00	4.45	0.00	0.00	0.00	0.00	9.52	8.40	0.00	0.00
48	E11b_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	2.00	8.66	9.88	0.00	2.55	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	7.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.69	5.88	0.00
49	ER11b	ExonRegion	0	5.16	11.82	7.35	8.26	6.35	40.69	0.58	6.91	2.78	6.09	0.00	0.00	2.05	13.30	2.90	0.00	0.00	0.35	1.39	21.81	19.56	4.82	2.94
50	ER11c	ExonRegion	0	7.48	6.78	3.71	4.10	3.73	25.23	3.34	3.20	2.16	4.88	0.00	0.95	0.51	3.29	0.76	0.00	0.00	4.20	5.70	20.39	9.96	6.48	1.17
51	ER11d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.20	0.00	0.00
52	I11	Intron	0	0.54	19.57	3.38	16.41	3.72	12.08	4.70	1.99	0.66	0.44	0.00	0.00	0.84	0.79	0.00	0.00	0.00	1.47	7.38	22.55	0.68	0.75	0.45
53	I11_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.71	30.70	5.38	26.08	6.04	15.03	6.03	2.80	0.73	0.71	0.00	0.00	0.97	1.16	0.00	0.00	0.00	2.08	8.76	29.70	0.65	0.87	0.74
54	E12_Aa	NovelBoundary	0	2.82	38.41	3.13	55.17	4.33	33.50	35.29	8.21	1.68	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.10	9.41	65.77	0.00	0.00	0.00
55	ER12a	ExonRegion	0	2.58	56.33	5.38	27.59	7.28	34.07	14.86	4.41	1.66	4.62	0.00	0.28	0.72	3.11	0.00	0.00	0.00	14.50	26.55	53.23	9.14	4.49	2.80