Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-45B20.2 Gene 0 0.54 0.17 19.09 0.35 0.57 0.00 0.73 0.66 0.63 3.56 2.05 0.30 0.00 0.21 0.35 1.89 5.89 5.62 1.90 0.18 5.71 1.42 0.00 2 382133 Transcript 0 0.65 0.00 0.44 0.72 0.87 0.00 0.35 2.03 0.47 0.21 7.61 0.84 0.00 0.30 1.19 6.49 18.36 0.00 0.00 0.00 20.26 3.11 0.00 3 456456 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 417034 Transcript 0 0.14 0.26 27.69 0.13 0.69 0.00 0.94 0.00 0.48 5.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.54 2.88 0.27 0.85 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 1.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.11 0.67 0.00 4.70 0.00 0.00 0.00 0.00 2.85 7.97 0.00 0.00 0.00 11.32 2.63 0.00 6 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.72 0.00 1.16 0.00 8.32 0.00 0.00 0.00 0.00 4.27 11.41 0.00 0.00 0.00 28.05 0.00 0.00 7 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 8.17 0.00 0.98 0.00 0.00 0.00 1.56 6.02 3.16 0.00 0.00 0.19 1.43 8.30 19.01 5.36 1.51 1.49 4.44 1.94 0.26 8 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 4.70 1.50 3.40 0.00 0.00 0.00 1.79 7.17 0.00 0.00 0.00 2.47 6.30 4.02 35.34 11.57 4.80 0.00 2.41 0.00 0.00 9 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.49 1.87 0.00 0.25 2.01 0.26 0.24 17.08 0.00 0.00 0.00 3.85 12.23 31.70 0.00 0.00 0.00 39.97 3.25 0.00 10 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 3.53 4.24 0.00 0.00 3.86 0.00 1.07 11.79 0.00 0.00 0.00 4.45 18.97 26.27 0.00 0.00 0.00 34.60 3.06 0.00 11 E3_Aa NovelBoundary 0 13.34 0.00 412.82 10.75 45.76 0.00 7.91 2.55 21.27 65.33 0.00 6.30 0.00 0.00 4.45 11.45 11.87 10.20 0.00 2.62 8.53 0.00 0.00 12 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.19 2.17 0.85 0.00 0.00 3.25 1.14 1.15 3.81 0.00 0.00 0.00 0.66 5.13 19.26 0.00 0.00 0.00 20.27 5.97 0.00 13 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 189.76 5.76 4.16 0.00 0.00 1.60 9.98 40.45 2.00 0.00 0.00 0.00 4.57 0.00 8.60 0.00 0.00 3.13 0.00 2.45 0.00 14 E3a_E3b NovelJunction 0 0.00 0.00 136.39 1.96 0.00 0.00 0.00 2.55 1.79 29.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E3_Ab KnownBoundary 0 3.56 0.00 96.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.46 0.00 4.77 0.00 6.33 12.60 2.88 0.00 17 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 0.00 0.00 0.00 0.00 2.30 1.24 0.13 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.60 0.00 0.00 0.00 8.08 4.17 0.00 18 ER3c ExonRegion 0 0.21 0.00 0.71 0.00 0.00 0.00 0.00 2.83 0.10 0.00 3.25 2.04 0.00 0.59 1.37 7.55 16.69 0.00 0.00 0.00 14.72 3.76 0.00 19 E3_Db NovelBoundary 0 0.00 0.00 143.49 4.10 0.00 0.00 2.25 0.00 5.12 11.17 2.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.35 34.36 14.12 0.00 5.87 0.00 0.00 20 E3b_E4a KnownJunction 0 2.82 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 5.96 0.00 0.00 9.90 5.85 0.00 2.12 0.00 7.09 41.23 0.00 0.00 0.00 19.83 8.70 0.00 21 E3b_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER4a ExonRegion 0 0.63 0.00 1.81 0.21 0.00 0.00 0.14 0.51 0.38 0.36 1.33 0.44 0.00 0.43 0.22 1.05 4.46 0.00 0.00 0.00 1.22 1.09 0.00 23 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 Ix Intron 0 0.30 0.14 42.70 0.85 0.88 0.26 1.39 0.24 1.55 3.99 0.09 0.00 0.34 0.06 0.05 0.63 0.93 16.81 3.66 0.20 1.03 0.83 0.69 25 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 259.71 1.29 0.00 0.00 4.95 0.00 4.91 4.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 0.00 86.75 13.83 0.00 1.16 2.69 0.62 26 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 399.93 6.20 1.18 0.00 5.53 0.00 15.70 3.78 0.00 0.00 0.00 0.43 0.00 1.14 0.00 121.18 23.45 0.00 1.09 2.04 1.29 27 ER5a ExonRegion 0 0.27 0.53 55.39 0.26 1.38 0.00 1.88 0.00 0.95 10.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.08 5.76 0.55 1.71 0.00 0.00