Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 FGF9 Gene 0 3.38 17.71 0.04 0.14 1.83 0.04 0.27 10.88 0.95 3.02 0.00 0.00 0.04 0.02 0.03 0.00 0.15 0.06 0.00 0.53 0.00 0.05 0.07 2 382353 Transcript 0 1.29 7.50 0.02 0.06 0.83 0.00 0.21 4.84 0.65 1.23 0.00 0.00 0.02 0.01 0.02 0.00 0.08 0.01 0.00 0.18 0.00 0.09 0.00 3 461657 Transcript 0 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 478546 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.02 0.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.26 0.00 6 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER2a ExonRegion 0 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E2_Da NovelBoundary 0 6.37 55.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.78 1.45 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 9 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 I2_SR3 SilentIntronRegion 0 0.81 20.89 0.04 0.00 1.91 0.00 0.22 8.30 0.40 1.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.35 0.00 0.23 0.00 11 I2_AR6 ActiveIntronRegion 0 3.07 32.98 0.45 0.00 5.25 0.28 0.00 15.14 0.85 2.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 12 I2_AR7 ActiveIntronRegion 0 6.35 25.70 0.00 0.00 5.84 0.00 0.00 9.59 1.12 3.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 I2_SR4 SilentIntronRegion 0 3.48 30.16 0.00 0.00 8.00 1.67 0.00 9.18 1.57 2.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 14 ER3a ExonRegion 0 0.35 10.14 0.00 0.00 2.94 0.00 0.00 11.43 0.33 3.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.83 0.00 0.00 0.90 15 E3_Ab KnownBoundary 0 2.89 16.31 0.00 1.76 4.33 0.00 0.00 13.92 1.42 5.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 4.35 16 ER3b ExonRegion 0 6.28 19.76 0.00 0.00 4.26 0.00 0.00 13.45 1.89 5.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.12 0.00 0.00 2.66 17 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E3a_E4a KnownJunction 0 12.97 30.52 0.00 0.00 7.64 0.00 0.00 18.15 3.01 4.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.75 0.00 0.00 0.00 19 ER3c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E3b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER4a ExonRegion 0 6.82 31.42 0.00 0.00 3.44 1.72 1.17 26.07 1.53 6.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.72 0.00 0.00 0.00 22 E4_Da KnownBoundary 0 6.74 64.79 0.00 0.00 8.23 0.00 9.80 26.25 1.62 6.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 23 ER4b ExonRegion 0 8.76 29.23 0.00 0.19 1.78 0.00 0.39 19.79 0.94 5.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 1.12 0.00 0.00 0.28 24 E4_Db KnownBoundary 0 3.04 14.67 0.00 2.06 3.74 0.00 0.00 11.34 0.00 7.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER4c ExonRegion 0 3.47 22.50 0.07 0.19 2.50 0.00 0.20 12.93 1.02 3.68 0.00 0.00 0.07 0.03 0.05 0.00 0.25 0.04 0.00 0.53 0.00 0.00 0.00