Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC090673.2 Gene 0 1.64 0.16 0.42 0.38 0.65 0.57 0.31 0.00 0.00 0.21 0.00 0.99 25.94 0.52 0.75 0.16 0.18 0.10 0.18 0.47 56.78 15.65 155.68 2 356215 Transcript 0 0.43 0.04 0.09 0.09 0.14 1.38 0.07 0.00 0.00 0.05 0.00 0.30 9.70 0.14 0.17 0.04 0.04 0.02 0.04 0.10 33.19 6.35 56.30 3 ER1a ExonRegion 0 0.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 52.14 6.24 48.55 4 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27.31 3.06 23.05 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.99 0.00 0.00 6 Ix Intron 0 0.53 0.03 0.12 0.31 0.29 0.13 0.10 0.07 0.09 0.12 0.00 0.08 20.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40.98 7.92 86.37 7 Ix_AR7 ActiveIntronRegion 0 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31.51 3.18 46.83 8 Ix_SR8 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 11.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24.44 6.80 60.76 9 Ix_AR6 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.24 0.00 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34.18 8.20 66.45 10 Ix_SR7 SilentIntronRegion 0 0.27 0.00 0.19 0.26 0.17 0.08 0.19 0.00 0.12 0.07 0.00 0.15 18.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42.18 9.05 73.63 11 Ix_AR5 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.20 0.00 0.72 0.00 0.00 0.53 0.00 0.00 0.00 17.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 71.25 11.76 90.93 12 Ix_SR6 SilentIntronRegion 0 1.14 0.00 0.17 0.33 0.81 0.09 0.06 0.36 0.02 0.32 0.00 0.17 23.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27.16 9.06 74.75 13 Ix_AR4 ActiveIntronRegion 0 0.38 0.18 0.00 0.18 0.24 0.33 0.24 0.00 0.33 0.31 0.00 0.00 25.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24.79 11.27 67.29 14 Ix_SR5 SilentIntronRegion 0 0.28 0.14 0.36 0.80 0.71 0.15 0.09 0.00 0.12 0.11 0.00 0.00 25.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 68.92 7.83 125.58 15 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 1.46 0.00 0.00 0.91 0.29 0.36 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.00 22.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 60.44 13.76 145.16 16 Ix_SR4 SilentIntronRegion 0 0.43 0.00 0.00 0.27 0.00 2.02 0.36 0.00 0.00 0.17 0.00 0.00 18.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18.17 4.08 66.56 17 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.24 0.00 0.00 0.69 0.30 0.00 0.30 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 16.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38.09 4.47 92.67 18 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39.66 5.37 87.92 19 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.82 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.25 0.00 0.00 0.00 23.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 60.39 6.58 130.02 20 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.69 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 0.00 13.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 66.67 4.75 132.03 21 E2_Aa NovelBoundary 0 3.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 83.89 8.51 115.24 22 ER2a ExonRegion 0 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 18.45 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47.80 6.40 65.62 23 E2_Da NovelBoundary 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 83.71 8.45 88.35 24 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 2.39 0.00 25 Ix Intron 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.87 5.37 54.46 26 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18.49 6.25 63.43 27 Ix Intron 0 0.31 0.00 0.17 0.27 0.11 0.02 0.16 0.10 0.05 0.23 0.00 0.00 14.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39.09 8.93 128.12 28 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43.04 9.50 55.71 29 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50.52 6.38 70.66 30 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34.93 9.45 98.70 31 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.29 0.00 0.18 0.28 0.11 0.03 0.17 0.11 0.05 0.24 0.00 0.00 14.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38.83 8.98 130.75 32 E3_Aa NovelBoundary 0 28.67 44.60 37.14 34.66 27.84 28.28 35.95 42.10 24.39 33.28 7.42 6.90 19.48 4.94 5.56 30.76 25.90 28.48 20.80 32.02 88.59 13.66 100.13 33 ER3a ExonRegion 0 1.80 0.18 0.47 0.43 0.72 0.60 0.34 0.00 0.00 0.23 0.00 1.08 28.09 0.58 0.83 0.18 0.20 0.11 0.20 0.52 57.47 16.72 167.34