Summary page for 'CLIP1' (ENSG00000130779) - Project: NeuroEvolution
Basic Gene Stats
Species: Human
Gene Name: 'CLIP1' (HUGO: CLIP1)
ALEXA Gene ID: 6422 (ALEXA_hs_57_37b)
EnsEMBL Gene ID: ENSG00000130779
Entrez Gene Record(s): CLIP1
Ensembl Gene Record: ENSG00000130779
Evidence: Known Gene
Gene Type: protein_coding
Location: chr12 122755981-122907116 (-): 12q24.3
Size (bp): 151136
Description: CAP-GLY domain containing linker protein 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:10461]
Data links for each library (displays expression data in UCSC Genome Browser)
Comparison: HS1041_vs_HS0499
NBL11_Rel2 (HS1041) has 6,403 total reads for 'CLIP1'. UCSC data links: (C | P)
NBL11_Rem1 (HS0499) has 3,936 total reads for 'CLIP1'. UCSC data links: (C | P)
Comparison: HS1041_vs_HS0502
NBL11_Rel2 (HS1041) has 6,403 total reads for 'CLIP1'. UCSC data links: (C | P)
NBL11_Rel1 (HS0502) has 5,499 total reads for 'CLIP1'. UCSC data links: (C | P)
Comparison: HS0499_vs_HS0502
NBL11_Rem1 (HS0499) has 3,936 total reads for 'CLIP1'. UCSC data links: (C | P)
NBL11_Rel1 (HS0502) has 5,499 total reads for 'CLIP1'. UCSC data links: (C | P)
Comparison: HS0382_vs_HS0627
NBL12_Rel_Left (HS0382) has 12,639 total reads for 'CLIP1'. UCSC data links: (C | P)
NBL12_Rel_Right (HS0627) has 4,035 total reads for 'CLIP1'. UCSC data links: (C | P)
Comparison: HS1151_vs_HS1040
NBL13_Rel_Left (HS1151) has 3,054 total reads for 'CLIP1'. UCSC data links: (C | P)
NBL13_Rel_Right (HS1040) has 2,559 total reads for 'CLIP1'. UCSC data links: (C | P)
Link to other genes in the same chromosome region as 'CLIP1'
Features defined for this gene: 608
Gene: 1
Transcript: 5
ExonRegion: 31
Junction: 360
KnownJunction: 30
NovelJunction: 330
Boundary: 52
KnownBoundary: 2
NovelBoundary: 50
Intron: 26
ActiveIntronRegion: 61
SilentIntronRegion: 59
Intergenic: 2
ActiveIntergenicRegion: 5
SilentIntergenicRegion: 7
Summary of transcript specific features for 'CLIP1' (ENSG00000130779)
ENST00000361654: | E8a_E11a |
ENST00000450731: | E5a_E7a, ER9b |
ENST00000358808: | E8a_E10a |
ENST00000302528: | E9a_E10a |
ENST00000392458: | E24a_E25a, E25a_E26a, ER25a |
Summary of known expressed features
Expressed above background
Library | Exon Regions (Expressed/Total) | Known Junctions (Expressed/Total) |
NBL01_MYCN: | 25/31 | 22/30 |
NBL05_MYCN: | 24/31 | 22/30 |
NBL09_MYCN: | 28/31 | 26/30 |
NBL10_MYCN: | 27/31 | 25/30 |
NBL02: | 24/31 | 27/30 |
NBL03: | 27/31 | 26/30 |
NBL04: | 28/31 | 26/30 |
NBL06: | 27/31 | 24/30 |
NBL07: | 27/31 | 27/30 |
NBL08: | 28/31 | 25/30 |
NBL11_Rel2: | 27/31 | 25/30 |
NBL11_Rem1: | 26/31 | 22/30 |
NBL11_Rel1: | 27/31 | 25/30 |
NBL12_Rel_Left: | 27/31 | 25/30 |
NBL12_Rel_Right: | 27/31 | 25/30 |
NBL13_Rel_Left: | 27/31 | 25/30 |
NBL13_Rel_Right: | 27/31 | 25/30 |
NBL14_MYCN_Met: | 27/31 | 25/30 |
NBL14_MYCN_Pri: | 28/31 | 24/30 |
NBL15_MYCN_Rel1: | 28/31 | 24/30 |
SKP01: | 26/31 | 24/30 |
SKP02: | 26/31 | 25/30 |
SKP03: | 27/31 | 23/30 |
Detected at any level above 0
Library | Exon Regions (Detected/Total) | Known Junctions (Detected/Total) |
NBL01_MYCN: | 31/31 | 27/30 |
NBL05_MYCN: | 31/31 | 25/30 |
NBL09_MYCN: | 30/31 | 29/30 |
NBL10_MYCN: | 31/31 | 28/30 |
NBL02: | 31/31 | 28/30 |
NBL03: | 31/31 | 28/30 |
NBL04: | 31/31 | 28/30 |
NBL06: | 31/31 | 27/30 |
NBL07: | 31/31 | 29/30 |
NBL08: | 31/31 | 28/30 |
NBL11_Rel2: | 31/31 | 27/30 |
NBL11_Rem1: | 30/31 | 26/30 |
NBL11_Rel1: | 31/31 | 27/30 |
NBL12_Rel_Left: | 31/31 | 25/30 |
NBL12_Rel_Right: | 31/31 | 25/30 |
NBL13_Rel_Left: | 30/31 | 25/30 |
NBL13_Rel_Right: | 30/31 | 25/30 |
NBL14_MYCN_Met: | 29/31 | 27/30 |
NBL14_MYCN_Pri: | 29/31 | 26/30 |
NBL15_MYCN_Rel1: | 31/31 | 27/30 |
SKP01: | 30/31 | 27/30 |
SKP02: | 30/31 | 27/30 |
SKP03: | 31/31 | 26/30 |
Normalized expression data for each known or novel expressed feature of 'CLIP1'
The following table summarizes the expression values of all known features of the gene 'CLIP1' in each library. Known features (i.e. those that correspond to one or more EnsEMBL transcripts) are included regardless of their expression level. Novel features are only reported in this table if they are expressed above the level of intergenic background noise. The 'FID' column reports the unique Feature ID for the gene, transcript, exon region, exon junction, etc. The 'Name' column reports the Feature Name for the feature (e.g. E5a_E6a is the name of an exon junction corresponding to the connection of exons 5 and 6). The 'Type' column reports the type of the feature and may be one of the following: Gene, Transcript, Exon Region, Known Junction, Novel Junction, Known Boundary, Novel Boundary, Silent or Active Intronic Regions, and Silent or Active Intergenic Regions (see our manuscript for more details). The 'Base Count' column reports the number of nucleotide bases for the feature followed by the percent of these that do NOT correspond to repeats and the percent that are known to be protein coding in one or more EnsEMBL transcripts. The 'Supporting ESTs/mRNAs' column reports the number of ESTs and mRNAs that when aligned to the human genome support the expression of a feature (i.e. the sequence alignment coordinates match an exon junction or boundaries of an exon, retained intron, etc.). The 'Conserved Species' column reports the number of 'other' species for which there was at least 1 supporting EST/mRNA alignment. Finally, the remaining columns report the log2 expression value for each feature in each library. Bold values indicate expression above background. Each expression value is also a hyperlink to a view of the feature's corresponding genomic region in the UCSC genome browser. Expression data will automatically be loaded as custom GFF and wiggle tracks.
FID | Name | Type | Base Count (% unmasked | % coding) | Supporting Human ESTs/mRNAs | Conserved Species | NBL01_MYCN Log2 Expression | NBL05_MYCN Log2 Expression | NBL09_MYCN Log2 Expression | NBL10_MYCN Log2 Expression | NBL02 Log2 Expression | NBL03 Log2 Expression | NBL04 Log2 Expression | NBL06 Log2 Expression | NBL07 Log2 Expression | NBL08 Log2 Expression | NBL11_Rel2 Log2 Expression | NBL11_Rem1 Log2 Expression | NBL11_Rel1 Log2 Expression | NBL12_Rel_Left Log2 Expression | NBL12_Rel_Right Log2 Expression | NBL13_Rel_Left Log2 Expression | NBL13_Rel_Right Log2 Expression | NBL14_MYCN_Met Log2 Expression | NBL14_MYCN_Pri Log2 Expression | NBL15_MYCN_Rel1 Log2 Expression | SKP01 Log2 Expression | SKP02 Log2 Expression | SKP03 Log2 Expression |
G6422 | CLIP1 | Gene | 6000 (99% | 73%) | N/A | N/A | 6.27 (C | P) | 7.23 (C | P) | 6.18 (C | P) | 6.74 (C | P) | 7.14 (C | P) | 7.63 (C | P) | 6.87 (C | P) | 6.99 (C | P) | 7.35 (C | P) | 6.62 (C | P) | 6.73 (C | P) | 6.94 (C | P) | 7.54 (C | P) | 7.18 (C | P) | 6.28 (C | P) | 6.29 (C | P) | 6.19 (C | P) | 6.69 (C | P) | 5.31 (C | P) | 6.46 (C | P) | 6.46 (C | P) | 7.11 (C | P) | 6.63 (C | P) |
T37518 | ENST00000450731 | Transcript | 143 (100% | 100%) | N/A | N/A | 1.70 (C | P) | 1.59 (C | P) | 0.92 (C | P) | 0.78 (C | P) | 2.49 (C | P) | 2.29 (C | P) | 3.08 (C | P) | 1.13 (C | P) | 1.50 (C | P) | 1.70 (C | P) | 0.69 (C | P) | 3.04 (C | P) | 4.56 (C | P) | 1.77 (C | P) | 2.57 (C | P) | 0.84 (C | P) | 1.79 (C | P) | 1.11 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.65 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.37 (C | P) |
T37516 | ENST00000361654 | Transcript | 62 (100% | 100%) | N/A | N/A | 3.55 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.00 (C | P) | 5.13 (C | P) | 4.65 (C | P) | 6.05 (C | P) | 5.51 (C | P) | 3.85 (C | P) | 5.16 (C | P) | 5.24 (C | P) | 6.63 (C | P) | 4.67 (C | P) | 5.97 (C | P) | 7.07 (C | P) | 5.29 (C | P) | 5.71 (C | P) | 4.80 (C | P) | 6.02 (C | P) | 5.60 (C | P) | 4.81 (C | P) | 6.94 (C | P) | 6.86 (C | P) | 7.43 (C | P) |
T37515 | ENST00000358808 | Transcript | 62 (100% | 100%) | N/A | N/A | 2.88 (C | P) | 5.76 (C | P) | 5.27 (C | P) | 4.77 (C | P) | 5.85 (C | P) | 7.22 (C | P) | 5.96 (C | P) | 6.09 (C | P) | 7.26 (C | P) | 5.37 (C | P) | 4.85 (C | P) | 5.02 (C | P) | 4.51 (C | P) | 5.42 (C | P) | 4.37 (C | P) | 4.13 (C | P) | 5.31 (C | P) | 6.16 (C | P) | 3.94 (C | P) | 6.75 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
T37514 | ENST00000302528 | Transcript | 62 (100% | 100%) | N/A | N/A | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.61 (C | P) | 2.22 (C | P) | 1.96 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.42 (C | P) | 1.28 (C | P) | 1.75 (C | P) | 2.87 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.81 (C | P) | 4.21 (C | P) | 3.15 (C | P) |
T37517 | ENST00000392458 | Transcript | 130 (100% | 61%) | N/A | N/A | 3.37 (C | P) | 6.68 (C | P) | 5.40 (C | P) | 5.88 (C | P) | 6.29 (C | P) | 7.71 (C | P) | 6.57 (C | P) | 6.53 (C | P) | 7.12 (C | P) | 5.98 (C | P) | 0.28 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.82 (C | P) | 0.62 (C | P) | 0.57 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 6.71 (C | P) | 5.25 (C | P) | 6.48 (C | P) | 1.71 (C | P) | 1.78 (C | P) | 0.58 (C | P) |
AIG11026 | IG27_AR4 | ActiveIntergenicRegion | 645 (92% | 0%) | 1 | 0 | 4.61 (C | P) | 4.74 (C | P) | 3.52 (C | P) | 4.84 (C | P) | 4.87 (C | P) | 3.71 (C | P) | 4.61 (C | P) | 4.24 (C | P) | 3.04 (C | P) | 4.30 (C | P) | 3.63 (C | P) | 4.53 (C | P) | 4.62 (C | P) | 3.50 (C | P) | 4.19 (C | P) | 2.72 (C | P) | 2.22 (C | P) | 1.41 (C | P) | 2.69 (C | P) | 2.73 (C | P) | 0.46 (C | P) | 3.02 (C | P) | 2.09 (C | P) |
AIG11024 | IG27_AR2 | ActiveIntergenicRegion | 117 (100% | 0%) | 2 | 0 | 0.00 (C | P) | 1.54 (C | P) | 2.25 (C | P) | 0.57 (C | P) | 2.00 (C | P) | 3.10 (C | P) | 3.32 (C | P) | 2.93 (C | P) | 2.37 (C | P) | 0.92 (C | P) | 1.82 (C | P) | 0.95 (C | P) | 1.60 (C | P) | 1.46 (C | P) | 0.92 (C | P) | 0.92 (C | P) | 1.96 (C | P) | 3.96 (C | P) | 0.75 (C | P) | 2.65 (C | P) | 1.73 (C | P) | 1.50 (C | P) | 2.28 (C | P) |
ER52080 | ER1a | ExonRegion | 49 (0% | 0%) | 20 | 0 | 2.20 (C | P) | 2.79 (C | P) | 2.00 (C | P) | 2.20 (C | P) | 2.33 (C | P) | 4.55 (C | P) | 3.28 (C | P) | 2.54 (C | P) | 4.51 (C | P) | 3.25 (C | P) | 3.18 (C | P) | 2.63 (C | P) | 2.65 (C | P) | 3.97 (C | P) | 3.62 (C | P) | 3.87 (C | P) | 3.71 (C | P) | 3.89 (C | P) | 2.47 (C | P) | 2.70 (C | P) | 3.29 (C | P) | 2.90 (C | P) | 4.92 (C | P) |
EJ1269179 | E1a_E2a | KnownJunction | 62 (50% | 0%) | 20 | 0 | 3.63 (C | P) | 4.07 (C | P) | 3.62 (C | P) | 3.97 (C | P) | 4.39 (C | P) | 6.19 (C | P) | 4.95 (C | P) | 3.68 (C | P) | 5.87 (C | P) | 4.61 (C | P) | 4.60 (C | P) | 3.73 (C | P) | 4.50 (C | P) | 5.24 (C | P) | 5.07 (C | P) | 4.93 (C | P) | 5.08 (C | P) | 5.64 (C | P) | 3.38 (C | P) | 4.18 (C | P) | 4.78 (C | P) | 4.46 (C | P) | 6.31 (C | P) |
SIN42815 | I1_SR3 | SilentIntronRegion | 368 (64% | 0%) | 0 | 0 | 5.18 (C | P) | 4.97 (C | P) | 3.93 (C | P) | 3.82 (C | P) | 5.53 (C | P) | 2.72 (C | P) | 5.30 (C | P) | 4.11 (C | P) | 4.12 (C | P) | 3.91 (C | P) | 1.17 (C | P) | 3.16 (C | P) | 3.57 (C | P) | 0.62 (C | P) | 3.59 (C | P) | 2.89 (C | P) | 2.90 (C | P) | 2.11 (C | P) | 2.70 (C | P) | 4.28 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.20 (C | P) | 3.12 (C | P) |
AIN31735 | I1_AR3 | ActiveIntronRegion | 170 (95% | 0%) | 2 | 0 | 2.61 (C | P) | 3.97 (C | P) | 3.40 (C | P) | 3.00 (C | P) | 4.16 (C | P) | 3.18 (C | P) | 4.70 (C | P) | 4.31 (C | P) | 3.68 (C | P) | 2.50 (C | P) | 2.04 (C | P) | 3.21 (C | P) | 4.05 (C | P) | 1.46 (C | P) | 3.20 (C | P) | 2.64 (C | P) | 2.09 (C | P) | 2.29 (C | P) | 1.59 (C | P) | 3.28 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.34 (C | P) | 3.12 (C | P) |
SIN42814 | I1_SR4 | SilentIntronRegion | 1321 (46% | 0%) | 0 | 0 | 4.51 (C | P) | 3.78 (C | P) | 4.34 (C | P) | 3.74 (C | P) | 5.12 (C | P) | 3.55 (C | P) | 4.83 (C | P) | 5.04 (C | P) | 4.44 (C | P) | 3.89 (C | P) | 0.85 (C | P) | 2.61 (C | P) | 4.73 (C | P) | 1.55 (C | P) | 3.65 (C | P) | 2.96 (C | P) | 2.54 (C | P) | 3.40 (C | P) | 2.79 (C | P) | 3.89 (C | P) | 1.20 (C | P) | 1.42 (C | P) | 2.95 (C | P) |
AIN31734 | I1_AR4 | ActiveIntronRegion | 493 (98% | 0%) | 1 | 0 | 3.83 (C | P) | 3.68 (C | P) | 3.67 (C | P) | 3.86 (C | P) | 4.91 (C | P) | 3.67 (C | P) | 4.46 (C | P) | 4.61 (C | P) | 3.28 (C | P) | 3.70 (C | P) | 1.38 (C | P) | 2.70 (C | P) | 3.79 (C | P) | 1.55 (C | P) | 3.37 (C | P) | 2.79 (C | P) | 2.47 (C | P) | 3.14 (C | P) | 2.73 (C | P) | 4.17 (C | P) | 1.37 (C | P) | 1.58 (C | P) | 2.36 (C | P) |
SIN42812 | I1_SR6 | SilentIntronRegion | 98 (100% | 0%) | 0 | 0 | 2.87 (C | P) | 3.62 (C | P) | 3.00 (C | P) | 3.49 (C | P) | 5.30 (C | P) | 3.19 (C | P) | 4.90 (C | P) | 3.92 (C | P) | 4.05 (C | P) | 3.99 (C | P) | 1.01 (C | P) | 1.10 (C | P) | 3.20 (C | P) | 0.81 (C | P) | 2.51 (C | P) | 1.35 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.67 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.99 (C | P) | 2.14 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.65 (C | P) |
AIN31732 | I1_AR6 | ActiveIntronRegion | 112 (100% | 0%) | 2 | 0 | 3.25 (C | P) | 4.56 (C | P) | 4.49 (C | P) | 3.90 (C | P) | 5.32 (C | P) | 3.04 (C | P) | 4.73 (C | P) | 5.38 (C | P) | 4.94 (C | P) | 4.18 (C | P) | 1.46 (C | P) | 2.42 (C | P) | 3.50 (C | P) | 2.06 (C | P) | 3.63 (C | P) | 3.00 (C | P) | 1.16 (C | P) | 3.33 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.61 (C | P) | 1.60 (C | P) | 2.26 (C | P) | 2.53 (C | P) |
SIN42811 | I1_SR7 | SilentIntronRegion | 117 (100% | 0%) | 0 | 0 | 2.89 (C | P) | 4.53 (C | P) | 4.17 (C | P) | 3.94 (C | P) | 4.65 (C | P) | 3.16 (C | P) | 4.54 (C | P) | 4.90 (C | P) | 4.49 (C | P) | 3.87 (C | P) | 2.11 (C | P) | 2.31 (C | P) | 3.00 (C | P) | 1.40 (C | P) | 2.98 (C | P) | 3.10 (C | P) | 1.91 (C | P) | 4.05 (C | P) | 2.71 (C | P) | 4.05 (C | P) | 0.97 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.28 (C | P) |
SIN42809 | I1_SR9 | SilentIntronRegion | 917 (62% | 0%) | 0 | 0 | 4.15 (C | P) | 3.56 (C | P) | 3.32 (C | P) | 3.46 (C | P) | 4.29 (C | P) | 2.68 (C | P) | 4.42 (C | P) | 4.77 (C | P) | 3.94 (C | P) | 3.57 (C | P) | 0.90 (C | P) | 3.25 (C | P) | 3.72 (C | P) | 0.59 (C | P) | 2.65 (C | P) | 2.79 (C | P) | 1.98 (C | P) | 2.98 (C | P) | 2.23 (C | P) | 3.98 (C | P) | 0.99 (C | P) | 0.95 (C | P) | 2.43 (C | P) |
AIN31729 | I1_AR9 | ActiveIntronRegion | 124 (100% | 0%) | 1 | 0 | 2.46 (C | P) | 2.68 (C | P) | 4.32 (C | P) | 3.73 (C | P) | 4.68 (C | P) | 2.99 (C | P) | 4.56 (C | P) | 4.30 (C | P) | 4.67 (C | P) | 4.32 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.83 (C | P) | 4.59 (C | P) | 1.86 (C | P) | 2.82 (C | P) | 2.97 (C | P) | 2.70 (C | P) | 3.66 (C | P) | 1.91 (C | P) | 4.62 (C | P) | 1.49 (C | P) | 1.78 (C | P) | 3.36 (C | P) |
SIN42808 | I1_SR10 | SilentIntronRegion | 76 (100% | 0%) | 0 | 0 | 1.83 (C | P) | 3.35 (C | P) | 3.81 (C | P) | 3.88 (C | P) | 2.05 (C | P) | 1.86 (C | P) | 3.55 (C | P) | 4.87 (C | P) | 4.56 (C | P) | 4.44 (C | P) | 0.82 (C | P) | 3.66 (C | P) | 4.94 (C | P) | 2.81 (C | P) | 2.87 (C | P) | 2.23 (C | P) | 3.36 (C | P) | 3.32 (C | P) | 3.53 (C | P) | 3.89 (C | P) | 1.54 (C | P) | 0.29 (C | P) | 2.37 (C | P) |
ER52081 | ER2a | ExonRegion | 191 (100% | 45%) | 42 | 1 | 4.03 (C | P) | 4.38 (C | P) | 4.44 (C | P) | 4.40 (C | P) | 3.92 (C | P) | 4.93 (C | P) | 4.83 (C | P) | 5.73 (C | P) | 6.49 (C | P) | 5.73 (C | P) | 6.22 (C | P) | 4.94 (C | P) | 5.60 (C | P) | 6.38 (C | P) | 4.98 (C | P) | 5.91 (C | P) | 5.52 (C | P) | 6.42 (C | P) | 4.80 (C | P) | 6.25 (C | P) | 6.06 (C | P) | 5.88 (C | P) | 6.23 (C | P) |
EJ1269205 | E2a_E3a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 50 | 0 | 3.06 (C | P) | 2.06 (C | P) | 5.00 (C | P) | 5.64 (C | P) | 4.89 (C | P) | 5.39 (C | P) | 3.40 (C | P) | 5.94 (C | P) | 6.66 (C | P) | 5.87 (C | P) | 5.01 (C | P) | 4.72 (C | P) | 5.09 (C | P) | 6.00 (C | P) | 5.49 (C | P) | 5.69 (C | P) | 4.67 (C | P) | 6.55 (C | P) | 2.16 (C | P) | 6.54 (C | P) | 4.57 (C | P) | 5.59 (C | P) | 6.07 (C | P) |
ER52082 | ER3a | ExonRegion | 572 (100% | 100%) | 8 | 1 | 4.37 (C | P) | 5.19 (C | P) | 5.36 (C | P) | 5.59 (C | P) | 5.37 (C | P) | 6.47 (C | P) | 5.83 (C | P) | 6.30 (C | P) | 7.02 (C | P) | 6.28 (C | P) | 6.60 (C | P) | 6.21 (C | P) | 6.53 (C | P) | 7.21 (C | P) | 5.24 (C | P) | 6.32 (C | P) | 6.21 (C | P) | 7.11 (C | P) | 5.19 (C | P) | 6.68 (C | P) | 6.87 (C | P) | 6.53 (C | P) | 6.67 (C | P) |
EJ1269230 | E3a_E4a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 13 | 0 | 4.50 (C | P) | 4.16 (C | P) | 5.48 (C | P) | 5.54 (C | P) | 4.83 (C | P) | 7.18 (C | P) | 5.38 (C | P) | 6.18 (C | P) | 6.91 (C | P) | 6.07 (C | P) | 6.55 (C | P) | 6.39 (C | P) | 5.75 (C | P) | 7.06 (C | P) | 5.36 (C | P) | 6.08 (C | P) | 6.49 (C | P) | 7.12 (C | P) | 5.14 (C | P) | 6.66 (C | P) | 7.38 (C | P) | 6.93 (C | P) | 6.43 (C | P) |
AIN31723 | I3_AR3 | ActiveIntronRegion | 370 (94% | 0%) | 1 | 0 | 4.29 (C | P) | 3.76 (C | P) | 4.00 (C | P) | 4.37 (C | P) | 3.08 (C | P) | 1.99 (C | P) | 1.97 (C | P) | 2.01 (C | P) | 1.78 (C | P) | 2.59 (C | P) | 3.45 (C | P) | 4.30 (C | P) | 3.25 (C | P) | 3.00 (C | P) | 3.13 (C | P) | 2.53 (C | P) | 2.55 (C | P) | 1.46 (C | P) | 3.08 (C | P) | 1.93 (C | P) | 3.07 (C | P) | 2.40 (C | P) | 1.44 (C | P) |
ER52083 | ER4a | ExonRegion | 125 (100% | 100%) | 11 | 9 | 3.39 (C | P) | 4.38 (C | P) | 4.92 (C | P) | 5.51 (C | P) | 4.21 (C | P) | 6.20 (C | P) | 5.50 (C | P) | 6.13 (C | P) | 6.76 (C | P) | 6.10 (C | P) | 6.34 (C | P) | 6.04 (C | P) | 6.26 (C | P) | 7.36 (C | P) | 5.55 (C | P) | 6.73 (C | P) | 6.35 (C | P) | 7.22 (C | P) | 5.14 (C | P) | 6.47 (C | P) | 7.07 (C | P) | 6.22 (C | P) | 6.67 (C | P) |
EJ1269254 | E4a_E5a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 12 | 0 | 3.51 (C | P) | 4.58 (C | P) | 4.62 (C | P) | 5.59 (C | P) | 5.33 (C | P) | 6.39 (C | P) | 6.05 (C | P) | 5.43 (C | P) | 6.67 (C | P) | 5.95 (C | P) | 6.96 (C | P) | 5.72 (C | P) | 5.75 (C | P) | 7.55 (C | P) | 6.14 (C | P) | 6.74 (C | P) | 6.53 (C | P) | 7.30 (C | P) | 5.71 (C | P) | 6.41 (C | P) | 7.06 (C | P) | 6.69 (C | P) | 6.73 (C | P) |
ER52084 | ER5a | ExonRegion | 223 (100% | 100%) | 9 | 5 | 4.70 (C | P) | 5.24 (C | P) | 4.83 (C | P) | 4.99 (C | P) | 4.77 (C | P) | 6.32 (C | P) | 5.62 (C | P) | 5.63 (C | P) | 6.51 (C | P) | 5.81 (C | P) | 6.12 (C | P) | 5.22 (C | P) | 6.01 (C | P) | 7.07 (C | P) | 5.44 (C | P) | 5.90 (C | P) | 6.12 (C | P) | 6.88 (C | P) | 5.12 (C | P) | 6.29 (C | P) | 6.81 (C | P) | 6.11 (C | P) | 6.38 (C | P) |
EJ1269277 | E5a_E6a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 9 | 0 | 3.87 (C | P) | 4.75 (C | P) | 4.65 (C | P) | 5.42 (C | P) | 4.78 (C | P) | 6.65 (C | P) | 5.41 (C | P) | 5.19 (C | P) | 6.61 (C | P) | 5.32 (C | P) | 5.53 (C | P) | 2.87 (C | P) | 4.80 (C | P) | 7.34 (C | P) | 5.77 (C | P) | 6.26 (C | P) | 6.43 (C | P) | 7.28 (C | P) | 4.27 (C | P) | 6.50 (C | P) | 6.84 (C | P) | 5.74 (C | P) | 6.24 (C | P) |
EJ1269278 | E5a_E7a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 1 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.47 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.73 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER52085 | ER6a | ExonRegion | 198 (100% | 100%) | 10 | 8 | 4.22 (C | P) | 4.51 (C | P) | 4.34 (C | P) | 4.73 (C | P) | 4.80 (C | P) | 6.20 (C | P) | 5.37 (C | P) | 5.35 (C | P) | 6.31 (C | P) | 5.26 (C | P) | 6.08 (C | P) | 4.65 (C | P) | 5.14 (C | P) | 7.09 (C | P) | 5.13 (C | P) | 5.83 (C | P) | 6.02 (C | P) | 6.87 (C | P) | 4.34 (C | P) | 6.61 (C | P) | 6.63 (C | P) | 5.53 (C | P) | 6.26 (C | P) |
EJ1269299 | E6a_E7a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 9 | 0 | 4.38 (C | P) | 5.92 (C | P) | 4.36 (C | P) | 5.31 (C | P) | 5.87 (C | P) | 6.53 (C | P) | 5.71 (C | P) | 5.65 (C | P) | 7.03 (C | P) | 5.66 (C | P) | 6.77 (C | P) | 5.68 (C | P) | 4.78 (C | P) | 7.51 (C | P) | 5.48 (C | P) | 6.05 (C | P) | 6.13 (C | P) | 7.27 (C | P) | 4.47 (C | P) | 6.49 (C | P) | 6.71 (C | P) | 6.44 (C | P) | 6.52 (C | P) |
ER52086 | ER7a | ExonRegion | 104 (100% | 100%) | 9 | 8 | 4.32 (C | P) | 5.38 (C | P) | 4.79 (C | P) | 5.55 (C | P) | 5.51 (C | P) | 6.41 (C | P) | 5.87 (C | P) | 5.88 (C | P) | 6.83 (C | P) | 5.84 (C | P) | 6.77 (C | P) | 5.06 (C | P) | 5.57 (C | P) | 7.17 (C | P) | 5.39 (C | P) | 6.21 (C | P) | 6.21 (C | P) | 7.35 (C | P) | 5.02 (C | P) | 6.63 (C | P) | 6.55 (C | P) | 6.35 (C | P) | 6.72 (C | P) |
EJ1269320 | E7a_E8a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 12 | 0 | 4.47 (C | P) | 5.62 (C | P) | 5.06 (C | P) | 5.85 (C | P) | 5.31 (C | P) | 7.15 (C | P) | 6.26 (C | P) | 6.12 (C | P) | 7.06 (C | P) | 6.24 (C | P) | 6.68 (C | P) | 5.43 (C | P) | 6.80 (C | P) | 7.41 (C | P) | 5.50 (C | P) | 6.23 (C | P) | 6.60 (C | P) | 7.30 (C | P) | 4.74 (C | P) | 7.13 (C | P) | 6.62 (C | P) | 6.73 (C | P) | 7.08 (C | P) |
ER52087 | ER8a | ExonRegion | 61 (100% | 100%) | 11 | 11 | 4.50 (C | P) | 5.86 (C | P) | 5.36 (C | P) | 5.78 (C | P) | 5.57 (C | P) | 7.38 (C | P) | 6.38 (C | P) | 6.25 (C | P) | 7.29 (C | P) | 6.15 (C | P) | 7.05 (C | P) | 5.37 (C | P) | 6.72 (C | P) | 7.54 (C | P) | 5.47 (C | P) | 6.46 (C | P) | 6.26 (C | P) | 7.30 (C | P) | 5.11 (C | P) | 7.04 (C | P) | 6.88 (C | P) | 6.77 (C | P) | 7.16 (C | P) |
EJ1269340 | E8a_E9a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 5 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.41 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.70 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.38 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.84 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.61 (C | P) | 3.91 (C | P) | 2.42 (C | P) |
EJ1269341 | E8a_E10a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 3 | 0 | 2.88 (C | P) | 5.76 (C | P) | 5.27 (C | P) | 4.77 (C | P) | 5.85 (C | P) | 7.22 (C | P) | 5.96 (C | P) | 6.09 (C | P) | 7.26 (C | P) | 5.37 (C | P) | 4.85 (C | P) | 5.02 (C | P) | 4.51 (C | P) | 5.42 (C | P) | 4.37 (C | P) | 4.13 (C | P) | 5.31 (C | P) | 6.16 (C | P) | 3.94 (C | P) | 6.75 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1269342 | E8a_E11a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 4 | 0 | 3.55 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.00 (C | P) | 5.13 (C | P) | 4.65 (C | P) | 6.05 (C | P) | 5.51 (C | P) | 3.85 (C | P) | 5.16 (C | P) | 5.24 (C | P) | 6.63 (C | P) | 4.67 (C | P) | 5.97 (C | P) | 7.07 (C | P) | 5.29 (C | P) | 5.71 (C | P) | 4.80 (C | P) | 6.02 (C | P) | 5.60 (C | P) | 4.81 (C | P) | 6.94 (C | P) | 6.86 (C | P) | 7.43 (C | P) |
IN29519 | I8 | Intron | 1582 (79% | 0%) | 0 | 0 | 4.04 (C | P) | 4.01 (C | P) | 2.93 (C | P) | 3.49 (C | P) | 4.14 (C | P) | 3.24 (C | P) | 5.00 (C | P) | 3.10 (C | P) | 3.28 (C | P) | 2.92 (C | P) | 1.88 (C | P) | 3.95 (C | P) | 5.09 (C | P) | 3.01 (C | P) | 3.51 (C | P) | 3.37 (C | P) | 2.79 (C | P) | 2.65 (C | P) | 2.04 (C | P) | 3.56 (C | P) | 1.85 (C | P) | 1.99 (C | P) | 3.03 (C | P) |
AIN31719 | I8_AR1 | ActiveIntronRegion | 264 (90% | 0%) | 1 | 0 | 4.18 (C | P) | 4.12 (C | P) | 2.41 (C | P) | 3.04 (C | P) | 4.04 (C | P) | 2.28 (C | P) | 5.05 (C | P) | 2.99 (C | P) | 3.31 (C | P) | 3.15 (C | P) | 1.62 (C | P) | 3.61 (C | P) | 4.87 (C | P) | 2.99 (C | P) | 3.52 (C | P) | 2.78 (C | P) | 2.74 (C | P) | 2.25 (C | P) | 1.61 (C | P) | 3.63 (C | P) | 1.28 (C | P) | 2.05 (C | P) | 2.92 (C | P) |
AIN31718 | I8_AR2 | ActiveIntronRegion | 607 (100% | 0%) | 1 | 0 | 4.37 (C | P) | 4.45 (C | P) | 3.29 (C | P) | 3.81 (C | P) | 4.53 (C | P) | 3.59 (C | P) | 5.31 (C | P) | 3.44 (C | P) | 3.74 (C | P) | 2.99 (C | P) | 1.60 (C | P) | 4.43 (C | P) | 5.68 (C | P) | 2.80 (C | P) | 3.54 (C | P) | 3.57 (C | P) | 2.57 (C | P) | 2.36 (C | P) | 2.22 (C | P) | 3.47 (C | P) | 1.77 (C | P) | 2.26 (C | P) | 3.23 (C | P) |
EB209069 | E9_Aa | NovelBoundary | 62 (61% | 50%) | 0 | 0 | 3.10 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.37 (C | P) | 0.00 (C | P) | 6.19 (C | P) | 2.56 (C | P) | 1.48 (C | P) | 1.90 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.81 (C | P) | 4.87 (C | P) | 2.69 (C | P) | 2.87 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.54 (C | P) | 3.73 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.17 (C | P) |
ER52088 | ER9a | ExonRegion | 33 (100% | 100%) | 5 | 3 | 1.61 (C | P) | 1.89 (C | P) | 0.95 (C | P) | 2.31 (C | P) | 3.79 (C | P) | 3.15 (C | P) | 3.84 (C | P) | 1.63 (C | P) | 2.73 (C | P) | 2.09 (C | P) | 2.00 (C | P) | 4.30 (C | P) | 4.30 (C | P) | 2.04 (C | P) | 3.16 (C | P) | 2.59 (C | P) | 2.10 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.78 (C | P) | 2.74 (C | P) | 3.78 (C | P) | 2.58 (C | P) |
EB209071 | E9_Da | KnownBoundary | 62 (100% | 100%) | 1 | 1 | 2.23 (C | P) | 2.83 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.50 (C | P) | 4.13 (C | P) | 3.65 (C | P) | 5.21 (C | P) | 3.36 (C | P) | 2.64 (C | P) | 2.35 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.72 (C | P) | 5.58 (C | P) | 1.79 (C | P) | 4.28 (C | P) | 3.22 (C | P) | 2.48 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.67 (C | P) | 1.74 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.30 (C | P) |
EJ1269359 | E9a_E10a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 3 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.61 (C | P) | 2.22 (C | P) | 1.96 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.42 (C | P) | 1.28 (C | P) | 1.75 (C | P) | 2.87 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.81 (C | P) | 4.21 (C | P) | 3.15 (C | P) |
EJ1269360 | E9a_E11a | NovelJunction | 62 (100% | 100%) | 1 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.22 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER52089 | ER9b | ExonRegion | 81 (100% | 100%) | 0 | 0 | 2.46 (C | P) | 2.33 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.29 (C | P) | 3.35 (C | P) | 3.14 (C | P) | 3.99 (C | P) | 1.76 (C | P) | 2.22 (C | P) | 2.46 (C | P) | 1.15 (C | P) | 3.95 (C | P) | 5.53 (C | P) | 2.54 (C | P) | 3.44 (C | P) | 1.37 (C | P) | 2.56 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.05 (C | P) |
EB209070 | E9_Db | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 1 | 4.27 (C | P) | 4.02 (C | P) | 2.53 (C | P) | 2.32 (C | P) | 3.78 (C | P) | 1.68 (C | P) | 4.98 (C | P) | 4.62 (C | P) | 3.74 (C | P) | 2.72 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.74 (C | P) | 5.59 (C | P) | 2.63 (C | P) | 4.69 (C | P) | 5.00 (C | P) | 2.41 (C | P) | 1.84 (C | P) | 2.46 (C | P) | 4.19 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.86 (C | P) | 3.19 (C | P) |
IN29518 | I9 | Intron | 3550 (87% | 0%) | 0 | 0 | 3.47 (C | P) | 3.00 (C | P) | 2.65 (C | P) | 3.49 (C | P) | 3.60 (C | P) | 3.06 (C | P) | 4.71 (C | P) | 3.13 (C | P) | 3.38 (C | P) | 2.72 (C | P) | 2.13 (C | P) | 3.33 (C | P) | 4.37 (C | P) | 2.62 (C | P) | 3.12 (C | P) | 3.37 (C | P) | 3.40 (C | P) | 3.80 (C | P) | 2.51 (C | P) | 3.58 (C | P) | 2.84 (C | P) | 2.21 (C | P) | 3.57 (C | P) |
AIN31715 | I9_AR3 | ActiveIntronRegion | 581 (88% | 0%) | 1 | 0 | 3.44 (C | P) | 2.47 (C | P) | 2.57 (C | P) | 3.35 (C | P) | 3.39 (C | P) | 3.22 (C | P) | 4.77 (C | P) | 2.88 (C | P) | 3.68 (C | P) | 2.65 (C | P) | 2.25 (C | P) | 2.94 (C | P) | 4.17 (C | P) | 2.31 (C | P) | 2.49 (C | P) | 2.89 (C | P) | 3.56 (C | P) | 3.36 (C | P) | 1.79 (C | P) | 3.58 (C | P) | 2.07 (C | P) | 1.80 (C | P) | 3.20 (C | P) |
SIN42793 | I9_SR3 | SilentIntronRegion | 1139 (100% | 0%) | 0 | 0 | 3.76 (C | P) | 3.07 (C | P) | 2.61 (C | P) | 3.68 (C | P) | 3.69 (C | P) | 2.94 (C | P) | 5.00 (C | P) | 3.49 (C | P) | 3.53 (C | P) | 2.86 (C | P) | 2.28 (C | P) | 3.23 (C | P) | 4.49 (C | P) | 2.88 (C | P) | 3.23 (C | P) | 3.62 (C | P) | 3.67 (C | P) | 3.96 (C | P) | 2.73 (C | P) | 3.84 (C | P) | 2.95 (C | P) | 2.60 (C | P) | 3.69 (C | P) |
AIN31714 | I9_AR4 | ActiveIntronRegion | 269 (100% | 0%) | 1 | 0 | 3.82 (C | P) | 2.62 (C | P) | 2.50 (C | P) | 3.83 (C | P) | 3.66 (C | P) | 3.42 (C | P) | 4.48 (C | P) | 3.08 (C | P) | 3.24 (C | P) | 2.64 (C | P) | 2.09 (C | P) | 3.14 (C | P) | 5.31 (C | P) | 2.47 (C | P) | 3.23 (C | P) | 3.01 (C | P) | 4.08 (C | P) | 4.31 (C | P) | 3.12 (C | P) | 3.48 (C | P) | 3.62 (C | P) | 2.59 (C | P) | 4.14 (C | P) |
ER52090 | ER10a | ExonRegion | 105 (100% | 100%) | 6 | 6 | 3.77 (C | P) | 5.17 (C | P) | 4.95 (C | P) | 5.40 (C | P) | 5.39 (C | P) | 6.88 (C | P) | 5.85 (C | P) | 6.05 (C | P) | 6.96 (C | P) | 5.52 (C | P) | 4.85 (C | P) | 4.78 (C | P) | 5.79 (C | P) | 5.54 (C | P) | 4.13 (C | P) | 5.20 (C | P) | 5.40 (C | P) | 6.69 (C | P) | 4.43 (C | P) | 6.39 (C | P) | 3.55 (C | P) | 3.51 (C | P) | 3.26 (C | P) |
EJ1269395 | E10a_E11a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 6 | 0 | 4.26 (C | P) | 4.66 (C | P) | 5.06 (C | P) | 5.79 (C | P) | 4.97 (C | P) | 6.20 (C | P) | 5.04 (C | P) | 6.16 (C | P) | 7.21 (C | P) | 5.57 (C | P) | 4.72 (C | P) | 3.72 (C | P) | 6.69 (C | P) | 5.85 (C | P) | 4.54 (C | P) | 5.12 (C | P) | 4.53 (C | P) | 6.61 (C | P) | 3.85 (C | P) | 6.47 (C | P) | 2.74 (C | P) | 2.72 (C | P) | 2.32 (C | P) |
EB209074 | E11_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 4.13 (C | P) | 1.86 (C | P) | 3.82 (C | P) | 5.17 (C | P) | 2.14 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.34 (C | P) | 3.33 (C | P) | 3.35 (C | P) | 3.17 (C | P) | 1.86 (C | P) | 0.00 (C | P) | 5.20 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.57 (C | P) | 3.19 (C | P) | 2.46 (C | P) | 3.15 (C | P) | 2.31 (C | P) | 3.75 (C | P) | 2.71 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.00 (C | P) |
ER52091 | ER11a | ExonRegion | 945 (100% | 100%) | 5 | 1 | 5.91 (C | P) | 6.04 (C | P) | 5.85 (C | P) | 6.28 (C | P) | 6.71 (C | P) | 7.29 (C | P) | 6.79 (C | P) | 6.54 (C | P) | 6.99 (C | P) | 6.29 (C | P) | 6.95 (C | P) | 7.22 (C | P) | 7.85 (C | P) | 7.49 (C | P) | 5.68 (C | P) | 6.56 (C | P) | 6.48 (C | P) | 6.68 (C | P) | 5.50 (C | P) | 6.29 (C | P) | 6.83 (C | P) | 6.93 (C | P) | 7.01 (C | P) |
EJ1269412 | E11a_E12a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 10 | 0 | 6.25 (C | P) | 3.47 (C | P) | 5.33 (C | P) | 5.05 (C | P) | 6.63 (C | P) | 5.93 (C | P) | 6.17 (C | P) | 2.86 (C | P) | 4.71 (C | P) | 4.47 (C | P) | 6.71 (C | P) | 7.34 (C | P) | 7.97 (C | P) | 7.26 (C | P) | 6.12 (C | P) | 6.75 (C | P) | 6.18 (C | P) | 4.16 (C | P) | 4.51 (C | P) | 2.09 (C | P) | 6.25 (C | P) | 6.60 (C | P) | 6.50 (C | P) |
AIN31712 | I11_AR1 | ActiveIntronRegion | 544 (63% | 0%) | 1 | 0 | 3.20 (C | P) | 3.30 (C | P) | 2.82 (C | P) | 4.46 (C | P) | 4.30 (C | P) | 4.56 (C | P) | 4.97 (C | P) | 4.09 (C | P) | 4.38 (C | P) | 2.61 (C | P) | 0.84 (C | P) | 2.40 (C | P) | 3.62 (C | P) | 2.25 (C | P) | 2.72 (C | P) | 2.99 (C | P) | 2.75 (C | P) | 2.51 (C | P) | 2.05 (C | P) | 4.02 (C | P) | 1.30 (C | P) | 2.48 (C | P) | 3.51 (C | P) |
EB209076 | E12_Aa | NovelBoundary | 62 (89% | 50%) | 0 | 0 | 4.40 (C | P) | 4.64 (C | P) | 3.84 (C | P) | 4.11 (C | P) | 5.37 (C | P) | 5.32 (C | P) | 6.37 (C | P) | 4.05 (C | P) | 5.42 (C | P) | 3.60 (C | P) | 2.53 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.87 (C | P) | 1.70 (C | P) | 2.45 (C | P) | 3.73 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.27 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.73 (C | P) | 3.17 (C | P) | 2.00 (C | P) | 3.63 (C | P) |
ER52092 | ER12a | ExonRegion | 117 (100% | 100%) | 12 | 6 | 5.52 (C | P) | 4.74 (C | P) | 5.03 (C | P) | 5.05 (C | P) | 6.23 (C | P) | 5.80 (C | P) | 6.34 (C | P) | 4.60 (C | P) | 5.00 (C | P) | 4.73 (C | P) | 7.04 (C | P) | 7.74 (C | P) | 8.44 (C | P) | 7.13 (C | P) | 5.62 (C | P) | 6.19 (C | P) | 6.41 (C | P) | 3.83 (C | P) | 4.60 (C | P) | 4.40 (C | P) | 5.88 (C | P) | 7.06 (C | P) | 6.40 (C | P) |
EJ1269428 | E12a_E13a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 10 | 0 | 6.46 (C | P) | 4.38 (C | P) | 5.20 (C | P) | 4.67 (C | P) | 6.79 (C | P) | 4.01 (C | P) | 6.29 (C | P) | 4.32 (C | P) | 4.61 (C | P) | 3.92 (C | P) | 6.98 (C | P) | 7.68 (C | P) | 8.09 (C | P) | 7.38 (C | P) | 5.51 (C | P) | 5.83 (C | P) | 6.89 (C | P) | 2.42 (C | P) | 4.72 (C | P) | 4.59 (C | P) | 6.10 (C | P) | 7.45 (C | P) | 6.24 (C | P) |
IN29515 | I12 | Intron | 1926 (72% | 0%) | 0 | 0 | 2.69 (C | P) | 3.69 (C | P) | 2.60 (C | P) | 4.03 (C | P) | 3.79 (C | P) | 4.37 (C | P) | 4.68 (C | P) | 3.70 (C | P) | 3.93 (C | P) | 3.14 (C | P) | 1.71 (C | P) | 2.17 (C | P) | 3.22 (C | P) | 1.64 (C | P) | 2.48 (C | P) | 2.43 (C | P) | 2.10 (C | P) | 3.22 (C | P) | 2.45 (C | P) | 4.09 (C | P) | 2.61 (C | P) | 2.18 (C | P) | 2.99 (C | P) |
AIN31710 | I12_AR1 | ActiveIntronRegion | 623 (74% | 0%) | 1 | 0 | 2.56 (C | P) | 3.34 (C | P) | 1.59 (C | P) | 3.66 (C | P) | 3.61 (C | P) | 4.47 (C | P) | 4.66 (C | P) | 3.69 (C | P) | 3.82 (C | P) | 3.32 (C | P) | 1.32 (C | P) | 1.12 (C | P) | 2.30 (C | P) | 1.58 (C | P) | 1.53 (C | P) | 2.71 (C | P) | 1.29 (C | P) | 2.18 (C | P) | 1.26 (C | P) | 3.72 (C | P) | 2.13 (C | P) | 2.36 (C | P) | 2.96 (C | P) |
AIN31709 | I12_AR2 | ActiveIntronRegion | 559 (100% | 0%) | 1 | 0 | 3.24 (C | P) | 4.09 (C | P) | 3.29 (C | P) | 4.73 (C | P) | 4.31 (C | P) | 4.62 (C | P) | 4.99 (C | P) | 4.16 (C | P) | 4.37 (C | P) | 3.41 (C | P) | 2.27 (C | P) | 3.00 (C | P) | 4.01 (C | P) | 1.87 (C | P) | 2.86 (C | P) | 2.33 (C | P) | 2.66 (C | P) | 3.90 (C | P) | 3.07 (C | P) | 4.49 (C | P) | 2.82 (C | P) | 2.19 (C | P) | 3.29 (C | P) |
ER52093 | ER13a | ExonRegion | 58 (100% | 100%) | 13 | 8 | 5.95 (C | P) | 6.35 (C | P) | 5.82 (C | P) | 6.54 (C | P) | 6.87 (C | P) | 7.08 (C | P) | 6.64 (C | P) | 5.90 (C | P) | 6.29 (C | P) | 5.91 (C | P) | 7.07 (C | P) | 7.66 (C | P) | 8.26 (C | P) | 7.07 (C | P) | 6.06 (C | P) | 6.37 (C | P) | 6.29 (C | P) | 4.93 (C | P) | 4.72 (C | P) | 6.17 (C | P) | 5.81 (C | P) | 7.13 (C | P) | 6.35 (C | P) |
EJ1269443 | E13a_E14a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 13 | 0 | 6.43 (C | P) | 6.86 (C | P) | 6.29 (C | P) | 7.31 (C | P) | 6.83 (C | P) | 7.71 (C | P) | 6.94 (C | P) | 6.92 (C | P) | 7.18 (C | P) | 6.78 (C | P) | 7.15 (C | P) | 7.44 (C | P) | 8.32 (C | P) | 6.96 (C | P) | 6.40 (C | P) | 6.19 (C | P) | 5.85 (C | P) | 5.70 (C | P) | 4.65 (C | P) | 6.71 (C | P) | 4.27 (C | P) | 7.04 (C | P) | 5.96 (C | P) |
ER52094 | ER14a | ExonRegion | 84 (100% | 100%) | 13 | 9 | 7.80 (C | P) | 7.51 (C | P) | 6.14 (C | P) | 7.01 (C | P) | 7.16 (C | P) | 7.86 (C | P) | 7.38 (C | P) | 7.16 (C | P) | 7.40 (C | P) | 6.63 (C | P) | 7.16 (C | P) | 7.78 (C | P) | 8.69 (C | P) | 6.95 (C | P) | 5.99 (C | P) | 5.82 (C | P) | 6.47 (C | P) | 5.54 (C | P) | 4.97 (C | P) | 6.99 (C | P) | 5.46 (C | P) | 7.34 (C | P) | 6.28 (C | P) |
EJ1269457 | E14a_E15a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 14 | 0 | 8.35 (C | P) | 7.95 (C | P) | 6.28 (C | P) | 7.27 (C | P) | 7.40 (C | P) | 8.25 (C | P) | 7.92 (C | P) | 7.11 (C | P) | 7.47 (C | P) | 6.64 (C | P) | 6.92 (C | P) | 7.85 (C | P) | 9.01 (C | P) | 7.29 (C | P) | 6.21 (C | P) | 5.31 (C | P) | 6.39 (C | P) | 5.07 (C | P) | 5.46 (C | P) | 7.20 (C | P) | 5.21 (C | P) | 7.25 (C | P) | 6.68 (C | P) |
ER52095 | ER15a | ExonRegion | 157 (100% | 100%) | 11 | 9 | 7.00 (C | P) | 8.32 (C | P) | 6.23 (C | P) | 7.20 (C | P) | 7.33 (C | P) | 7.74 (C | P) | 7.31 (C | P) | 6.80 (C | P) | 7.13 (C | P) | 6.71 (C | P) | 6.78 (C | P) | 7.88 (C | P) | 8.45 (C | P) | 6.74 (C | P) | 6.27 (C | P) | 5.57 (C | P) | 5.71 (C | P) | 5.34 (C | P) | 5.04 (C | P) | 6.64 (C | P) | 4.65 (C | P) | 7.23 (C | P) | 6.09 (C | P) |
EJ1269470 | E15a_E16a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 15 | 0 | 6.77 (C | P) | 7.75 (C | P) | 6.96 (C | P) | 7.76 (C | P) | 7.43 (C | P) | 7.73 (C | P) | 7.55 (C | P) | 7.22 (C | P) | 7.55 (C | P) | 6.89 (C | P) | 6.34 (C | P) | 7.98 (C | P) | 8.99 (C | P) | 7.05 (C | P) | 6.16 (C | P) | 6.64 (C | P) | 6.00 (C | P) | 5.75 (C | P) | 5.42 (C | P) | 6.95 (C | P) | 5.10 (C | P) | 7.65 (C | P) | 6.40 (C | P) |
ER52096 | ER16a | ExonRegion | 39 (100% | 100%) | 15 | 9 | 6.08 (C | P) | 7.58 (C | P) | 6.85 (C | P) | 7.84 (C | P) | 7.38 (C | P) | 7.56 (C | P) | 7.29 (C | P) | 7.44 (C | P) | 7.60 (C | P) | 6.92 (C | P) | 7.14 (C | P) | 8.24 (C | P) | 8.79 (C | P) | 7.16 (C | P) | 6.31 (C | P) | 6.60 (C | P) | 5.90 (C | P) | 6.02 (C | P) | 6.01 (C | P) | 6.96 (C | P) | 5.88 (C | P) | 7.63 (C | P) | 6.39 (C | P) |
EB209086 | E16_Ac | KnownBoundary | 62 (100% | 100%) | 14 | 11 | 7.25 (C | P) | 7.85 (C | P) | 7.30 (C | P) | 8.16 (C | P) | 7.44 (C | P) | 7.25 (C | P) | 7.36 (C | P) | 7.57 (C | P) | 7.75 (C | P) | 6.85 (C | P) | 6.79 (C | P) | 8.21 (C | P) | 8.95 (C | P) | 7.38 (C | P) | 6.85 (C | P) | 6.26 (C | P) | 6.24 (C | P) | 6.40 (C | P) | 5.74 (C | P) | 7.16 (C | P) | 6.79 (C | P) | 7.44 (C | P) | 7.10 (C | P) |
ER52097 | ER16b | ExonRegion | 26 (100% | 100%) | 15 | 11 | 6.51 (C | P) | 7.65 (C | P) | 6.90 (C | P) | 7.98 (C | P) | 7.32 (C | P) | 7.34 (C | P) | 7.10 (C | P) | 7.49 (C | P) | 7.59 (C | P) | 6.91 (C | P) | 7.14 (C | P) | 8.33 (C | P) | 8.71 (C | P) | 7.41 (C | P) | 6.51 (C | P) | 6.32 (C | P) | 5.85 (C | P) | 6.40 (C | P) | 5.88 (C | P) | 7.11 (C | P) | 6.59 (C | P) | 7.55 (C | P) | 6.80 (C | P) |
ER52098 | ER16c | ExonRegion | 3 (100% | 100%) | 16 | 11 | 6.80 (C | P) | 7.75 (C | P) | 6.88 (C | P) | 7.89 (C | P) | 7.32 (C | P) | 7.30 (C | P) | 7.07 (C | P) | 7.39 (C | P) | 7.62 (C | P) | 6.75 (C | P) | 6.82 (C | P) | 8.25 (C | P) | 8.91 (C | P) | 7.37 (C | P) | 6.34 (C | P) | 6.41 (C | P) | 6.09 (C | P) | 6.45 (C | P) | 5.70 (C | P) | 7.07 (C | P) | 6.62 (C | P) | 7.46 (C | P) | 6.89 (C | P) |
ER52099 | ER16d | ExonRegion | 98 (100% | 100%) | 13 | 7 | 7.49 (C | P) | 8.31 (C | P) | 6.48 (C | P) | 7.41 (C | P) | 7.45 (C | P) | 7.73 (C | P) | 7.10 (C | P) | 7.08 (C | P) | 7.48 (C | P) | 6.52 (C | P) | 6.89 (C | P) | 8.34 (C | P) | 8.42 (C | P) | 7.16 (C | P) | 6.48 (C | P) | 6.19 (C | P) | 6.48 (C | P) | 6.61 (C | P) | 5.03 (C | P) | 6.82 (C | P) | 6.68 (C | P) | 6.92 (C | P) | 6.59 (C | P) |
EJ1269482 | E16b_E17a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 16 | 0 | 8.45 (C | P) | 8.78 (C | P) | 6.12 (C | P) | 7.19 (C | P) | 7.78 (C | P) | 8.65 (C | P) | 7.77 (C | P) | 6.80 (C | P) | 7.49 (C | P) | 6.47 (C | P) | 6.84 (C | P) | 7.72 (C | P) | 7.93 (C | P) | 6.71 (C | P) | 6.51 (C | P) | 6.14 (C | P) | 6.54 (C | P) | 6.45 (C | P) | 5.47 (C | P) | 6.96 (C | P) | 6.27 (C | P) | 6.91 (C | P) | 6.67 (C | P) |
ER52100 | ER17a | ExonRegion | 216 (100% | 100%) | 14 | 7 | 6.23 (C | P) | 7.64 (C | P) | 6.19 (C | P) | 6.78 (C | P) | 6.73 (C | P) | 7.33 (C | P) | 6.67 (C | P) | 6.65 (C | P) | 7.20 (C | P) | 6.44 (C | P) | 6.70 (C | P) | 7.63 (C | P) | 7.82 (C | P) | 7.40 (C | P) | 6.42 (C | P) | 6.42 (C | P) | 6.51 (C | P) | 6.84 (C | P) | 5.44 (C | P) | 6.59 (C | P) | 7.00 (C | P) | 6.97 (C | P) | 6.84 (C | P) |
EJ1269492 | E17a_E18a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 19 | 0 | 6.42 (C | P) | 6.97 (C | P) | 6.46 (C | P) | 6.42 (C | P) | 6.99 (C | P) | 7.57 (C | P) | 6.17 (C | P) | 6.18 (C | P) | 6.89 (C | P) | 6.08 (C | P) | 6.63 (C | P) | 6.92 (C | P) | 7.41 (C | P) | 6.99 (C | P) | 5.59 (C | P) | 6.93 (C | P) | 6.00 (C | P) | 6.22 (C | P) | 5.21 (C | P) | 6.60 (C | P) | 6.96 (C | P) | 7.19 (C | P) | 6.42 (C | P) |
IN29510 | I17 | Intron | 8598 (64% | 0%) | 0 | 0 | 2.10 (C | P) | 3.63 (C | P) | 3.12 (C | P) | 4.17 (C | P) | 4.17 (C | P) | 3.73 (C | P) | 4.68 (C | P) | 2.36 (C | P) | 2.13 (C | P) | 3.24 (C | P) | 1.15 (C | P) | 1.86 (C | P) | 2.44 (C | P) | 1.07 (C | P) | 1.72 (C | P) | 1.59 (C | P) | 1.58 (C | P) | 4.29 (C | P) | 2.56 (C | P) | 3.99 (C | P) | 1.66 (C | P) | 1.04 (C | P) | 2.24 (C | P) |
AIN31705 | I17_AR2 | ActiveIntronRegion | 419 (100% | 0%) | 1 | 0 | 1.97 (C | P) | 4.51 (C | P) | 3.00 (C | P) | 4.49 (C | P) | 3.95 (C | P) | 3.23 (C | P) | 4.79 (C | P) | 3.46 (C | P) | 2.70 (C | P) | 2.51 (C | P) | 0.44 (C | P) | 2.37 (C | P) | 3.71 (C | P) | 0.88 (C | P) | 2.30 (C | P) | 1.80 (C | P) | 0.49 (C | P) | 2.95 (C | P) | 1.74 (C | P) | 4.06 (C | P) | 0.97 (C | P) | 0.59 (C | P) | 2.04 (C | P) |
AIN31704 | I17_AR3 | ActiveIntronRegion | 213 (100% | 0%) | 1 | 1 | 1.60 (C | P) | 4.99 (C | P) | 3.26 (C | P) | 3.86 (C | P) | 5.08 (C | P) | 3.78 (C | P) | 5.05 (C | P) | 2.33 (C | P) | 1.82 (C | P) | 3.69 (C | P) | 0.74 (C | P) | 2.24 (C | P) | 2.07 (C | P) | 1.36 (C | P) | 1.17 (C | P) | 0.89 (C | P) | 2.03 (C | P) | 4.32 (C | P) | 2.94 (C | P) | 4.41 (C | P) | 1.65 (C | P) | 0.82 (C | P) | 1.93 (C | P) |
AIN31703 | I17_AR4 | ActiveIntronRegion | 35 (100% | 0%) | 1 | 2 | 2.27 (C | P) | 4.39 (C | P) | 2.81 (C | P) | 4.71 (C | P) | 5.64 (C | P) | 4.78 (C | P) | 5.93 (C | P) | 1.93 (C | P) | 0.89 (C | P) | 4.06 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.24 (C | P) | 2.36 (C | P) | 2.02 (C | P) | 1.96 (C | P) | 1.34 (C | P) | 1.53 (C | P) | 4.86 (C | P) | 3.30 (C | P) | 5.03 (C | P) | 2.45 (C | P) | 2.30 (C | P) | 1.94 (C | P) |
SIN42782 | I17_SR2 | SilentIntronRegion | 338 (100% | 0%) | 0 | 1 | 2.46 (C | P) | 4.41 (C | P) | 3.40 (C | P) | 4.39 (C | P) | 4.64 (C | P) | 3.91 (C | P) | 5.18 (C | P) | 1.15 (C | P) | 2.03 (C | P) | 3.88 (C | P) | 1.76 (C | P) | 3.42 (C | P) | 2.52 (C | P) | 1.13 (C | P) | 1.21 (C | P) | 2.38 (C | P) | 3.00 (C | P) | 5.17 (C | P) | 3.55 (C | P) | 4.57 (C | P) | 2.57 (C | P) | 1.20 (C | P) | 1.77 (C | P) |
AIN31702 | I17_AR5 | ActiveIntronRegion | 723 (100% | 0%) | 1 | 0 | 2.11 (C | P) | 3.72 (C | P) | 3.74 (C | P) | 4.53 (C | P) | 4.72 (C | P) | 4.49 (C | P) | 4.99 (C | P) | 2.52 (C | P) | 1.75 (C | P) | 4.02 (C | P) | 1.31 (C | P) | 1.11 (C | P) | 2.76 (C | P) | 1.14 (C | P) | 1.43 (C | P) | 1.66 (C | P) | 1.48 (C | P) | 4.92 (C | P) | 3.28 (C | P) | 4.70 (C | P) | 1.44 (C | P) | 0.67 (C | P) | 2.41 (C | P) |
SIN42781 | I17_SR3 | SilentIntronRegion | 717 (100% | 0%) | 0 | 0 | 2.08 (C | P) | 3.64 (C | P) | 4.26 (C | P) | 4.79 (C | P) | 4.81 (C | P) | 4.61 (C | P) | 5.09 (C | P) | 3.09 (C | P) | 2.83 (C | P) | 4.34 (C | P) | 0.86 (C | P) | 2.03 (C | P) | 2.45 (C | P) | 1.12 (C | P) | 1.89 (C | P) | 2.39 (C | P) | 2.54 (C | P) | 5.67 (C | P) | 3.47 (C | P) | 4.86 (C | P) | 2.15 (C | P) | 0.80 (C | P) | 2.96 (C | P) |
AIN31701 | I17_AR6 | ActiveIntronRegion | 156 (100% | 0%) | 1 | 1 | 2.54 (C | P) | 3.60 (C | P) | 3.82 (C | P) | 4.65 (C | P) | 5.08 (C | P) | 3.79 (C | P) | 4.76 (C | P) | 3.24 (C | P) | 2.75 (C | P) | 3.36 (C | P) | 0.80 (C | P) | 0.83 (C | P) | 2.00 (C | P) | 1.13 (C | P) | 2.09 (C | P) | 1.96 (C | P) | 0.61 (C | P) | 4.75 (C | P) | 3.51 (C | P) | 4.47 (C | P) | 1.68 (C | P) | 1.40 (C | P) | 2.51 (C | P) |
EB209089 | E18_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 2 | 3.02 (C | P) | 5.25 (C | P) | 2.44 (C | P) | 5.39 (C | P) | 3.99 (C | P) | 5.07 (C | P) | 5.03 (C | P) | 2.36 (C | P) | 2.71 (C | P) | 3.47 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.84 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.57 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.17 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.01 (C | P) | 2.54 (C | P) | 4.03 (C | P) | 2.75 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.42 (C | P) |
ER52101 | ER18a | ExonRegion | 117 (100% | 100%) | 20 | 8 | 6.29 (C | P) | 7.44 (C | P) | 6.33 (C | P) | 7.18 (C | P) | 7.52 (C | P) | 8.25 (C | P) | 7.31 (C | P) | 6.70 (C | P) | 7.20 (C | P) | 6.35 (C | P) | 7.02 (C | P) | 6.78 (C | P) | 7.86 (C | P) | 7.50 (C | P) | 6.69 (C | P) | 6.46 (C | P) | 6.36 (C | P) | 7.23 (C | P) | 5.89 (C | P) | 6.77 (C | P) | 6.68 (C | P) | 7.14 (C | P) | 7.22 (C | P) |
EJ1269501 | E18a_E19a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 19 | 0 | 6.71 (C | P) | 7.68 (C | P) | 6.61 (C | P) | 7.35 (C | P) | 8.35 (C | P) | 8.64 (C | P) | 8.00 (C | P) | 6.90 (C | P) | 7.28 (C | P) | 6.72 (C | P) | 6.86 (C | P) | 7.65 (C | P) | 8.26 (C | P) | 7.77 (C | P) | 6.91 (C | P) | 6.56 (C | P) | 6.38 (C | P) | 7.10 (C | P) | 4.93 (C | P) | 7.07 (C | P) | 6.30 (C | P) | 6.94 (C | P) | 7.30 (C | P) |
ER52102 | ER19a | ExonRegion | 107 (100% | 100%) | 21 | 10 | 6.40 (C | P) | 7.43 (C | P) | 6.32 (C | P) | 7.02 (C | P) | 7.83 (C | P) | 8.22 (C | P) | 7.63 (C | P) | 6.82 (C | P) | 7.26 (C | P) | 6.71 (C | P) | 7.04 (C | P) | 6.80 (C | P) | 7.60 (C | P) | 7.54 (C | P) | 6.18 (C | P) | 6.71 (C | P) | 6.43 (C | P) | 6.99 (C | P) | 5.87 (C | P) | 6.86 (C | P) | 6.49 (C | P) | 7.16 (C | P) | 6.97 (C | P) |
EJ1269509 | E19a_E20a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 21 | 0 | 7.03 (C | P) | 7.72 (C | P) | 6.46 (C | P) | 7.31 (C | P) | 7.85 (C | P) | 7.86 (C | P) | 7.29 (C | P) | 7.06 (C | P) | 7.53 (C | P) | 6.76 (C | P) | 7.13 (C | P) | 6.46 (C | P) | 7.83 (C | P) | 7.59 (C | P) | 6.71 (C | P) | 6.47 (C | P) | 6.55 (C | P) | 7.06 (C | P) | 6.27 (C | P) | 6.79 (C | P) | 6.49 (C | P) | 7.52 (C | P) | 7.29 (C | P) |
SIN42776 | I19_SR2 | SilentIntronRegion | 6 (100% | 0%) | 0 | 0 | 2.39 (C | P) | 2.34 (C | P) | 4.37 (C | P) | 2.35 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.87 (C | P) | 2.63 (C | P) | 2.24 (C | P) | 1.72 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.39 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.79 (C | P) | 2.10 (C | P) | 1.16 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.40 (C | P) | 2.11 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.98 (C | P) |
ER52103 | ER20a | ExonRegion | 121 (100% | 100%) | 17 | 9 | 6.06 (C | P) | 7.48 (C | P) | 6.20 (C | P) | 6.78 (C | P) | 7.25 (C | P) | 7.81 (C | P) | 7.04 (C | P) | 6.90 (C | P) | 7.33 (C | P) | 6.58 (C | P) | 7.05 (C | P) | 7.04 (C | P) | 7.57 (C | P) | 7.29 (C | P) | 6.31 (C | P) | 6.28 (C | P) | 6.49 (C | P) | 7.04 (C | P) | 5.07 (C | P) | 6.57 (C | P) | 6.60 (C | P) | 6.96 (C | P) | 6.91 (C | P) |
EJ1269516 | E20a_E21a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 26 | 0 | 6.19 (C | P) | 7.93 (C | P) | 5.77 (C | P) | 6.81 (C | P) | 7.56 (C | P) | 8.46 (C | P) | 7.17 (C | P) | 7.22 (C | P) | 7.38 (C | P) | 6.68 (C | P) | 7.24 (C | P) | 7.74 (C | P) | 7.67 (C | P) | 7.15 (C | P) | 6.44 (C | P) | 6.43 (C | P) | 6.72 (C | P) | 6.83 (C | P) | 5.63 (C | P) | 6.16 (C | P) | 6.69 (C | P) | 7.58 (C | P) | 7.00 (C | P) |
AIN31695 | I20_AR3 | ActiveIntronRegion | 105 (100% | 0%) | 1 | 0 | 4.67 (C | P) | 4.50 (C | P) | 3.32 (C | P) | 4.17 (C | P) | 3.35 (C | P) | 2.12 (C | P) | 3.31 (C | P) | 3.61 (C | P) | 3.85 (C | P) | 3.32 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.45 (C | P) | 3.53 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.59 (C | P) | 0.82 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.23 (C | P) | 1.35 (C | P) | 2.77 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.01 (C | P) | 2.11 (C | P) |
ER52104 | ER21a | ExonRegion | 53 (100% | 100%) | 26 | 13 | 6.30 (C | P) | 7.64 (C | P) | 6.01 (C | P) | 7.11 (C | P) | 7.75 (C | P) | 8.52 (C | P) | 7.55 (C | P) | 7.01 (C | P) | 7.44 (C | P) | 6.77 (C | P) | 7.30 (C | P) | 7.68 (C | P) | 6.85 (C | P) | 7.51 (C | P) | 6.25 (C | P) | 6.72 (C | P) | 7.01 (C | P) | 7.03 (C | P) | 5.73 (C | P) | 6.62 (C | P) | 6.98 (C | P) | 7.29 (C | P) | 6.92 (C | P) |
EJ1269522 | E21a_E22a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 24 | 0 | 6.52 (C | P) | 7.44 (C | P) | 6.30 (C | P) | 7.19 (C | P) | 7.90 (C | P) | 8.54 (C | P) | 7.86 (C | P) | 6.93 (C | P) | 7.58 (C | P) | 6.69 (C | P) | 7.27 (C | P) | 7.89 (C | P) | 6.57 (C | P) | 7.49 (C | P) | 6.30 (C | P) | 7.00 (C | P) | 7.27 (C | P) | 6.95 (C | P) | 6.27 (C | P) | 7.13 (C | P) | 7.19 (C | P) | 7.36 (C | P) | 7.22 (C | P) |
ER52105 | ER22a | ExonRegion | 118 (100% | 100%) | 25 | 11 | 5.98 (C | P) | 7.06 (C | P) | 6.38 (C | P) | 6.88 (C | P) | 7.52 (C | P) | 8.37 (C | P) | 7.53 (C | P) | 7.29 (C | P) | 7.76 (C | P) | 6.92 (C | P) | 7.21 (C | P) | 7.50 (C | P) | 7.21 (C | P) | 7.66 (C | P) | 6.70 (C | P) | 6.83 (C | P) | 6.99 (C | P) | 7.30 (C | P) | 5.93 (C | P) | 6.71 (C | P) | 7.08 (C | P) | 7.34 (C | P) | 7.17 (C | P) |
EJ1269527 | E22a_E23a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 24 | 0 | 6.06 (C | P) | 7.12 (C | P) | 6.40 (C | P) | 6.96 (C | P) | 6.87 (C | P) | 8.29 (C | P) | 7.42 (C | P) | 6.80 (C | P) | 7.72 (C | P) | 6.84 (C | P) | 6.78 (C | P) | 7.76 (C | P) | 6.91 (C | P) | 7.60 (C | P) | 7.18 (C | P) | 6.55 (C | P) | 7.16 (C | P) | 6.77 (C | P) | 5.96 (C | P) | 6.71 (C | P) | 6.81 (C | P) | 7.27 (C | P) | 6.99 (C | P) |
ER52106 | ER23a | ExonRegion | 151 (100% | 100%) | 21 | 8 | 6.11 (C | P) | 7.14 (C | P) | 6.29 (C | P) | 6.63 (C | P) | 6.83 (C | P) | 8.14 (C | P) | 6.86 (C | P) | 7.17 (C | P) | 7.63 (C | P) | 6.75 (C | P) | 6.86 (C | P) | 7.37 (C | P) | 6.97 (C | P) | 7.66 (C | P) | 6.55 (C | P) | 6.55 (C | P) | 6.88 (C | P) | 7.17 (C | P) | 5.78 (C | P) | 6.61 (C | P) | 7.17 (C | P) | 7.16 (C | P) | 7.08 (C | P) |
EB209100 | E23_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 5.10 (C | P) | 2.12 (C | P) | 3.43 (C | P) | 2.74 (C | P) | 4.08 (C | P) | 4.29 (C | P) | 4.80 (C | P) | 3.30 (C | P) | 4.52 (C | P) | 3.92 (C | P) | 1.88 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.75 (C | P) | 1.82 (C | P) | 2.79 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.44 (C | P) | 5.28 (C | P) | 4.47 (C | P) | 4.77 (C | P) | 4.40 (C | P) | 4.19 (C | P) | 3.60 (C | P) |
EJ1269531 | E23a_E24a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 24 | 0 | 7.13 (C | P) | 7.50 (C | P) | 6.43 (C | P) | 6.96 (C | P) | 7.57 (C | P) | 8.73 (C | P) | 7.14 (C | P) | 6.91 (C | P) | 7.60 (C | P) | 6.68 (C | P) | 6.61 (C | P) | 6.90 (C | P) | 7.52 (C | P) | 7.64 (C | P) | 7.35 (C | P) | 6.84 (C | P) | 6.03 (C | P) | 7.37 (C | P) | 5.69 (C | P) | 6.54 (C | P) | 7.23 (C | P) | 7.55 (C | P) | 6.62 (C | P) |
AIN31684 | I23_AR1 | ActiveIntronRegion | 209 (100% | 0%) | 1 | 0 | 2.82 (C | P) | 3.03 (C | P) | 2.31 (C | P) | 2.66 (C | P) | 3.52 (C | P) | 3.76 (C | P) | 3.23 (C | P) | 3.04 (C | P) | 3.85 (C | P) | 2.77 (C | P) | 2.78 (C | P) | 1.77 (C | P) | 1.29 (C | P) | 2.87 (C | P) | 1.55 (C | P) | 2.30 (C | P) | 2.49 (C | P) | 4.61 (C | P) | 2.69 (C | P) | 3.89 (C | P) | 3.58 (C | P) | 3.42 (C | P) | 3.04 (C | P) |
SIN42762 | I23_SR1 | SilentIntronRegion | 109 (100% | 0%) | 0 | 0 | 0.93 (C | P) | 2.93 (C | P) | 2.27 (C | P) | 3.08 (C | P) | 3.36 (C | P) | 3.57 (C | P) | 4.01 (C | P) | 2.74 (C | P) | 4.21 (C | P) | 3.21 (C | P) | 2.98 (C | P) | 1.50 (C | P) | 2.45 (C | P) | 3.38 (C | P) | 1.32 (C | P) | 2.28 (C | P) | 2.16 (C | P) | 4.43 (C | P) | 2.21 (C | P) | 4.27 (C | P) | 3.30 (C | P) | 3.06 (C | P) | 3.53 (C | P) |
ER52107 | ER24a | ExonRegion | 50 (100% | 100%) | 23 | 9 | 6.41 (C | P) | 7.38 (C | P) | 6.47 (C | P) | 6.81 (C | P) | 7.15 (C | P) | 8.61 (C | P) | 7.21 (C | P) | 7.15 (C | P) | 7.77 (C | P) | 6.65 (C | P) | 6.98 (C | P) | 6.87 (C | P) | 7.09 (C | P) | 7.59 (C | P) | 6.87 (C | P) | 6.71 (C | P) | 6.26 (C | P) | 7.15 (C | P) | 5.86 (C | P) | 6.62 (C | P) | 7.38 (C | P) | 7.46 (C | P) | 7.06 (C | P) |
EB209102 | E24_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 1 | 0 | 3.25 (C | P) | 5.67 (C | P) | 4.31 (C | P) | 4.40 (C | P) | 5.63 (C | P) | 4.97 (C | P) | 5.96 (C | P) | 4.60 (C | P) | 5.45 (C | P) | 2.76 (C | P) | 2.56 (C | P) | 4.70 (C | P) | 2.97 (C | P) | 3.07 (C | P) | 4.62 (C | P) | 4.00 (C | P) | 3.29 (C | P) | 4.88 (C | P) | 2.44 (C | P) | 4.47 (C | P) | 3.99 (C | P) | 4.56 (C | P) | 4.00 (C | P) |
EJ1269534 | E24a_E25a | KnownJunction | 62 (100% | 58%) | 6 | 0 | 3.50 (C | P) | 6.35 (C | P) | 5.17 (C | P) | 4.62 (C | P) | 6.31 (C | P) | 7.47 (C | P) | 6.34 (C | P) | 6.04 (C | P) | 6.71 (C | P) | 5.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.97 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 6.13 (C | P) | 5.34 (C | P) | 5.67 (C | P) | 2.05 (C | P) | 2.04 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1269535 | E24a_E26a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 11 | 0 | 6.54 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.81 (C | P) | 3.77 (C | P) | 4.28 (C | P) | 5.07 (C | P) | 4.80 (C | P) | 4.48 (C | P) | 4.85 (C | P) | 3.14 (C | P) | 7.18 (C | P) | 6.63 (C | P) | 7.02 (C | P) | 7.51 (C | P) | 6.55 (C | P) | 6.86 (C | P) | 6.59 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.88 (C | P) | 7.03 (C | P) | 7.39 (C | P) | 7.19 (C | P) |
IN29503 | I24 | Intron | 1709 (46% | 0%) | 0 | 0 | 3.20 (C | P) | 4.25 (C | P) | 3.51 (C | P) | 4.31 (C | P) | 4.82 (C | P) | 4.31 (C | P) | 4.77 (C | P) | 4.43 (C | P) | 4.51 (C | P) | 3.63 (C | P) | 3.32 (C | P) | 3.67 (C | P) | 4.72 (C | P) | 3.61 (C | P) | 2.98 (C | P) | 2.84 (C | P) | 3.12 (C | P) | 3.56 (C | P) | 3.24 (C | P) | 4.22 (C | P) | 2.97 (C | P) | 4.37 (C | P) | 3.47 (C | P) |
AIN31682 | I24_AR1 | ActiveIntronRegion | 188 (100% | 0%) | 2 | 0 | 3.30 (C | P) | 4.44 (C | P) | 3.89 (C | P) | 4.97 (C | P) | 5.30 (C | P) | 4.36 (C | P) | 4.91 (C | P) | 4.87 (C | P) | 4.89 (C | P) | 4.14 (C | P) | 3.37 (C | P) | 4.09 (C | P) | 5.08 (C | P) | 3.80 (C | P) | 3.16 (C | P) | 3.30 (C | P) | 2.76 (C | P) | 3.73 (C | P) | 3.40 (C | P) | 4.77 (C | P) | 2.67 (C | P) | 4.94 (C | P) | 4.03 (C | P) |
SIN42761 | I24_SR1 | SilentIntronRegion | 1158 (21% | 0%) | 0 | 0 | 3.36 (C | P) | 4.25 (C | P) | 2.19 (C | P) | 3.46 (C | P) | 4.27 (C | P) | 3.75 (C | P) | 4.71 (C | P) | 3.42 (C | P) | 3.87 (C | P) | 2.85 (C | P) | 2.86 (C | P) | 4.05 (C | P) | 4.79 (C | P) | 3.18 (C | P) | 3.14 (C | P) | 2.46 (C | P) | 2.30 (C | P) | 2.46 (C | P) | 2.68 (C | P) | 4.09 (C | P) | 2.63 (C | P) | 3.77 (C | P) | 2.70 (C | P) |
AIN31681 | I24_AR2 | ActiveIntronRegion | 361 (100% | 0%) | 1 | 0 | 3.03 (C | P) | 4.14 (C | P) | 3.82 (C | P) | 4.31 (C | P) | 4.84 (C | P) | 4.57 (C | P) | 4.74 (C | P) | 4.65 (C | P) | 4.64 (C | P) | 3.71 (C | P) | 3.54 (C | P) | 3.01 (C | P) | 4.45 (C | P) | 3.76 (C | P) | 2.76 (C | P) | 2.78 (C | P) | 3.61 (C | P) | 3.93 (C | P) | 3.45 (C | P) | 3.92 (C | P) | 3.28 (C | P) | 4.33 (C | P) | 3.51 (C | P) |
EJ1269537 | E25a_E26a | KnownJunction | 62 (100% | 60%) | 7 | 0 | 2.88 (C | P) | 6.47 (C | P) | 4.39 (C | P) | 5.98 (C | P) | 5.31 (C | P) | 7.11 (C | P) | 6.22 (C | P) | 6.21 (C | P) | 6.74 (C | P) | 5.89 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.89 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 6.51 (C | P) | 4.32 (C | P) | 6.52 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER52108 | ER25a | ExonRegion | 6 (100% | 100%) | 7 | 1 | 3.62 (C | P) | 7.09 (C | P) | 6.12 (C | P) | 6.47 (C | P) | 6.85 (C | P) | 8.28 (C | P) | 7.02 (C | P) | 7.10 (C | P) | 7.68 (C | P) | 6.56 (C | P) | 0.71 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.30 (C | P) | 1.39 (C | P) | 1.29 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 7.27 (C | P) | 5.74 (C | P) | 6.96 (C | P) | 2.22 (C | P) | 2.37 (C | P) | 1.30 (C | P) |
EB209103 | E26_Aa | NovelBoundary | 62 (84% | 50%) | 2 | 0 | 6.25 (C | P) | 5.19 (C | P) | 4.65 (C | P) | 3.52 (C | P) | 4.74 (C | P) | 4.52 (C | P) | 5.99 (C | P) | 5.54 (C | P) | 5.00 (C | P) | 3.56 (C | P) | 3.92 (C | P) | 3.67 (C | P) | 4.29 (C | P) | 2.63 (C | P) | 4.64 (C | P) | 2.94 (C | P) | 4.77 (C | P) | 4.26 (C | P) | 2.49 (C | P) | 4.18 (C | P) | 4.75 (C | P) | 4.97 (C | P) | 4.07 (C | P) |
ER52109 | ER26a | ExonRegion | 125 (100% | 100%) | 16 | 9 | 6.98 (C | P) | 7.45 (C | P) | 6.83 (C | P) | 7.09 (C | P) | 7.08 (C | P) | 8.39 (C | P) | 7.34 (C | P) | 7.46 (C | P) | 8.05 (C | P) | 6.96 (C | P) | 7.28 (C | P) | 7.17 (C | P) | 7.51 (C | P) | 7.73 (C | P) | 6.92 (C | P) | 7.12 (C | P) | 6.83 (C | P) | 7.81 (C | P) | 6.24 (C | P) | 6.90 (C | P) | 7.25 (C | P) | 7.54 (C | P) | 7.45 (C | P) |
EJ1269538 | E26a_E27a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 16 | 0 | 6.82 (C | P) | 7.70 (C | P) | 7.12 (C | P) | 7.40 (C | P) | 7.68 (C | P) | 9.15 (C | P) | 8.24 (C | P) | 7.80 (C | P) | 8.27 (C | P) | 7.18 (C | P) | 7.29 (C | P) | 7.28 (C | P) | 7.28 (C | P) | 7.83 (C | P) | 7.17 (C | P) | 6.99 (C | P) | 7.14 (C | P) | 7.97 (C | P) | 6.34 (C | P) | 6.88 (C | P) | 7.55 (C | P) | 7.76 (C | P) | 7.42 (C | P) |
ER52110 | ER27a | ExonRegion | 1667 (99% | 14%) | 1 | 0 | 7.04 (C | P) | 8.19 (C | P) | 6.93 (C | P) | 7.50 (C | P) | 8.08 (C | P) | 8.27 (C | P) | 7.41 (C | P) | 7.81 (C | P) | 7.94 (C | P) | 7.28 (C | P) | 6.74 (C | P) | 6.95 (C | P) | 7.84 (C | P) | 7.03 (C | P) | 7.02 (C | P) | 6.20 (C | P) | 5.83 (C | P) | 6.35 (C | P) | 5.35 (C | P) | 6.41 (C | P) | 5.81 (C | P) | 7.73 (C | P) | 6.40 (C | P) |
Figures displaying gene and feature expression levels in each library
The following figures illustrate the expression of the gene 'CLIP1' and its component features for each library. First, a simple gene model is depicted. In this model, features that are alternatively expressed in at least one comparison are marked red (see below for the actual expression levels of each feature). Next, the expression values are displayed for only the exons and known (or expressed novel) exon junctions. This first display consists of a single plot with one colored line per library (as indicated in the legend). Next, the expression of the gene relative to the distribution of all gene expression values is displayed as a histogram. In these figures (one for each library) the expression of the current gene is indicated by a dotted red line. Estimated cutoffs for background expression level corresponding to intergenic and intragenic noise are indicated by dotted black lines. The bar plots following these histograms display the expression level of all individual features. The color of the bars correspond to different feature types (enumerated as colored boxes in the legend). As in the histograms, the estimated cutoffs level for intergenic and intragenic noise are indicated as dotted lines. For genes with low expression values, these cutoffs converge to a single value. Features with significant alternative expression values are highlighted yellow in the line plot, and marked with a pink asterix below. *If you can not see the figure below, click here
Download gene data file (CLIP1): ENSG00000130779.txt