Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-346L13.1 Gene 0 1.79 4.99 2.18 1.71 1.87 0.90 3.72 1.81 1.17 1.32 0.00 0.75 1.31 0.71 0.84 0.62 1.16 0.13 1.34 2.24 0.31 0.44 0.21 2 458118 Transcript 0 0.91 2.01 0.87 0.58 0.74 0.32 1.45 0.56 0.51 0.42 0.00 0.35 0.55 0.24 0.26 0.31 0.42 0.04 0.41 0.83 0.09 0.13 0.06 3 ER1a ExonRegion 0 6.05 19.34 8.72 6.43 6.78 3.49 11.78 7.36 2.36 4.90 0.00 2.26 3.64 2.83 3.73 1.02 4.16 0.59 6.03 8.09 1.40 1.98 0.93 4 E1_Da NovelBoundary 0 16.74 33.74 27.38 26.07 19.35 28.73 32.99 23.29 14.44 9.03 0.00 6.30 6.49 12.13 9.64 4.36 8.79 6.80 4.61 17.32 2.72 0.00 4.01 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 14.89 21.60 13.28 9.29 18.95 10.39 17.56 12.87 9.79 7.74 0.54 2.98 3.23 3.01 3.98 4.97 1.84 4.25 6.89 8.30 0.61 4.49 1.64 7 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 13.00 25.81 9.97 12.45 9.26 6.37 8.10 10.94 12.92 11.14 1.17 1.29 3.67 2.66 3.29 0.00 1.20 0.83 6.25 8.51 0.80 3.09 0.35 8 ER2a ExonRegion 0 1.42 1.03 0.76 0.09 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.03 0.14 2.29 0.05 0.00 0.05 0.52 0.00 0.00 0.00 9 E2a_E3a KnownJunction 0 3.19 3.35 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER3a ExonRegion 0 0.33 0.52 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.00 0.00 0.00 11 E3_Da NovelBoundary 0 0.00 3.22 1.83 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 2.78 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 16.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 14 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E5_Aa NovelBoundary 0 2.89 21.51 0.00 7.16 13.58 7.33 7.60 8.38 14.93 7.31 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 6.66 4.02 1.70 4.05 5.18 0.00 4.90 0.00 16 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.87 0.00 0.00 1.13 1.10 1.62 1.46 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 1.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E5_Da NovelBoundary 0 3.41 14.67 7.86 20.01 0.00 0.00 5.87 2.42 2.86 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 3.59 4.77 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E6_Aa NovelBoundary 0 30.82 58.21 5.97 26.10 11.21 35.95 19.70 6.04 21.06 15.28 9.90 11.70 0.00 0.00 0.00 3.85 9.16 7.54 13.27 11.51 0.00 3.06 4.18 20 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.33 0.00 0.00 0.40 1.23 0.16 0.00 2.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.00 0.00 21 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 I6 Intron 0 4.61 22.16 1.86 6.50 6.22 2.93 4.04 1.12 4.55 0.99 0.00 0.63 2.73 0.19 1.66 0.00 0.96 0.00 0.93 3.09 0.00 0.61 0.00 23 I6_SR2 SilentIntronRegion 0 5.31 25.50 2.14 7.48 7.16 3.37 4.65 1.29 5.23 1.14 0.00 0.72 3.14 0.22 1.91 0.00 1.10 0.00 1.07 3.56 0.00 0.70 0.00 24 ER7a ExonRegion 0 0.00 2.92 0.12 0.00 3.93 0.06 1.96 0.00 0.06 0.00 0.00 2.93 3.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.00 25 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER8a ExonRegion 0 2.70 2.59 1.07 1.29 0.00 0.00 6.75 0.00 1.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 2.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00