Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-301J16.2 Gene 0 1.21 0.04 4.09 0.09 0.23 1.29 20.00 0.23 0.20 7.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.69 0.28 5.93 0.00 0.00 0.00 2 456737 Transcript 0 0.21 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 2.41 0.00 0.00 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 3 428086 Transcript 0 0.37 0.00 1.64 0.00 0.23 1.29 10.07 0.00 0.00 4.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.45 0.00 2.48 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.82 0.00 0.00 0.00 3.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER1b ExonRegion 0 1.60 0.12 6.49 0.24 0.31 0.96 24.75 0.30 0.21 5.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.14 0.37 6.45 0.00 0.00 0.00 6 E1_Da NovelBoundary 0 3.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18.06 0.00 0.00 7.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 Ix Intron 0 2.42 0.00 2.08 0.00 0.00 0.70 20.16 0.00 0.00 2.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.41 0.00 2.43 0.00 0.00 0.00 10 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 2.45 0.00 2.12 0.00 0.00 0.71 20.46 0.00 0.00 2.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.43 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 11 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 3.67 0.00 0.00 2.21 22.52 0.00 0.00 5.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.47 0.00 2.88 0.00 0.00 0.00 12 E2_Ab NovelBoundary 0 3.04 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 28.84 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.76 0.00 2.68 0.00 0.00 0.00 13 ER2a ExonRegion 0 0.85 0.00 0.98 0.00 0.00 0.00 6.53 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 14 ER2b ExonRegion 0 0.59 0.00 5.01 0.00 0.00 1.34 11.58 0.00 0.00 2.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 0.00 2.93 0.00 0.00 0.00 15 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 Ix Intron 0 2.35 0.00 2.92 0.00 0.00 0.00 21.12 0.32 0.00 4.53 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 4.46 0.00 0.00 0.00 17 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 2.35 0.00 2.93 0.00 0.00 0.00 21.17 0.32 0.00 4.54 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 4.47 0.00 0.00 0.00 18 E3_Aa NovelBoundary 0 6.82 0.00 8.66 0.00 0.00 0.00 31.27 0.00 0.00 10.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 19 ER3a ExonRegion 0 1.64 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 12.15 0.00 0.00 4.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.71 0.00 0.00 0.00 20 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.67 0.00 0.00 0.00 19.87 0.00 0.00 8.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.20 0.00 0.00 0.00 21 E3a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER3b ExonRegion 0 1.86 0.00 3.69 0.00 0.00 3.02 23.92 0.00 0.00 13.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.75 0.00 11.02 0.00 0.00 0.00 23 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 2.69 0.00 0.00 10.79 32.33 0.00 0.00 23.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.93 0.00 8.69 0.00 0.00 0.00 24 ER3c ExonRegion 0 0.98 0.00 2.43 0.00 0.16 1.65 19.30 0.30 0.32 11.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.11 0.37 6.31 0.00 0.00 0.00 25 E3_Db NovelBoundary 0 3.19 0.00 1.83 0.00 0.00 5.74 40.54 0.00 0.00 10.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.15 0.00 2.36 0.00 0.00 0.00 26 E3_Dc NovelBoundary 0 3.78 0.00 5.06 0.00 0.00 0.00 22.39 0.00 0.00 15.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.85 0.00 2.94 0.00 0.00 0.00 27 E3c_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER3d ExonRegion 0 0.00 0.00 1.31 0.00 0.00 2.62 16.55 0.00 0.00 6.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.51 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 29 Ix Intron 0 0.80 0.00 3.72 0.00 0.29 0.69 20.12 0.14 0.00 6.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.37 0.51 5.83 0.00 0.00 0.00 30 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.80 0.00 3.72 0.00 0.29 0.69 20.12 0.14 0.00 6.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.37 0.51 5.83 0.00 0.00 0.00 31 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 3.19 0.00 1.17 0.80 9.86 0.00 0.00 4.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 0.00 0.00 0.00