Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-233H19.1 Gene 0 0.71 0.11 3.79 0.23 3.15 1.64 6.90 1.73 1.03 2.20 0.11 0.60 0.00 0.00 0.23 0.83 0.00 0.00 0.89 0.12 0.25 0.00 0.00 2 413510 Transcript 0 0.37 0.11 3.27 0.06 2.46 1.47 5.68 1.41 0.72 1.99 0.48 0.16 0.00 0.00 0.23 1.28 0.00 0.00 0.72 0.11 0.24 0.00 0.00 3 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.08 0.76 4.64 0.00 0.72 2.00 0.43 0.00 0.00 0.00 1.57 2.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.86 0.00 0.00 4 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 0.00 0.00 0.00 0.00 4.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER2a ExonRegion 0 1.93 0.00 0.61 0.00 0.81 0.52 6.82 3.91 1.70 1.07 0.25 0.00 0.00 0.00 0.02 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 2.17 14.38 0.47 4.64 6.39 18.30 0.72 3.19 7.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.00 0.90 13.43 0.86 3.19 8.45 15.18 3.88 1.78 8.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 Ix_AR4 ActiveIntronRegion 0 0.91 11.28 45.09 0.00 11.47 21.96 46.05 18.56 15.84 44.98 0.00 1.86 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 1.37 0.50 0.00 0.00 0.00 10 Ix Intron 0 0.31 0.38 3.04 0.34 1.68 0.99 16.09 1.48 1.39 2.49 0.04 0.24 0.05 0.03 0.03 0.23 0.00 0.06 0.18 0.12 0.22 0.03 0.06 11 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.31 0.38 3.04 0.34 1.68 0.99 16.09 1.48 1.39 2.49 0.04 0.24 0.05 0.03 0.03 0.23 0.00 0.06 0.18 0.12 0.22 0.03 0.06 12 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 17.71 0.00 14.60 0.00 37.32 3.41 3.56 7.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.75 21.49 0.00 12.86 8.81 26.44 5.71 2.01 10.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.00 0.00 4.71 0.77 0.81 0.00 0.00 14 E3_Da NovelBoundary 0 3.11 0.00 17.89 1.43 0.00 7.78 43.50 3.94 2.95 9.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER4a ExonRegion 0 0.68 0.00 0.80 0.44 1.44 0.20 1.86 0.28 0.60 0.18 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.35 0.00 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00