Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 USP44 Gene 0 8.45 15.36 2.79 8.28 12.57 15.99 22.25 5.27 2.68 14.43 0.45 1.09 1.25 0.83 2.83 0.43 1.00 0.82 0.14 7.79 1.62 3.66 1.35 2 258499 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.24 0.95 0.00 0.49 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 393091 Transcript 0 0.00 5.85 0.00 1.27 0.13 14.15 7.57 1.28 0.00 2.96 0.00 0.00 0.00 0.00 2.70 0.00 0.00 1.37 0.00 6.98 1.91 0.01 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.48 1.90 0.00 0.97 0.00 0.00 0.01 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 0.00 1.90 0.00 0.53 0.25 3.59 2.25 0.47 0.00 1.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.00 0.00 0.55 0.00 2.07 1.16 0.03 0.00 7 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 9.80 0.00 2.00 0.00 24.70 12.90 2.09 0.00 4.46 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 2.20 0.00 11.89 2.66 0.00 0.00 8 I2_AR5 ActiveIntronRegion 0 0.12 21.69 5.99 6.13 2.68 1.02 8.61 1.82 3.71 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 0.00 1.85 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 9 I2_AR6 ActiveIntronRegion 0 8.18 35.07 6.06 12.19 7.37 3.79 15.33 4.29 4.89 4.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 1.44 0.00 3.58 0.00 0.00 0.00 10 I2_AR7 ActiveIntronRegion 0 7.72 20.81 4.18 10.74 5.04 3.67 9.27 0.31 4.07 3.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.75 1.20 0.00 6.63 0.00 0.00 0.00 11 I2_SR3 SilentIntronRegion 0 2.99 20.23 2.62 8.49 5.56 4.23 16.77 4.02 3.06 2.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.00 0.00 0.41 0.00 5.86 0.00 0.00 0.00 12 I2_AR8 ActiveIntronRegion 0 0.75 12.14 3.83 4.79 5.91 5.03 17.19 6.75 2.31 2.65 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.00 0.00 2.44 0.00 0.27 0.00 13 I2_AR9 ActiveIntronRegion 0 3.28 11.70 10.70 12.21 8.34 5.11 19.57 5.62 1.61 4.52 0.00 0.00 0.00 0.00 1.56 0.00 1.39 0.77 0.00 5.05 0.00 0.83 0.70 14 ER3a ExonRegion 0 5.51 11.37 2.55 7.67 9.03 15.14 22.88 6.19 2.96 15.81 0.51 0.73 1.50 0.92 2.75 0.61 1.91 1.32 0.11 9.00 2.37 4.22 1.90 15 E3a_E4a KnownJunction 0 3.78 19.40 3.67 6.53 23.68 5.39 39.30 0.00 3.24 8.73 4.11 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 2.35 3.12 0.00 16 ER4a ExonRegion 0 6.76 24.29 3.21 5.83 12.00 11.30 17.62 1.93 0.99 12.28 1.16 0.00 1.01 0.09 2.35 0.00 0.86 0.00 0.00 6.17 2.63 1.88 0.00 17 E4a_E5a KnownJunction 0 9.85 20.65 1.42 3.83 8.15 8.69 28.44 2.34 1.56 10.15 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.31 2.35 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 6.45 17.85 0.73 6.56 17.23 18.61 29.64 3.82 1.44 7.37 0.00 0.00 0.09 1.09 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 5.54 1.17 1.95 1.08 19 E5a_E6a KnownJunction 0 6.82 31.97 3.10 1.63 25.21 26.12 0.00 2.46 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.00 0.00 0.00 3.59 20 ER6a ExonRegion 0 12.94 21.76 3.75 8.18 11.86 17.20 16.79 3.30 3.72 15.66 0.96 0.04 2.89 0.33 4.23 0.00 0.82 1.38 0.00 7.75 1.09 1.03 2.34 21 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 15.39 5.03 6.89 0.00 16.24 33.87 0.00 3.41 11.66 0.00 0.00 0.00 0.00 13.35 0.00 0.00 0.00 0.00 5.56 0.00 0.00 0.00 22 E7_Aa NovelBoundary 0 15.48 8.95 2.96 6.26 0.00 0.00 14.31 1.85 1.36 3.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.69 0.00 0.00 0.00 23 ER7a ExonRegion 0 13.67 20.97 3.69 11.40 19.25 20.84 27.37 6.35 3.17 16.82 0.24 2.22 1.10 1.11 3.36 0.49 0.27 0.49 0.26 8.49 1.00 4.71 1.09 24 IG37_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 14.74 16.80 7.75 15.68 16.37 14.50 16.82 12.82 5.56 17.63 0.42 1.53 0.42 1.66 10.13 0.33 2.08 0.55 2.49 7.83 0.51 2.98 0.97