Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	HNF1A	Gene	0	6.49	6.44	13.44	9.85	7.77	7.18	7.35	9.28	6.72	11.14	4.94	5.09	5.63	10.04	13.17	10.77	9.68	9.68	8.17	8.61	5.42	4.10	4.92
2	257555	Transcript	0	1.81	2.08	6.17	3.05	2.46	2.20	2.01	3.03	1.78	5.43	1.70	0.95	0.98	3.33	3.83	3.00	3.25	2.79	2.74	2.75	2.12	1.20	1.31
3	400024	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
4	402929	Transcript	0	0.19	0.00	1.00	0.23	3.76	0.00	0.71	1.81	0.08	0.71	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.15	0.19	0.00	0.00	1.92
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8	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER1c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.19	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E1_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1_Ae	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER1d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER1e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.30	0.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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17	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00
19	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	0.03	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.82	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.66	0.00
23	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	ER6a	ExonRegion	0	1.07	0.00	2.38	0.57	1.35	0.00	0.00	0.53	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.54	0.00	0.56	0.74
25	E6_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	3.37	0.00	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E6a_E6c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER6b	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.64	0.92	0.79	0.00	0.67	0.26	0.00	0.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.30	1.48	0.00	0.00	0.00	0.67
28	E6_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E6b_E6b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.90	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.27
30	E6_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	ER6c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	5.35	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.94
32	ER6d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.74	0.00	2.98	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	1.25
33	E6_Dc	KnownBoundary	0	0.00	0.00	3.84	0.00	0.00	0.00	0.00	1.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	E6c_E9b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	ER6e	ExonRegion	0	0.38	0.00	2.00	0.45	2.16	0.00	1.43	1.89	0.17	1.43	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.59	0.30	0.38	0.00	0.00	0.89
36	E6_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.71	2.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.07	0.00	0.00	0.00	0.00	4.27
37	ER6f	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.03	0.29	0.00	0.98	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.87	0.90	1.06	0.00	0.00	0.66
38	E6_Dd	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.36	0.00	0.00	3.67
39	E6d_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	ER6g	ExonRegion	0	0.00	0.00	3.60	1.64	0.00	0.00	0.00	1.04	0.74	1.54	0.26	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.06	3.06	0.12	0.00	0.00	0.91
41	E6_De	KnownBoundary	0	0.00	0.00	2.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.29	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.93	0.00	0.00	0.00	0.00
42	E6e_E9c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	ER6h	ExonRegion	0	17.39	16.10	23.66	17.29	11.82	8.46	18.84	19.35	21.39	18.29	5.55	25.13	29.89	15.85	41.60	24.41	14.56	32.76	18.67	28.57	7.51	6.89	17.95
44	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.85	0.76	0.00	0.00	0.00	1.11	1.08	0.77	3.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
46	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.72	1.73	0.05	0.00	0.00	0.47	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.82	0.00	0.00	1.03
47	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	3.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
48	I8_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.13	8.13	14.65	4.49	5.39	3.31	3.97	10.36	2.20	8.89	3.12	3.59	0.00	5.41	10.85	1.77	2.00	4.08	7.68	8.51	5.77	1.68	4.74
49	E9_Aa	NovelBoundary	0	3.78	0.00	25.87	4.06	8.06	19.14	3.93	13.39	9.03	11.20	11.63	0.00	0.00	2.47	10.63	4.19	9.26	27.48	4.71	12.66	13.65	0.00	4.18
50	ER9a	ExonRegion	0	1.09	1.39	14.67	1.99	1.91	0.00	0.00	3.75	0.56	11.24	1.44	0.00	0.00	2.32	5.22	0.08	2.74	3.54	3.64	5.29	4.09	0.06	1.43
51	E9_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	3.13	2.06	0.00	0.00	0.00	2.18	3.30	2.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	0.00	5.62	0.00	0.00	0.00
52	E9_Ac	KnownBoundary	0	3.63	0.00	3.31	4.16	0.00	0.00	0.00	10.88	1.39	10.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.70	8.08	4.71	3.13	8.22	0.00	6.83
53	ER9b	ExonRegion	0	2.12	2.03	17.16	2.73	2.68	0.00	0.00	6.91	1.24	13.76	1.93	0.00	0.00	3.25	8.70	2.97	6.60	7.39	6.37	6.38	8.81	2.08	8.81
54	ER9c	ExonRegion	0	1.91	3.02	20.90	10.60	2.97	8.71	6.37	12.65	2.33	15.05	4.61	2.00	1.39	7.25	8.38	1.57	4.46	9.06	7.39	7.69	7.60	3.16	9.78
55	E9_Da	KnownBoundary	0	0.00	2.76	27.59	13.65	4.24	5.28	7.95	13.97	6.37	13.70	5.21	0.00	6.82	2.47	9.64	3.50	7.76	1.99	0.00	5.82	5.31	2.63	7.77
56	ER9d	ExonRegion	0	13.38	13.66	28.76	22.35	17.74	17.56	14.52	19.40	12.94	24.55	12.13	7.59	7.88	23.30	25.44	23.88	23.25	17.65	17.15	15.88	12.89	9.52	7.99